当前武汉市病毒性肺炎的暴发是由世界卫生组织命名为2019-nCoV的新型冠状病毒引起的,该病毒是通过对病毒RNA基因组测序确定的。在华南海产品批发市场,许多最初的患者接触到野生动物,那里还出售家禽,蛇,蝙蝠和其他农场动物。为了调查可能的病毒库,我们基于2019-nCoV序列,结合不同动物物种之间的相对同义密码子使用(RSCU)偏向进行了全面的序列分析和比较。从我们的分析中获得的结果表明,2019-nCoV可能是蝙蝠冠状病毒与未知来源的冠状病毒之间的重组病毒。重组可能在识别细胞表面受体的病毒突波糖蛋白内发生。此外,我们的发现表明2019-nCoV与蝙蝠冠状病毒具有最相似的遗传信息,而与蛇具有最相似的密码子使用偏倚。两者合计,我们的结果表明可能发生同源重组,并有助于2019-nCoV跨物种传播。