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《比较分析用于实验室检验SARS-CoV-2的引物-探针》

  • 来源专题：生物安全知识资源中心 | 领域情报网
  • 编译者： hujm
  • 发布时间：2020-03-03

  • 2月25日，bioRxiv预印平台发表了韩国化学技术研究所等的文章 “Comparative analysis of primer-probe sets for the laboratory confirmation of SARS-CoV-2”。
    2019冠状病毒病((COVID-19))是由严重急性呼吸综合征冠状病毒2型(SARS-CoV-2，也称2019- nCoV)引起的新发人类传染病。在疫情暴发后的两个月内，全世界已确认80,000多例COVID-19。由于人与人之间的传播容易发生，而且人类感染正在迅速增加，因此，灵敏且早期的诊断对预防全球暴发至关重要。最近，世界卫生组织(WHO)宣布了以前在中国、德国、香港、日本、泰国和美国开发的各种SARS-CoV-2引物和探针。在该研究中，研究人员比较了N基因的7个引物探针组和Orf1基因的3个引物探针组对SARS-CoV-2 RNA的检测能力。比较分析结果表明，美国的' 2019-nCoV_N2, N3 '和中国的' ORF1ab '分别是N和Orf1基因最灵敏的引物探针集。因此，应选择ORF1ab(中国)、2019-nCoV_N2、N3(美国)和NIID_2019-nCOV_N(日本)的适当组合，对SARS-CoV-2进行灵敏、可靠的实验室检验。
    *注，本文为预印本论文手稿，是未经同行评审的初步报告，其观点仅供科研同行交流，并不是结论性内容，请使用者谨慎使用。

  • 原文来源：https://www.biorxiv.org/content/10.1101/2020.02.25.964775v1
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    • 发布时间：2020-03-01
    • 2月27日_比较分析用于实验室检验SARS-CoV-2的引物-探针 1.时间：2020年2月27日 2.机构或团队：韩国化学技术研究所；韩国食品研究所；WELLS 生物公司；韩国毒物研究所；韩国标准与科学研究院；韩国基础科学研究所；新兴病毒感染聚合研究中心；韩国化学工业学院 3. 事件概要： 2月25日，bioRxiv预印平台发表了韩国化学技术研究所等的文章 “Comparative analysis of primer-probe sets for the laboratory confirmation of SARS-CoV-2”。 2019冠状病毒病((COVID-19))是由严重急性呼吸综合征冠状病毒2型(SARS-CoV-2，也称2019- nCoV)引起的新发人类传染病。在疫情暴发后的两个月内，全世界已确认80,000多例COVID-19。由于人与人之间的传播容易发生，而且人类感染正在迅速增加，因此，灵敏且早期的诊断对预防全球暴发至关重要。最近，世界卫生组织(WHO)宣布了以前在中国、德国、香港、日本、泰国和美国开发的各种SARS-CoV-2引物和探针。在该研究中，研究人员比较了N基因的7个引物探针组和Orf1基因的3个引物探针组对SARS-CoV-2 RNA的检测能力。比较分析结果表明，美国的' 2019-nCoV_N2, N3 '和中国的' ORF1ab '分别是N和Orf1基因最灵敏的引物探针集。因此，应选择ORF1ab(中国)、2019-nCoV_N2、N3(美国)和NIID_2019-nCOV_N(日本)的适当组合，对SARS-CoV-2进行灵敏、可靠的实验室检验。 *注，本文为预印本论文手稿，是未经同行评审的初步报告，其观点仅供科研同行交流，并不是结论性内容，请使用者谨慎使用。 4.附件： 原文链接：https://www.biorxiv.org/content/10.1101/2020.02.25.964775v1
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    • SARS-CoV-2大流行对分子微生物学实验室提出了挑战，要求它们迅速实施和验证诊断分析，并在短时间内扩大检测能力。多种分子诊断方法获得了FDA紧急使用授权（EUA），并迅速在全国范围内得到验证。一些研究报告了对这些分子分析的分析和/或临床评估，但是用于这些评估的病毒材料的差异使直接比较其分析性能变得复杂。在这项研究中，我们比较了七种常用的定性SARS-CoV-2分子检测方法的分析灵敏度（检测下限，LOD）：雅培分子实时SARS-CoV-2分析，NeuMoDx™ SARS-CoV-2分析，Roche Cobas®SARS-CoV-2分析，BD-MAX™ 系统的BD SARS-CoV-2试剂、Hologic Aptima®SARS-CoV-2分析、Xpert Xpress SARS-CoV-2测试和GenMark ePlex SARS-CoV-2测试。采用单一阳性临床标本进行比较，该样本在病毒输送介质中进行连续稀释，并通过EUA批准的SARS-CoV-2液滴数字PCR（ddPCR）进行定量分析。制备重复样品，并评估其在不同分子测定中的可重复性，每次测定重复多次。我们的数据表明，在核衣壳基因浓度为（N1=1267和N2=1392）copies/mL时，这七种检测方法可以检测到100%的重复测试。在浓度降低为1个对数时，雅培、罗氏和Xpert-Xpress分析可检测到100%的重复测试。
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