CiBER-seq新技术同时分析数百个基因
2020年12月11日Science报道，美国加州大学的研究者基于CRISPR和深度测序技术开发了一种可以同时检测细胞中数百个基因表达的技术，称为CRISPR干扰条形码表达报告基因测序（CRISPR interference with barcoded expression reporter sequencing，CiBER-seq）。
CRISPR-Cas9技术可以很容易地敲除或调整单个基因的表达，从而确定特定基因对有机体或细胞的影响，结合荧光报告基因可以明确特定基因对另一个基因的影响。然而，生物体的基因数量庞大，要调整每个基因并明确对荧光报告基因的影响是一项庞大工程。
为了解决了这个问题，加州大学的研究人员开发了CiBER-seq技术，让数万个CRISPR实验合并在一起，同时进行实验。该技术摒弃了荧光，采用深度测序的方式，直接测量合并样本（pooled sample）中基因活性的增加或减少。深度测序采用高通量、长读的新一代测序技术，对合并样本中表达的所有基因进行测序和基本计数。利用CiBER-seq技术，可以快速确定基因组中所有调控特定基因表达的DNA序列，极大缩短了基因分析的时间。
研究者表示，CiBER-seq可以实现多达100个基因的同时研究。该技术可用于遗传网络追踪，有助于快速找到控制疾病基因的调控序列以及找到新的药物靶点。
吴晓燕 编译自https://phys.org/news/2020-12-crispr-technique-easy-genetic-networks.html
原文链接：https://science.sciencemag.org/content/370/6522/eabb9662
原文标题：CiBER-seq dissects genetic networks by quantitative CRISPRi profiling of expression phenotypes
