3月4日_2019新型冠状病毒正在进行活跃的遗传重组
1.时间:2020年3月4日
2.机构或团队:南方科技大学
3.事件概要:
2020年3月4日,Clinical Infectious Diseases杂志出版了南方科技大学团队的文章“2019 novel coronavirus is undergoing active recombination”。
研究人员收集了GISAID(https://www.GISAID.org)中所有公开的84个2019-nCoV基因组信息,并将有相同单核苷酸变异(SNVs)的基因组归为一个单倍型,构建了单倍型网络图。根据2019-nCoV单倍型网络图分析结果,hap_011单倍型具有明显特征:一、网络图呈星形,并集中在hap_011单倍型;二、hap_011单倍型有最多的样本量且大多数样本来自暴发地湖北省;第三,大多数卫星单倍型也同样来自湖北;第四,hap_011单倍型的平均收集日期最早。进一步研究表明,所有的单倍型都来源于hap_011单倍型,并发现有五个单倍型(hap_009,hap_017,hap_023,hap_048和hap_050)形成了环状回路。这表明2019-nCoV发生了遗传重组,并存在重组体。作者指出该研究为2019-nCoV的遗传重组提供了首个证据,这是2019-nCoV除了自身突变外的一种新的进化方式。研究成果也对2019-nCoV肺炎的药物治疗和预防二次传播提供了帮助,并提示传染病医生和疾病控制专家团体应该对2019-nCoV的遗传重组及其潜在影响引起重视。
4.附件:
原文链接:https://academic.oup.com/cid/advance-article/doi/10.1093/cid/ciaa219/5781085?searchresult=1