北京大学等于2020年3月3日在National Science Review上发表题为“On the origin and continuing evolution of SARS-CoV-2”的文章,研究了SARS-CoV-2与其他相关冠状病毒之间的分子差异程度。
文章指出，尽管他们发现SARS-CoV-2与蝙蝠SARS相关冠状病毒（SARSr-CoV; RaTG13）之间仅4％的基因组核苷酸有差异，但中性位点有17％的差异，表明这两种病毒之间的差异要比以前估计的大得多。作者指出，SARS-CoV-2和穿山甲SARSr-CoVs病毒中刺突蛋白受体结合域（RBD）功能位点的新变异，除了重组外，还可能是由突变和自然选择引起的。研究人员对103个SARS-CoV-2基因组进行的群体遗传学分析表明，这些病毒进化成两种主要类型（命名为L和S），它们显示了迄今为止测序的病毒株之间都相关。虽然L型（?70％）比S型（?30％）更为普遍，但S型是原始版本。虽然L型在武汉暴发的早期阶段更为普遍，但在2020年1月初之后，L型的出现频率有所下降。人类的干预可能对L型施加了更严重的选择压力，L型可能更具侵略性，传播速度更快。另一方面，S型的进化年龄更大，攻击性更弱，可能由于相对较弱的选择压力而增加了相对的出现频率。作者总结，这些发现有力地支持迫切需要对COVID-19患者的临床症状结合基因组数据、流行病学数据和图表记录进行进一步的、即时的、全面的研究。
