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《13个人体组织的单细胞RNA测序鉴定冠状病毒的细胞类型和受体》

  • 来源专题：新发突发疾病（新型冠状病毒肺炎）
  • 编译者： 蒋君
  • 发布时间：2020-04-06

  • 新冠状病毒(2019- ncov)于2019年12月在中国湖北武汉爆发，已被宣布为全球突发公共卫生事件。血管紧张素I转化酶2 (ACE2)是通过2019-nCov感染人类细胞的宿主受体。虽然据报道ACE2是表达于肺、肝、胃、回肠、肾、结肠，表达水平较低，尤其是在肺里。2019-nCoV可能使用共受体/辅助蛋白作为ACE2的合作伙伴促进病毒进入。为了识别潜在的候选者，我们研究了单细胞基因表达图谱包括13个人体组织的119个细胞类型，分析了51个已报道的RNA病毒受体和400个其他膜蛋白的单细胞共表达谱。与近期其他报道一致，我们证实了ACE2主要在肺中表达AT2、肝胆管细胞、结肠结肠细胞、食管角化细胞、回肠ECs、直肠ECs、胃上皮细胞和肾近端小管。有趣的是，我们发现候选人共受体，表现出最相似的表达模式与ACE2在13人组织都是肽酶，包括ANPEP、DPP4和ENPEP。其中，ANPEP和DPP4是已知的人类CoVs受体，提示ENPEP可能是另一种受体人类CoVs受体。我们还进行了"CellPhoneDB"分析，以了解细胞cov -靶标与周围细胞在不同组织间的相互作用。我们发现巨噬细胞经常通过趋化因子与CoVs靶细胞进行通讯吞噬信号，强调组织巨噬细胞在免疫防御中的重要性和免疫发病机制。

  • 原文来源：;https://www.biorxiv.org/content/biorxiv/early/2020/02/21/2020.02.16.951913.full.pdf
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    • 编译者：hujm
    • 发布时间：2020-02-25
    • 深圳市第三人民医院、上海市公共卫生临床中心和复旦大学生物医学研究院的科研人员在bioRxiv预印版平台发表论文“Single cell RNA sequencing of 13 human tissues identify cell types and receptors of human coronaviruses”，通过13种人体组织的单细胞RNA测序鉴定人类冠状病毒的细胞类型和受体。 文章提到，从2019年12月开始，中国湖北武汉爆发了新的冠状病毒（2019-nCoV），已宣布为全球性公共卫生突发事件。血管紧张素转换酶2（ACE2）是2019-nCov感染人类细胞的宿主受体，尽管据报道ACE2在肺、肝、胃、回肠、肾脏和结肠中表达，但其表达水平相当低，尤其是在肺中。2019-nCoV可能使用共受体/辅助蛋白作为ACE2伴侣来促进病毒进入。为了确定潜在的候选受体，科研人员探索了包括13种人类组织的119种细胞类型在内的单细胞基因表达图谱，并分析了51种报道的RNA病毒受体和400种其他膜蛋白的单细胞共表达图谱。与最近的其他报道一致，科研人员证实ACE2主要在肺AT2、肝胆管细胞、结肠细胞、食道角质形成细胞、回肠EC、直肠EC、胃上皮细胞和肾近端小管中表达。有趣的是，研究发现，候选共受体在13种人体组织中与ACE2的表达模式最为相似，都是肽酶，包括ANPEP、DPP4和ENPEP，其中ANPEP和DPP4是人类CoV的已知受体，这表明ENPEP是人类CoV的另一种潜在受体。此外科研人员还进行了“CellPhoneDB”分析，以了解CoV目标与其周围不同组织周围细胞之间的细胞串扰，发现巨噬细胞经常通过趋化因子和吞噬作用信号与CoVs靶标通讯，突显了组织巨噬细胞在免疫防御和免疫发病机制中的重要性。
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  • 《2月21日_通过13种人体组织的单细胞RNA测序鉴定人类冠状病毒的细胞类型和受体》
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    • 发布时间：2020-02-22
    • 信息名称：通过13种人体组织的单细胞RNA测序鉴定人类冠状病毒的细胞类型和受体 1.时间：2020年2月21日 2.机构或团队：深圳市第三人民医院(南方科技大学第二附属医院)，上海市公共卫生临床中心，复旦大学生物医学研究院 3.事件概要： 深圳市第三人民医院、上海市公共卫生临床中心和复旦大学生物医学研究院的科研人员在bioRxiv预印版平台发表论文“Single cell RNA sequencing of 13 human tissues identify cell types and receptors of human coronaviruses”，通过13种人体组织的单细胞RNA测序鉴定人类冠状病毒的细胞类型和受体。 文章提到，从2019年12月开始，中国湖北武汉爆发了新的冠状病毒（2019-nCoV），已宣布为全球性公共卫生突发事件。血管紧张素转换酶2（ACE2）是2019-nCov感染人类细胞的宿主受体，尽管据报道ACE2在肺、肝、胃、回肠、肾脏和结肠中表达，但其表达水平相当低，尤其是在肺中。2019-nCoV可能使用共受体/辅助蛋白作为ACE2伴侣来促进病毒进入。为了确定潜在的候选受体，科研人员探索了包括13种人类组织的119种细胞类型在内的单细胞基因表达图谱，并分析了51种报道的RNA病毒受体和400种其他膜蛋白的单细胞共表达图谱。与最近的其他报道一致，科研人员证实ACE2主要在肺AT2、肝胆管细胞、结肠细胞、食道角质形成细胞、回肠EC、直肠EC、胃上皮细胞和肾近端小管中表达。有趣的是，研究发现，候选共受体在13种人体组织中与ACE2的表达模式最为相似，都是肽酶，包括ANPEP、DPP4和ENPEP，其中ANPEP和DPP4是人类CoV的已知受体，这表明ENPEP是人类CoV的另一种潜在受体。此外科研人员还进行了“CellPhoneDB”分析，以了解CoV目标与其周围不同组织周围细胞之间的细胞串扰，发现巨噬细胞经常通过趋化因子和吞噬作用信号与CoVs靶标通讯，突显了组织巨噬细胞在免疫防御和免疫发病机制中的重要性。 *注，本文为预印本论文手稿，是未经同行评审的初步报告，其观点仅供科研同行交流，并不是结论性内容，请使用者谨慎使用. 4.附件： 原文链接： https://www.biorxiv.org/content/10.1101/2020.02.16.951913v1.full.pdf
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