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《欧洲实验室是否准备好检测COVID-19？》

  • 来源专题：动植物疫病
  • 编译者： 刘小燕
  • 发布时间：2020-02-26

  • 对欧盟欧洲经济区实验室准备检测严重急性呼吸系统综合症冠状病毒2（SARS-CoV-2）的初步评估表明，欧洲专业实验室网络快速实施了分子诊断。2020年1月，对实验室进行了一项调查，以评估SARS-CoV-2（之前是2019-nCoV）诊断的能力和质量以及实施障碍。欧洲监测（Eurosurveillance）发布的一项研究考虑了30个欧盟欧洲经济区国家中47个实验室提供的数据。要求实验室指出其每周进行SARS-CoV-2分子检测的能力。在47个参与的实验室中，有38个实验室表明每周至少进行8275次测试，另外还有8个实验室正在实施分子诊断，因此每周至少额外增加875次测试。此外，调查表明实验室非常愿意提供国际诊断支持并共享序列，从而有助于监测病毒的进化和痕量传播链。测试实施的主要挑战是最初缺乏积极的控制，缺少人员和时间，以及缺少引物和探针。

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  • 《COVID-19: 整个欧洲的病例在增加》
    • 来源专题：动植物疫病
    • 编译者：刘小燕
    • 发布时间：2020-10-30
    •  根据最新的COVID-19数据，欧盟和英国的14天病例通报率持续上升超过50天，目前有超过一半的欧盟国家的病例呈现上升趋势。虽然增加检测有助于更好地了解所有正在发生的传播，但这不是COVID-19病例增加的唯一原因，还与放松身体距离和其他预防措施有关。随着学校的重新开放和举行更多的室内活动，病例的增加提醒人们流行病尚未结束。每个人都可以通过观察简单的预防措施来预防疾病的进一步传播，其中包括：（1）加强手部卫生；（2）适当的咳嗽和呼吸礼仪；（3）适当使用口罩；（4）即使是轻度疾病也要待在家里；（5）保持物理距离。最近的证据证实了身体距离对于预防人际传播的重要性，事实证明，距离至少一米的物理距离可以确保将传播风险降低五倍，并且每增加一米的距离就会提供两倍的保护效果。疾病预防和控制中心（ECDC）建议最大程度地进行测试，以期对所有症状性病例提供及时的检测。除了快速跟踪相关人员之外，大规模测试是控制总体内部传播的关键，其次是隔离和处理已确诊的病例，并隔离相关联系人员。此外，随着流感季节的临近，整个欧洲医疗体系的准备至关重要。这包括基本服务、初级保健设施和医院，以确保在对呼吸窘迫患者的护理需求很高的情况下，制定适当的急救计划。
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  • 《Broad研究所的clia认证检测中心开始处理COVID-19患者样本;被命名为马萨诸塞州参考实验室》
    • 来源专题：人类遗传资源和特殊生物资源流失
    • 编译者：yanyf@mail.las.ac.cn
    • 发布时间：2020-03-31
    • 医疗服务提供者:有关如何准备和直接将样本发送到Broad Institute临床研究测序平台进行处理的详细说明，请点击此处。 与马萨诸塞州联邦、马萨诸塞州公共卫生实验室和地区医院合作，由麻省理工学院和哈佛大学布罗德研究所(Broad Institute of MIT)认证的实验室已经开始处理来自新英格兰地区患者的COVID-19测试样本。实验室在收到样本后24小时内将第一批结果返回给医生。由于测试中心的团队应用了额外的自动化，测试将花费大约12个小时来完成。 通过改造现有的用于处理临床样本进行基因组分析的设施，布罗德研究所迅速扩大了测试中心的规模，以创造每天处理约2000个COVID-19测试的能力。这是一项更大努力的一部分，包括通过贝克-波利托政府的COVID-19反应指挥中心，建立跨越政府、学术界和私营部门的伙伴关系，以便在当前的COVID-19大流行期间迅速提高检测和支持患者的能力。 临床研究测序平台有限责任公司(CRSP)是布罗德研究所的子公司。通过了clia认证和CAP(美国病理学家学院)认证，它可以将数据返回给医生用于诊断、患者护理和临床试验。它是高度自动化的，所以它可以处理大量的样品。该实验室被授权处理在医院和其他临床环境中收集的样本，然后安全地将结果返回给医生。该实验室已经完成了fda开发的检测验证方案。 3月24日星期二，CRSP开始接收和处理来自地区医院和诊所的检测包。随着测试在整个地区的扩展，套件的数量预计会增加。 “在过去的两个星期,许多人在广泛的聚在一起在一个非凡的努力做通常需要几个月:适应临床诊断测试和验证,创建新的进程,甚至建立新的房间在我们的实验室能够帮助提高COVID-19测试,”斯泰西Gabriel表示,研究所科学家和高级主管广泛的基因组平台。 广泛与马萨诸塞州公共卫生部密切合作,马萨诸塞州综合医院的病理部门布莱根妇女医院和其他地区医院和医院网络把CRSP的高通量基因组功能处理的英联邦,使增加COVID-19诊断测试的能力。 Broad公司利用现有设施处理COVID-19患者样本，并在大范围内准确执行现有CDC RT-qPCR COVID-19诊断试验。这包括重新配置现有设施，加强对技术人员的培训，为他们购买新的防护装备，以及建立额外的防护、安全和清洁程序，以保证团队成员的安全。 COVID-19诊断检测设施与Broad的基因组学平台相连。2013年，该平台启动了一项工作，为医疗和临床研究提供高质量、经过验证的临床测序，并使用先进的机器人进行大规模测序。 “布罗德研究所和世界各地的科学家正在迅速而密切地合作，以帮助理解和克服COVID-19，”布罗德研究所所长兼创始主任埃里克·兰德说。“我们也很自豪能够通过帮助加快诊断速度，直接为患者护理做出贡献。与许多合作伙伴以极快的速度合作，提供急需的支持，这是一件很棒的事。” “这里的重点一直是应用流体处理自动化和其他机器人技术，使我们能够在更高的规模和更高的产量上工作，”研究所科学家、布罗德基因组学平台的转化基因组学和产品开发高级主任尼尔·列侬(Niall Lennon)说。“我们已经重新利用所有的知识和设备，以同样的方式处理用于COVID-19测试的样品。” 即使诊断设备已经扩大，布罗德研究所已经转移到一个主要的远程劳动力，只有大约10%的布罗德社区在现场工作。总的来说，大约有40人专门从事诊断工作，他们组成的团队允许该设施24小时运行。这个团队已经收到了很多志愿者的帮助，但是现在已经有足够的人手了。 布罗德研究所并不直接从病人身上采集样本。寻求检测的公众成员应该打电话给他们的卫生保健提供者。 临床研究测序平台有限责任公司(CRSP)是美国布罗德研究所(Broad Institute)的子公司，是经过认证的CLIA实验室。
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