牛津纳米孔技术公司开创了一种新的DNA分析技术称为纳米孔测序,对微通道一直保密的核心产品。但在Illumina测序公司紧接着的专利侵权诉讼, 该公司透露,将推动其最新的设备细菌毛孔，似乎规避Illumina公司面临的挑战。
纳米孔测序,誉为比以前的方法更方便和负担得起的DNA分析方法，通过测量电流的变化作为单个核苷酸通过孔隙比DNA本身。牛津纳米孔,2014年推出的第一个商业纳米孔测序器,一个叫做MinION的手持设备。尽管研究者们赞扬了技术,努力提高其准确性,他们只能猜测MinION如何在Illumina公司和其他人失败的地方取得了胜利; MinION的孔隙的结构仍然是一个商业机密。提起诉讼2月23日,Illumina公司怀疑牛津纳米孔用bacteria-derived孔隙称为分枝杆菌smegmatis孔蛋白(Msp)。Illumina公司许可专利Msp系统从华盛顿大学西雅图和阿拉巴马大学,伯明翰,声称牛津纳米孔测序侵犯专利。
诉讼之际, 对一些研究人员来说是痛苦的消息,他们担心他们可能会失去公司的纳米孔的产品,或者战斗会扼杀新平台的发展。“如果Illumina公司发布了一个平台我喜欢它。相反他们在做的是发布一个诉讼,” 巴尔的摩的约翰霍普金斯大学生物医学工程师温斯顿Timp说,马里兰州的实验室也许可专利牛津纳米孔。
网络直播演讲的公司可能会使许多客户有这些担忧。牛津纳米孔的首席技术官克莱夫·布朗宣布升级设备新孔,该公司一直在描述演示R9机型。布朗透露,R9机型CsgG,膜蛋白来源于大肠杆菌,但存在于许多细菌物种。
CsgG是时间相对较晚的阵容纳米孔的候选人。分子生物学家汉Remaut领导的研究小组在比利时的弗兰德斯生物技术研究所,CsgG的结构和在2014年出版。测序的米孔似乎很有希望,因为它有一个非常狭窄的和良好定义的通道DNA链,Remaut说。许多其他的米孔被探索,包括Msp、锥形窄点更多逐渐在更长的距离,他解释说。允许更多的孔隙和DNA链之间的相互作用,可以降低对测序的电信号。
牛津纳米孔也直接回应Illumina公司。在3月8日致信美国国际贸易委员会,该公司否认了所有的指控侵权,并声称Illumina公司是作用于“未经证实的猜测”阻止牛津纳米孔产品和维护自己的垄断传统DNA测序。Illumina公司从来没有证明它能够使自己的纳米孔测序仪工作,信中称,从市场和消除牛津纳米孔技术作为Illumina公司请求可能损害公共卫生研究成果如埃博拉的跟踪和Zika病毒。
