《纽约的白尾鹿都感染奥密克戎了,可能还是“突破性感染”...》

  • 来源专题:生物安全知识资源中心—领域情报网
  • 编译者: hujm
  • 发布时间:2022-02-20
  • 发表在预印本服务器bioRxiv上的一项新研究(未经同行评议)中,来自美国宾夕法尼亚州立大学领导的研究团队在纽约的白尾鹿种群中发现高度传染性的奥密克戎变异毒株。

    近日,发表在《Nature》上的一项研究报道,科学家在美国俄亥俄州的野生白尾鹿(Odocoileus virginianus)中发现了至少三种新冠病毒变异毒株,提示该物种可能是新冠病毒的潜在“蓄水池”。这意味着,新冠病毒可以在野生白尾鹿体内长期生存,为其进一步化并有可能传播给人类开辟了新的途径。

    近半年来,美国和加拿大多地都报道了白尾鹿感染新冠病毒的案例,这表明,这种北美野生动物极易受到新冠病毒的感染。

    在这项新研究中,研究人员在2021年12月12日至2022年1月31日期间,从纽约市斯塔滕岛的131只白尾鹿采集了鼻咽拭子样本。

    他们发现其中19头鹿的血清抗体检测呈阳性,这表明动物之前已感染过新冠病毒。更重要的是,在其中7头鹿的鼻咽拭子中检测出奥密克戎变异毒株。

    系统发育分析显示,白尾鹿感染的奥密克戎序列与最近从纽约市和其他地方感染病毒的人类样本中的奥密克戎序列一致。这表明,是人类将奥密克戎传染给了白尾鹿,然后在鹿群间继续传播。

    值得一提的是,研究人员发现一头鹿的病毒RNA呈阳性,并且具有高水平的中和抗体,表明它在持续感染期间快速血清学转化,或者是先前感染过新冠病毒的动物发生突破性感染。

    尽管目前尚无证据证明白尾鹿携带的病毒会传染给人类,但这项研究进一步引发了科学家们的担忧。

    该研究通讯作者、宾夕法尼亚州立大学病毒学教授Suresh Kuchipudi说:“我们首次证明了奥密克戎变异毒株已扩散到野生动物物种中,后续还将发生什么是相当令人担忧的。”

    宾夕法尼亚州立大学的兽医微生物学家Vivek Kapur说:"病毒在白尾鹿种群间的传播为其提供了适应性和进化的机会,而且很可能在未来这些病毒会跳到人类中。"

    当地时间2月8日,美国农业部动植物卫生检验局发言人Lyndsay Cole表示,美国农业部已确认了其他13个州的白尾鹿感染情况。

    这些州是阿肯色州、伊利诺伊州、堪萨斯州、缅因州、马萨诸塞州、明尼苏达州、新泽西州、纽约州、北卡罗来纳州、俄克拉荷马州、宾夕法尼亚州、田纳西州和弗吉尼亚州。

  • 原文来源:https://news.bioon.com/article/6795707.html
相关报告
  • 《Nature:奥密克戎突破性感染,相当于疫苗加强针,能够增强疫苗保护效果》

    • 来源专题:生物安全知识资源中心—领域情报网
    • 编译者:hujm
    • 发布时间:2022-05-22
    • 新冠病毒,通常通过呼吸道感染人类,并造成呼吸系统和人体各个器官的损伤。自2019年底首次爆发至今,新型冠状病毒仍在全球肆虐,对世界经济、社会造成极大的负面影响。 随着新冠病毒的大规模流行,新的病毒突变株不断出现,Alpha、Beta、Gamma、Delta、Omicron 等,其中一些突变株具有更强的感染能力或更强免疫逃逸能力。目前全世界最关注的当属 Omicron 突变株。 美国加州大学格莱斯顿研究所的研究人员在国际顶尖学术期刊 Nature 发表了题为:Limited cross-variant immunity from SARS-CoV-2 Omicron without vaccination 的研究论文。 该研究表明,在接种疫苗的人群中,Omicron 的突破性感染增强了疫苗引发的免疫力,这意味着,Omicron或许正在加速结束新冠大流行。在未接种疫苗的人群中,感染Omicron可以诱导针对Omicron变体体液免疫反应,但不能对其他变体产生广泛的保护。 在该研究中,研究人员分析了原始毒株、Delta、Omicron 在表达人类 ACE2 的转基因小鼠中感染,通过鼻内感染,检测小鼠的症状。 研究发现,Omicron 感染的小鼠症状较轻,与原始毒株和 Delta 不同,Omicron 在受感染动物的肺部和大脑中复制水平较低,导致轻度疾病,促炎细胞因子表达减少,肺内T细胞活化减少。 感染Omicron症状较轻 为了确定三种毒株感染诱导的体液免疫反应,研究人员在感染后7天从小鼠收集血清,并测试了对病毒的中和效率。 正如预期,来自未感染小鼠的血清在整个过程中没有表现出中和作用。来自原始毒株感染小鼠的血清,有效中和原始毒株,较小程度中和 Beta 和 Delta 毒株,但对 Omicron 无效。相比之下,Delta 感染小鼠的血清有效中和了 Delta、原始毒株、Alpha,以及较小程度中和 Omicron 和 Beta。 然而,来自 Omicron 感染小鼠的血清,只能中和 Omicron,不中和其他变体。 此外,这些结果已在未接种疫苗的患者中证实。在10名未接种疫苗的 Omicron 患者中,血清只能中和 Omicron,不中和其他变体。在11例未接种疫苗的 Delta 患者中,血清对 Delta 中和效率最高,其次是原始毒株,并较小程度中和 Alpha、Beta、Omicron。 值得注意的是,在接种疫苗的人中,Omicron、Delta 突破性感染对所有毒株的中和滴度都很高,甚至超过了辉瑞疫苗第三针诱导的中和滴度。 Omicron、Delta突破性感染增强疫苗免疫力 结果表明,Omicron、Delta 的突破性感染可以增强疫苗的免疫力,从而引发一种新的“混合免疫”,对多种突变株有效。 总之,在接种疫苗的个体中,Omicron 感染有效地增强了疫苗引发的免疫力,Delta 感染也会在接种疫苗的个体中引发广泛的交叉变异保护,该研究支持在未来的疫苗中加入基于 Omicron 和 Delta 开发的疫苗,可广泛的预防新的突变株。
  • 《奥密克戎新分支或“重拾”感染肺部能力》

