Scientific Reports于7月27日发表了日本筑波大学的文章“Identification of key interactions between SARS-CoV-2 main protease and inhibitor drug candidates”。文章指出,先前有报道称肽样抗HIV-1药物对SARS-CoV Main蛋白酶(Mpro)有效。由于SARS-CoV和SARS-CoV-2的主要蛋白酶具有许多相同的结构和功能特征。因此,这些药物也被认为是靶向SARS-CoV-2 Mpro的潜在候选药物。但是,SARS-CoV-2 Mpro在原子水平上的作用机理尚不清楚。在该研究中,研究人员通过进行药效基团建模和1 μs分子动力学(MD)模拟,揭示了SARS-CoV-2 Mpro与三种候选药物之间的关键相互作用。 His41、Gly143和Glu166与所有MD模拟中的肽样抑制剂中常见的官能团形成相互作用。这些相互作用是针对SARS-CoV-2 Mpro的潜在药物的重要靶标。
原文链接:https://www.nature.com/articles/s41598-020-69337-9