《12月9日_SARS-CoV-2和反冠状病毒宿主因子网络的全基因组鉴定》

  • 来源专题:COVID-19科研动态监测
  • 编译者: zhangmin
  • 发布时间:2020-12-23
  • 洛克菲勒大学的研究人员12月9日在期刊Celll上在线发表了题为“Genome-scale identification of SARS-CoV-2 and pan-coronavirus host factor networks”的文章。研究人员对SARS-CoV-2和其他冠状病毒生命周期中的细胞宿主因子和途径仍然不清楚。为了解决问题,研究人员对SARS-CoV-2和三种季节性冠状病毒(HCoV-OC43,HCoV-NL63和HCoV-229E)进行了基因组规模的CRISPR基因敲除筛选。这些筛选发现了具有泛冠状病毒和病毒特异性功能作用的宿主因素和途径,包括对糖胺聚糖生物合成、SREBP信号传导、BMP信号传导和糖基磷脂酰肌醇生物合成以及对几种特征不太明显的蛋白质的需求。研究人员确定了SARS-CoV-2和三种季节性冠状病毒感染对含有VTT结构域的蛋白TMEM41B十分需要。文章称,这种人类冠状病毒宿主因子网络为针对急性COVID-19和未来可能发生的冠状病毒大流行制定新的治疗策略提供了丰富的资源。
    原文链接:https://www.cell.com/cell/fulltext/S0092-8674(20)31676-7#%20

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    • Cell期刊于12月8日发表了美国陈·扎克伯格生物中心的文章“Genetic screens identify host factors for SARS-CoV-2 and common cold coronaviruses”,文章描述了遗传筛选确定了SARS-CoV-2和普通感冒冠状病毒的宿主因子。 文章称,冠状病毒科是导致人类疾病的病毒家族,范围从轻度呼吸道感染到可能致命的急性呼吸窘迫综合征。发现多种冠状病毒的共同宿主因子可以有助于控制当前和未来冠状病毒大流行的发展。该研究对感染SARS-CoV-2和两种季节性普通感冒冠状病毒OC43和229E的细胞进行了全基因组CRISPR筛查。这种方法正确地识别了独特的病毒进入因子ACE2(SARS-CoV-2)、氨肽酶N(229E)和糖胺聚糖(OC43)。此外,该研究确定磷脂酰肌醇磷酸酯的生物合成和胆固醇稳态是支持这三种冠状病毒感染的关键宿主途径。相比之下,溶酶体蛋白TMEM106B似乎是SARS-CoV-2感染所特有的。磷脂酰肌醇激酶和胆固醇稳态的药理抑制作用降低了三种冠状病毒的复制。这些发现为了解冠状病毒的生命周期和开发针对宿主的疗法提供了重要的见解。 来源:https://www.cell.com/cell/fulltext/S0092-8674(20)31626-3
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    • 编译者:zhangmin
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    • cell期刊10月20日发布了美国耶鲁大学医学院Jin Wei等人发表的文章“Genome-wide CRISPR screens reveal host factors critical for SARS-CoV-2 infection”,通过全基因组CRISPR筛查,揭示了对SARS-CoV-2感染至关重要的宿主因子。 文章称,鉴定对SARS-CoV-2感染至关重要的宿主基因可能揭示新的治疗靶点,并有助于了解COVID-19的发病机理。在该研究中,该团队在表达SARS-CoV-1刺突的SARS-CoV-2、MERS-CoV、蝙蝠冠状病毒HKU5以及表达SARS-CoV-2刺突的水泡性口炎病毒(VSV)感染的Vero-E6细胞中进行了全基因组CRISPR筛选。该团队鉴定了已知的SARS-CoV-2宿主因子,包括受体血管紧张素转化酶2(ACE2)和蛋白水解酶组织蛋白酶L。该团队还发现了包括SARS谱系和泛冠状病毒特异性的高迁移率族蛋白B1(HMGB1)和SWI/SNF染色质重塑复合物的前病毒基因和途径。该研究显示HMGB1调节ACE2表达,对于SARS-CoV-2、SARS-CoV-1和NL63的病毒入侵至关重要。该研究还显示,已鉴定的基因产物的小分子拮抗剂抑制了猴子和人类细胞中的SARS-CoV-2感染,从而证明了这些基因突变在物种间的保守作用。文章称,这些结果共同确定了SARS-CoV-2的可能的治疗靶标,并揭示了SARS谱系和泛冠状病毒特异性宿主因子,这些因子可调节对高致病性冠状病毒的敏感性。 原文链接:https://www.cell.com/cell/fulltext/S0092-8674(20)31392-1