《通过13种人体组织的单细胞RNA测序鉴定人类冠状病毒的细胞类型和受体》

  • 来源专题:生物安全知识资源中心 | 领域情报网
  • 编译者: hujm
  • 发布时间:2020-02-25
  • 深圳市第三人民医院、上海市公共卫生临床中心和复旦大学生物医学研究院的科研人员在bioRxiv预印版平台发表论文“Single cell RNA sequencing of 13 human tissues identify cell types and receptors of human coronaviruses”,通过13种人体组织的单细胞RNA测序鉴定人类冠状病毒的细胞类型和受体。

    文章提到,从2019年12月开始,中国湖北武汉爆发了新的冠状病毒(2019-nCoV),已宣布为全球性公共卫生突发事件。血管紧张素转换酶2(ACE2)是2019-nCov感染人类细胞的宿主受体,尽管据报道ACE2在肺、肝、胃、回肠、肾脏和结肠中表达,但其表达水平相当低,尤其是在肺中。2019-nCoV可能使用共受体/辅助蛋白作为ACE2伴侣来促进病毒进入。为了确定潜在的候选受体,科研人员探索了包括13种人类组织的119种细胞类型在内的单细胞基因表达图谱,并分析了51种报道的RNA病毒受体和400种其他膜蛋白的单细胞共表达图谱。与最近的其他报道一致,科研人员证实ACE2主要在肺AT2、肝胆管细胞、结肠细胞、食道角质形成细胞、回肠EC、直肠EC、胃上皮细胞和肾近端小管中表达。有趣的是,研究发现,候选共受体在13种人体组织中与ACE2的表达模式最为相似,都是肽酶,包括ANPEP、DPP4和ENPEP,其中ANPEP和DPP4是人类CoV的已知受体,这表明ENPEP是人类CoV的另一种潜在受体。此外科研人员还进行了“CellPhoneDB”分析,以了解CoV目标与其周围不同组织周围细胞之间的细胞串扰,发现巨噬细胞经常通过趋化因子和吞噬作用信号与CoVs靶标通讯,突显了组织巨噬细胞在免疫防御和免疫发病机制中的重要性。

  • 原文来源:https://www.biorxiv.org/content/10.1101/2020.02.16.951913v1.full.pdf
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    • 发布时间:2020-02-22
    • 信息名称:通过13种人体组织的单细胞RNA测序鉴定人类冠状病毒的细胞类型和受体 1.时间:2020年2月21日 2.机构或团队:深圳市第三人民医院(南方科技大学第二附属医院),上海市公共卫生临床中心,复旦大学生物医学研究院 3.事件概要: 深圳市第三人民医院、上海市公共卫生临床中心和复旦大学生物医学研究院的科研人员在bioRxiv预印版平台发表论文“Single cell RNA sequencing of 13 human tissues identify cell types and receptors of human coronaviruses”,通过13种人体组织的单细胞RNA测序鉴定人类冠状病毒的细胞类型和受体。 文章提到,从2019年12月开始,中国湖北武汉爆发了新的冠状病毒(2019-nCoV),已宣布为全球性公共卫生突发事件。血管紧张素转换酶2(ACE2)是2019-nCov感染人类细胞的宿主受体,尽管据报道ACE2在肺、肝、胃、回肠、肾脏和结肠中表达,但其表达水平相当低,尤其是在肺中。2019-nCoV可能使用共受体/辅助蛋白作为ACE2伴侣来促进病毒进入。为了确定潜在的候选受体,科研人员探索了包括13种人类组织的119种细胞类型在内的单细胞基因表达图谱,并分析了51种报道的RNA病毒受体和400种其他膜蛋白的单细胞共表达图谱。与最近的其他报道一致,科研人员证实ACE2主要在肺AT2、肝胆管细胞、结肠细胞、食道角质形成细胞、回肠EC、直肠EC、胃上皮细胞和肾近端小管中表达。有趣的是,研究发现,候选共受体在13种人体组织中与ACE2的表达模式最为相似,都是肽酶,包括ANPEP、DPP4和ENPEP,其中ANPEP和DPP4是人类CoV的已知受体,这表明ENPEP是人类CoV的另一种潜在受体。此外科研人员还进行了“CellPhoneDB”分析,以了解CoV目标与其周围不同组织周围细胞之间的细胞串扰,发现巨噬细胞经常通过趋化因子和吞噬作用信号与CoVs靶标通讯,突显了组织巨噬细胞在免疫防御和免疫发病机制中的重要性。 *注,本文为预印本论文手稿,是未经同行评审的初步报告,其观点仅供科研同行交流,并不是结论性内容,请使用者谨慎使用. 4.附件: 原文链接: https://www.biorxiv.org/content/10.1101/2020.02.16.951913v1.full.pdf
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    • 新冠状病毒(2019- ncov)于2019年12月在中国湖北武汉爆发,已被宣布为全球突发公共卫生事件。血管紧张素I转化酶2 (ACE2)是通过2019-nCov感染人类细胞的宿主受体。虽然据报道ACE2是表达于肺、肝、胃、回肠、肾、结肠,表达水平较低,尤其是在肺里。2019-nCoV可能使用共受体/辅助蛋白作为ACE2的合作伙伴促进病毒进入。为了识别潜在的候选者,我们研究了单细胞基因表达图谱包括13个人体组织的119个细胞类型,分析了51个已报道的RNA病毒受体和400个其他膜蛋白的单细胞共表达谱。与近期其他报道一致,我们证实了ACE2主要在肺中表达AT2、肝胆管细胞、结肠结肠细胞、食管角化细胞、回肠ECs、直肠ECs、胃上皮细胞和肾近端小管。有趣的是,我们发现候选人共受体,表现出最相似的表达模式与ACE2在13人组织都是肽酶,包括ANPEP、DPP4和ENPEP。其中,ANPEP和DPP4是已知的人类CoVs受体,提示ENPEP可能是另一种受体人类CoVs受体。我们还进行了"CellPhoneDB"分析,以了解细胞cov -靶标与周围细胞在不同组织间的相互作用。我们发现巨噬细胞经常通过趋化因子与CoVs靶细胞进行通讯吞噬信号,强调组织巨噬细胞在免疫防御中的重要性和免疫发病机制。