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《《自然?机器智能》发文探讨COVID-19疫情带来的数据挑战》

  • 来源专题：生物安全知识资源中心 | 领域情报网
  • 编译者： hujm
  • 发布时间：2020-04-23

  • 4月8日，《自然•机器智能》期刊发表题为“Pandemic data challenges”的社论，指出数据已成为全球抗击病毒蔓延的重要手段，可以帮助我们认识如何能减缓疫情蔓延；什么样的人群更容易感染；如何对待重症患者。
    文章指出，多家数据平台（Growdfight、Kaggle）都争先恐后的挖掘并共享COVID-19数据，学术杂志出版商也开放了COVID-19相关论文的访问。除了这些医疗服务行业外，智能手机的相关数据对了解疫情大流行具有巨大潜力，但是各国政府对于获取公民手机数据的约束程度各不相同。英国和美国政府正在与手机公司就数据访问进行谈判，但政府必须公开程序和动机，并需要保证民权。世界各地民间社会组织的联合声明警告各国政府，应对COVID-19造成的公共卫生紧急情况做出反应不会诱导侵入性数字监视新时代的到来。

  • 原文来源：https://www.nature.com/articles/s42256-020-0172-7
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相关报告

  • 《CEPI探讨快速开发COVID-19疫苗的技术平台及面临的挑战》
    • 来源专题：生物安全知识资源中心 | 领域情报网
    • 编译者：hujm
    • 发布时间：2020-04-13
    • 《新英格兰医学杂志》于3月30日出版了流行病防范创新联盟的观点文章“Developing Covid-19 Vaccines at Pandemic Speed”，介绍COVID-19的疫苗研发情况以及面临的挑战。 文章指出，H1N1疫苗经验强调了对可以很容易地适应新病原体的新颖的疫苗开发和制造平台的需求，在美国政府和其他出资者的支持下，疫苗和生物技术公司一直在对此类方法进行大量投资。美国国家过敏和传染病研究所（NIAID）发起了一项倡议，以支持平台的早期开发，并针对各种病毒家族的“原型病原体”进行测试。CEPI正在支持针对世界卫生组织（WHO）优先清单上的五种流行病原体的疫苗开发，旨在在每种疫苗完成2a期临床试验后为每种病原体开发研究用疫苗储备，以期在未来暴发时进行临床试验。CEPI还支持平台技术的开发，为“疾病X”做准备，例如COVID-19。文章称，一个理想的平台将支持在不到16周的时间内从病毒测序到临床试验的开发，证明能在病原体之间引起的一致免疫反应，并适合利用病原体未知的平台进行大规模生产。文章指出，多个平台正在开发中，具有快速开发最大潜力的平台是基于DNA和RNA的平台，其次是用于开发重组亚单位疫苗的平台。 文章列出了主要平台类型以及在每种平台上开发的SARS-CoV-2候选疫苗的研发机构及其研究状态，包括DNA、Inactivated、Live attenuated、Nonreplicating vector、Protein subunit、Replicating viral vector、RNA以及未分类等八大技术平台，其中利用Nonreplicating vector技术的CanSino Biologics和北京生物技术研究所（ChiCTR2000030906）以及利用RNA技术的Moderna/NIAID（NCT04283461）的这两种候选疫苗已经入I期试验（截至2020年3月20日）。核酸疫苗的其他1期试验预计将于4月开始。世卫组织提供了更完整和不断更新的清单[1]。 文章表示，即使使用新颖的平台，SARS-CoV-2疫苗的研发也面临挑战。第一，尽管该病毒的刺突蛋白是一种很有希望的保护性免疫原，但关于优化抗原设计的最佳方法的争论仍在继续，例如，针对全长蛋白质或仅针对受体结合结构域。第二，在合适的动物模型中进行测试以及在临床试验中进行严格的安全监控至关重要。定义一个良好的动物模型还为时过早；恒河猴、仓鼠和雪貂[未公开数据]显示出前途。第三，尽管可以从SARS和MERS疫苗的经验中推断出保护的相关性，但它们尚未建立。与自然感染一样，潜在的免疫力持续时间未知。同样，单剂量疫苗能否赋予免疫力尚不确定。 文章指出，疫苗开发是一个漫长而昂贵的过程。快速开发疫苗需要一种新的大流行范例，该范例需要在确认另一步骤的成功结果之前快速启动并并行执行许多步骤，从而导致财务风险升高。例如，对于具有人类经验的平台，I期临床试验可能能够与动物模型试验并行进行。文章指出，对于某些候选人疫苗，目前正在生产用于II期研究的其他临床试验材料。在II期试验之外迅速进行，意味着在获得大量安全性和免疫原性数据之前，需要将生产规模扩大到商业水平。建设制造能力可能需要花费数亿美元。 文章指出，在大流行期间进行临床试验带来了其他挑战。很难预测何时何地疫情会暴发并准备好与疫苗准备就绪相吻合的试验地点。此外，在高死亡率的情况下，人们可能不接受安慰剂组的随机对照试验。尽管解决这些问题的其他方法在科学上可能可行，但它们通常不那么快，而且结果难以解释。 文章表示，在大流行情况下，一旦证明候选疫苗安全有效，就必须大量生产疫苗。