《多用途药草心叶青牛胆（Giloy）的基因组测序和功能分析》

• 来源专题：农业生物安全
• 编译者： 刘小燕
• 发布时间：2024-03-24

心叶青牛胆也被称为Giloy，是最重要的药用植物之一，由于产生多种次生代谢物，在人类健康中有许多治疗应用。为了深入了解心叶青牛胆的药用特性，我们使用10x Genomics的linked read和Nanopore long-read技术进行了基因组测序。心叶青牛胆的基因组草图由1.01 Gbp组成，该基因组序列来自防己科植物。我们还对心叶青牛胆进行了基因组大小估计，发现其为1.13 Gbp。对叶组织的转录组进行深度测序，利用基因组和转录组组合构建基因集，得到17245个编码基因。此外，通过利用多个物种构建全基因组系统发育树，将心叶青牛胆的系统发育位置定位为基底真双子叶植物。此外，对基因家族收缩/扩张和适应性进化的多个特征进行了全面的比较进化分析。苄基异喹啉生物碱、萜类化合物、木质素和类黄酮生物合成途径中涉及的基因具有适应性进化的特征。基因的这些进化适应为这种植物存在多种药用特性提供了基因组见解。发现与内共生相关的共同共生信号通路（丛枝菌根）中涉及的基因是适应性进化的。参与不定根形成、过氧化物酶体生物发生、植物激素生物合成以及对非生物和生物胁迫的耐受性的基因也被发现在栽蝉中具有适应性进化。