背景：木瓜蛋白酶样蛋白酶（PL（pro））是处理冠状病毒多蛋白以及抑制病毒宿主免疫的重要酶。以往的研究表明，通过对PL（pro）的分子分析，可以看出病毒PL（pro）的催化活性及其与泛素的相互作用。方法：采用序列比较、分子模型和蛋白质相互作用图谱，比较SARS-CoV-2、SARS-CoV和MERS-CoV三种致死性CoV流行的PL（pro）。结果：SARS-CoV-2pl（pro）与SARS-CoV-2pl（pro）的同源性分别为82.59%和30.06%。与SARS-CoV-PL（pro）相比，在SARS-CoV-2中，PL（pro）具有C111、H278和D293三个保守的催化三位一体，极性界面残基和氢键数量稍少，埋藏界面尺寸较大，与泛素和PL（pro）相互作用的残基数量较少。这些特征可能与SARS-CoV-2pl（pro）的脱蛋白活性相似或略低。然而，与MERS-CoV相比，它的水平要高得多，MERS-CoV含有氨基酸突变和极性界面数量较少。结论：SARS-CoV-2pl（pro）和SARS-CoV-PL（pro）具有相同的催化位点、界面区组成和极性，表明脱氮活性具有普遍的相似性。与MERS-CoV相比，SARS-CoV-2与泛素结合的可能性更大。这些估计参数有助于了解新病毒如何与免疫系统相互作用的知识缺口。