尽管某些高收入国家可能会考虑自己的人口来支付开发和生产费用，但没有全球性的机构负责资助或指示疫苗生产。目前CEPI正在与全球利益相关者就组织和资助大规模疫苗生产、采购和交付进行讨论。大流行将在全球范围内同时产生对疫苗的需求。一旦获得疫苗，就需要进行临床和血清学研究，以确认哪些人群仍处于最高风险中，并可能为建立全球公平的疫苗分配系统奠定基础。七国集团的一些国家已经呼吁建立这样一个全球体系，必须在疫苗开发进行的同时开始其计划。 文章指出，尽管不太可能，但如果在疫苗准备就绪之前大流行突然结束，应该继续开发最有前途的候选疫苗，做好储存以及在再次暴发时进行试验和紧急授权准备的各个环节。文章称，支持端到端开发以及大规模制造和部署，确保公平分配并保护私营部门合作伙伴免受重大财务损失的全球融资系统将是未来大流行防范的关键组成部分。 [1]World Health Organization. Draft landscape of Covid-19 candidate vaccines. March 20, 2020 (https://www.who.int/blueprint/priority-diseases/key-action/novel-coronavirus-landscape-ncov.pdf?ua=1. opens in new tab).
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  • 《迈阿密大学研究人员发文探讨COVID-19的病死率》
    • 来源专题：生物安全知识资源中心 | 领域情报网
    • 编译者：hujm
    • 发布时间：2020-04-13
    • 迈阿密大学数学系的科研人员在the Lancet发表文章“Likelihood of survival of coronavirus disease 2019”，分析讨论了COVID-19的病死率。 文章指出，实时估计COVID-19流行期间的病死率非常具有挑战性，但是该比率是非常重要的数据，将有助于指导全球各地政府和公共卫生当局的应对措施。这种疾病给武汉市以及伊朗，意大利和其他国家的公共卫生和医疗系统带来了巨大的压力和灾难性的后果。但是，COVID-19的病死率的当前估计值取决于所检查的数据集和时间段。来自中国的近1100名患者的研究表明，病死率为1-4％。中国疾病预防控制中心（CDC）的一份报告显示，在中国44到672例确诊病例中，估计总体病死率的比例为2.3％，并指出该比例在暴发的不同阶段因传播的位置和传播强度而异（例如湖北为2.9％，而中国其他地区为0.4％，12月31日之前为4％，1月1日至10日为15.6％，1月11日至20日为5.7％，1月21日至31日为1.9％，2月1日之后为0.8％），以及性别差异（男性为2.8％，女性为1.7％）。此外，中国疾病预防控制中心报告说，病死率会随着年龄的增加而增加（从11-19岁的人的0.2％，到≥80岁的人的14.8％），并且根据存在合并症的不同而有所差异（心血管疾病10.5％，糖尿病7.3％，高血压6.0％，慢性呼吸道疾病6.3％和癌症5.6％）。根据中国55924例实验室确诊的病例，世卫组织-中国COVID-19联合调查团提供了类似的数据，报告的病死率为3.8％。 在The Lancet Infectious Diseases中，Robert Verity及其同事提供了COVID-19病死率的估计值。作者认为，仅将死亡人数除以病例数就可以得出粗略的病死率，这可能会产生误导，因为一个人出现症状与发现并报告该病之间可能需要2到3周的时间，并且对新病毒的监视倾向于检测严重病例，尤其是在测试能力较低的爆发初期。通过使用来自中国大陆的个案数据（3665例）和在中国大陆以外发现的1334例病例，假设按年龄划分的发病率保持恒定，并根据人口统计学以及基于年龄和基于位置的不确定性进行调整，Verity及其同事估计从症状发作到死亡的平均持续时间为17.8天，从症状发作到出院的平均持续时间为24.7天。研究结果估计中国的总病例死亡率为1.38％，并且随着年龄的增长而增加 由于所实施的预防、控制和缓解政策的差异，并且由于病死率在很大程度上受到医疗保健准备和可用性的影响，因此各国之间的病死率估计值可能会略有不同。早期研究表明，延迟检测出感染病例不仅增加了将病毒传播给其他人（最有可能的家庭成员、同事和朋友）的可能性，而且在某些情况下还使感染恶化，从而增加了病死率。 文中比较了不同年龄组中SARS、COVID-19和季节性流感的病死率。即使年轻人的死亡率很低，但很明显，任何暗示COVID-19就像流感一样的说法都是错误的：即使对于20-29岁的人，一旦感染了SARS-CoV-2，其死亡率是季节性流感的33倍；对于60岁以上的人群，在没有合并症的情况下，SARS-CoV-2感染后的存活机会约为95％；但是，如果患者患有潜在的健康状况，则存活的机会将大大减少，并且随着年龄的增长超过60岁将继续降低。 尽管中国现在似乎已经走出困境，但许多其他国家也面临着COVID-19大流行的巨大压力。在中国实行的早期发现、早期诊断、早期隔离和早期治疗策略不仅可能有助于控制疾病暴发，而且有助于降低疾病的病死率。
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