《开发通用流感疫苗的计算方法和挑战。》

  • 来源专题:实验室生物安全
  • 编译者: 苑晓梅
  • 发布时间:2019-11-27
  • 针对快速发展的病原体(例如甲型流感病毒)的有效疫苗的传统设计未能提供广谱和持久的保护。凭借低成本的全基因组测序技术和强大的计算能力,新颖的计算方法证明了促进通用流感疫苗设计的潜力。但是,很少有研究将计算优化集成到新疫苗的设计和发现中。在可以大规模实施这些方法之前,必须了解计算疫苗设计的潜力。这篇综述总结了当前发展中的一些有前途的计算方法,包括在计算上优化了具有共有序列的广泛反应性抗原,基于系统发育模型的祖先序列重建,以及使用免疫组学来计算保守的交叉反应性T细胞表位。病毒宿主环境之间的相互作用决定了流感人群的进化能力。我们建议,随着允许集成数据源(例如蛋白质结构建模,宿主抗体库分析和高级系统动力学建模)的新技术的发展,计算方法对于开发持久的通用流感疫苗至关重要。综上所述,计算方法是开发具有持久性和广泛保护性的通用流感疫苗的强大而有前途的工具。

  • 原文来源:https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/31141933
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    • 公共流感对通用流感疫苗(UIV)的需求尚未得到满足,以提供针对流感病毒感染的广泛而持久的保护。针对流感病毒靶标的广泛保护性抗体和交叉反应性T细胞的鉴定为UIV的发展提供了有希望的前景。已经在茎和血凝素(HA)的头部确定了交叉保护的多个靶标,以开发出UIV。近来,神经氨酸酶(NA)作为增加保护范围的关键成分而受到广泛关注。基于HA茎的方法在动物研究中显示出更广泛的保护的前景可观的结果,其在人体中的可行性正在临床试验中进行评估。减毒活流感疫苗(LAIV)固有的跨甲型和乙型流感病毒的粘膜免疫反应和交叉反应性T细胞免疫已成为纳入UIV的基本特征。为了弥补单机方法的不足,目前正在对结合HA杆和LAIV的初次加强免疫接种进行临床评估,以提高疗效并扩大保护范围。通过预先暴露于流感病毒而建立的人类现有免疫力可能会影响流感疫苗引起的免疫反应的层次和强度,从而限制了对基于幼稚动物的临床前数据的解释,因此需要进行人类挑战性研究。在定义“通用”疫苗的保护范围,功效,目标人群和保护期限方面尚待达成共识。这篇综述讨论了UIV开发的最新进展,交叉保护和疫苗设计背后的原理,以及在获得平衡的保护效力,广泛的保护以及与UIV相关的安全性方面面临的挑战。
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    • 2019年12月28日讯/生物谷BIOON/---每年我们都被提醒要去药房进行流感疫苗接种。为何我们不能像麻疹疫苗或脊髓灰质炎疫苗那样拥有能提供长期保护的流感疫苗?这是因为流感病毒持续进化,因此我们第一年建立的免疫反应可能在第二年甚至在当年感染的流感病毒上都无法起作用。结果就是流感病毒仍然很危险:去年,仅在美国,它就造成了6万多人死亡。 在一项新的研究中,来自美国洛克菲勒大学的研究人员揭示了为何制造一种能够预防所有类型流感病毒的通用疫苗如此困难的原因:免疫系统对新流感病毒变种的免疫反应是从头开始建立的,主要是利用对这种病毒没有记忆的免疫细胞建立的,而不是改善对之前的流感病毒版本的免疫记忆。相关研究结果近期发表在Cell期刊上,论文标题为“Restricted Clonality and Limited Germinal Center Reentry Characterize Memory B Cell Reactivation by Boosting”。 论文通信作者、洛克菲勒大学助理教授Gabriel D. Victora说,“如果我们能弄清楚如何帮助免疫系统在已有知识的基础上持续建立免疫记忆,我们就可以为流感病毒、HIV、丙型肝炎病毒等高度进化的病毒开发出更好的疫苗。” 受阻的免疫记忆 Victora和他的团队探究了在第一次和第二次暴露于流感疫苗的小鼠中的免疫细胞行为。具体来说,他们研究了释放抗体的白细胞---B细胞。抗体作出的反应是攻击病毒等入侵者或者对它们进行标记以便它们遭受其他细胞攻击。在感染或免疫接种过程中,B细胞进入淋巴结中的生发中心,在那里,它们发生多次突变直到它们能够靶向新的入侵者。 Victora说,“生发中心就像一个训练营。B细胞进入生发中心时性能较差,它们离开生发中心时具有非常好的性能,从而释放出更好的与它们的靶标更紧密结合的抗体。” 这些性能非常好的B细胞是免疫系统中的细胞记忆,可以释放结合到入侵病毒的一部分上的抗体。在理想情况下,这些B细胞会在身体下次遇到病毒或疫苗时返回生发中心,并进化出更复杂的抗体来更好地靶向稍有不同的病毒版本,最终能够产生所谓的病毒无法逃避的广泛中和抗体。这就是人们制造通用疫苗所需要的。 Victora说,“我们的想法是,通过反复接种疫苗,你可以不断将记忆细胞召回到生发中心,以便使得它们经历多次进化,直到它们成为超级B细胞为止,这正是提供通用流感疫苗或HIV疫苗所需的。”但是,这些研究人员没有观察到B细胞返回到生发中心,而是发现了一些不同的东西。 他们在第一次接种疫苗时利用荧光染料对小鼠的生发中心进行遗传标记,因此他们可以在第二次接种疫苗时追踪它们的后代的行为。令他们吃惊的是,第二次接种疫苗时进入生发中心的B细胞中有90%以上是未标记的,这表明它们是新来者。遗传分析还显示,这些细胞没有经历生发中心中的B细胞通常经历的突变过程,这进一步表明它们是首次出现在这个部位。 但是,新手训练营的退伍军人大多不存在。第一次疫苗接种时进入生发中心的数百种B细胞中,只有少数能够在第二次疫苗接种时返回到生发中心,不过它们中的多数能够结合入侵的病毒。似乎只有选定的少数B细胞才会在第二次疫苗接种时返回到生发中心。 如果进一步的研究表明,这些发现在人类中也是如此,那么将会对疫苗设计带来影响。为了获得强大的B细胞,科学家们需要了解是什么阻止了这些细胞返回训练营。Victora说,“如果我们能够理解不允许这些细胞重新进入的瓶颈,那么这可能有助于我们找到一种方法来规避它们,从而使得重复接种的方法更容易起作用。”这将使得这些细胞有机会经历它们需要进行的许多轮突变,从而获得靶向诸如流感病毒或HIV之类的病毒的所有变体的抗体。(生物谷 Bioon.com)