    • 来源专题:生物安全知识资源中心—领域情报网
    • 编译者:hujm
    • 发布时间:2022-07-11
    •  7月6日0时起,西安在全市暂时实施7天部分公共场所临时性管控措施。相关负责人在7月5日西安市新冠肺炎疫情防控工作新闻发布会上介绍,基因测序结果显示阳性感染者此次感染的毒株均为新冠病毒奥密克戎变异株BA.5.2分支。   疫情大数据显示,陕西目前确诊感染者17例。7月以来,陕西每日新增确诊均为个位数,为什么仍需要实施暂停堂食、暂停KTV等场所营业的临时性管控呢?这还要从奥密克戎变异株新分支说起。   除了传播速度更快、病毒载量更高,业内专家向科技日报记者表示,相较于奥密克戎以往变异株,奥密克戎变异株新分支BA.5出现了入侵肺部、具有很强免疫逃逸能力的新情况。   一位免疫学者对科技日报记者表示:感染过新冠病毒的人仍会再一次感染BA.5,此外,BA.5对肺功能的影响增大,必须密切关注。   美国加州大学圣地亚哥分校医学中心副教授李克峰解释,之前的原始毒株能够利用肺泡细胞有而上呼吸道没有的蛋白入侵人类的肺部,增加重症风险,奥密克戎BA.1失去了这个能力,大多感染上呼吸道,而BA.5又找回了这个能力,“重拾”肺部感染。   谈及BA.5与BA.5.2的关系,北京化工大学生命科学与技术学院院长童贻刚教授向科技日报记者解释,BA.5.2是BA.5的分支,相较BA.5在非S蛋白上有1个氨基酸变异,预估其特性与BA.5差异不大,有模型根据变异序列推算,BA.5.2较BA.5相对增长优势(relative growth advantage)增加20%,但其置信区间较低(8%—32%)。   逃逸能力强,BA.5防控难   “今年2月份以来,我国流行的主要毒株是奥密克戎BA.2亚分支系列。”中国疾控中心病毒病所研究员王文玲此前在国务院联防联控机制发布会上介绍,全球病毒基因共享数据分析显示BA.5近期占比上升较快,初步研究认为BA.4和BA.5的传播力和免疫逃逸能力略有增强。   为什么BA.5分支的免疫逃逸能力强?北京大学谢晓亮院士团队及其合作团队对不同变异分支的S蛋白进行了构象分析(分析钥匙上的纹路),并将其与不同的中和抗体、细胞受体等匹配检测亲和力。研究发现,BA.5上的F486V和L452R突变可成功逃逸多种抗体的识别,未降低对hACE2的亲和力。   这一发表在《自然》期刊的研究表明,BA.5具有很强的免疫逃逸能力,除了可能对疫苗接种者造成突破性感染,还可以逃逸早期奥密克戎变异株BA.1感染激发的抗体。   也就是说,BA.5凭借在刺突蛋白486、452等位点上的变化,不仅能打开人细胞上的“锁”,还更好地逃避了人体内中和抗体的“截获”。这一变化将使得防控难度有所增加。   “找回”入肺能力,BA.5或提高重症率   由于大多感染上呼吸道,奥密克戎早前分支(BA.1、BA.2)的感染者多为轻症。新近的研究却发现,BA.5分支能够感染肺泡细胞。   一项由东京大学、京都大学、以色列魏茨曼科学研究所等27家科研单位联合发表的研究显示,BA.4、BA.5对人类肺泡细胞有着比BA.2更强的感染能力。   为什么奥密克戎变异株能够找回此前已经失去的肺部感染能力呢?   李克峰解释,这与人体细胞表面的一种蛋白TMPRSS2相关,这种蛋白存在于在肺泡细胞表面,是否能感染肺部,取决于能不能利用好这一蛋白。奥密克戎早前分支并不能很好地和TMPRSS2结合,而现在BA.5对TMPRSS2的结合力增加了,继而感染肺部。   多项研究表明,TMPRSS2被业界认为是治疗流感病毒与冠状病毒感染的潜在靶点。这一跨膜蛋白“放行”,病毒就能通过膜融合方式进入宿主细胞。   BA.5的变异使其重新打通了“膜融合”的分子机制,前述研究的动物试验也证明,BA.5比BA.2更具致病性。   这一结论可得到一定程度的验证。不久前的数据显示,随着BA.5感染者的增加,以色列新冠患者中有170人重症,较一周前上升95.4%。   西安市相关负责人在介绍此次引发西安疫情的BA.5.2分支时表示,其感染病例的CT值低,传染性强,西安市当前疫情形势严峻复杂,引起社区续发传播风险高。   针对如何防控的问题,前述免疫学者对科技日报记者表示,BA.5.2的CT值低意味着感染者病毒载量大,载量大代表体内病毒数量多,易传播,同时也易被检出。因此,适当的核酸检测策略可以实现社会面传播前的有效控制。   截至记者发稿,北京市对7月5日通报的感染者1至3进行基因测序,结果显示病毒均属于奥密克戎变异株BA.5.2分支,传播链条清晰,来源明确,疫情总体可控。