《FFPE样本中SARS-CoV-2感染的分子检测及SARS-CoV-2致命病例的组织病理学发现》

  • 来源专题:生物安全知识资源中心 | 领域情报网
  • 编译者: hujm
  • 发布时间:2020-06-05
  • 5月26日,AJCP期刊发表了来自克利夫兰州立大学医学中心,凯斯西储大学医学院研究团队的题为“Molecular Detection of SARS-CoV-2 Infection in FFPE Samples and Histopathologic Findings in Fatal SARS-CoV-2 Cases”的文章。报告了2例SARS-CoV-2阳性个体的尸检方法和发现。
    该文章指出,验尸检查是按照美国疾病预防控制中心的公共指南完成的。通过定量逆转录聚合酶链反应(qRT-PCR),调查了每个病例的福尔马林固定石蜡包埋(FFPE)的组织中的SARS-CoV-2 RNA。SARS-CoV-2病毒基因组通过FFPE肺组织块的NGS测序进行了测序。
    文章指出,验尸检查结果显示弥漫性肺泡损伤,未观察到病毒相关的肝、心脏或肾损伤。使用qRT-PCR检测方法,两病例均在肺、支气管、淋巴结和脾脏中检测到病毒RNA。在病例1中使用NGS进行RNA测序揭示了与带有ORF1a L3606F突变的西欧进化枝A2a最一致的突变。
    该研究认为,可以从FFPE组织中进行SARS-CoV-2检测和病毒测序。SARS-CoV-2的检测和测序以及死后组织检查的形态学发现可以帮助更好地了解该病毒对人体健康的病理生理影响。

  • 原文来源:https://academic.oup.com/ajcp/advance-article/doi/10.1093/ajcp/aqaa091/5843897?searchresult=1
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    • 编译者:zhangmin
    • 发布时间:2020-05-27
    • 1.时间:2020年5月26日 2.机构或团队:克利夫兰州立大学医学中心、凯斯西储大学医学院 3.事件概要: 5月26日,AJCP期刊发表了来自克利夫兰州立大学医学中心,凯斯西储大学医学院研究团队的题为“Molecular Detection of SARS-CoV-2 Infection in FFPE Samples and Histopathologic Findings in Fatal SARS-CoV-2 Cases”的文章。报告了2例SARS-CoV-2阳性个体的尸检方法和发现。 该文章指出,验尸检查是按照美国疾病预防控制中心的公共指南完成的。通过定量逆转录聚合酶链反应(qRT-PCR),调查了每个病例的福尔马林固定石蜡包埋(FFPE)的组织中的SARS-CoV-2 RNA。SARS-CoV-2病毒基因组通过FFPE肺组织块的NGS测序进行了测序。 文章指出,验尸检查结果显示弥漫性肺泡损伤,未观察到病毒相关的肝、心脏或肾损伤。使用qRT-PCR检测方法,两病例均在肺、支气管、淋巴结和脾脏中检测到病毒RNA。在病例1中使用NGS进行RNA测序揭示了与带有ORF1a L3606F突变的西欧进化枝A2a最一致的突变。 该研究认为,可以从FFPE组织中进行SARS-CoV-2检测和病毒测序。SARS-CoV-2的检测和测序以及死后组织检查的形态学发现可以帮助更好地了解该病毒对人体健康的病理生理影响。 4.附件: 原文链接:https://academic.oup.com/ajcp/advance-article/doi/10.1093/ajcp/aqaa091/5843897?searchresult=1
  • 《通过检测核衣壳蛋白诊断SARS-CoV-2感染》

    • 来源专题:生物安全知识资源中心 | 领域情报网
    • 编译者:hujm
    • 发布时间:2020-03-17
    • 南方医科大学珠江医院等机构的科研人员在medRxiv预印版平台发表论文“Diagnosis of Acute Respiratory Syndrome Coronavirus 2 Infection by Detection of Nucleocapsid Protein”,探讨了通过检测核衣壳蛋白诊断SARS-CoV-2感染的方法。 研究背景:核酸检测和抗体检测已被用于SARS-CoV-2感染的诊断,但尚未成功开发出病毒抗原检测用于诊断的方法。从理论上讲,在感染人群中出现抗体之前,病毒抗原是病毒的特异性标记,并。,显然需要检测病毒抗原以进行快速和早期的诊断。研究方法:科研人员纳入采用了来自7个中心的239名疑似SARS-CoV-2感染者的队列研究,与核酸测试平行地测量了鼻咽拭子样品中的核衣壳蛋白。以核酸试验为参考标准,用盲法试验进行统计评价。科研人员在另一个中心的20个尿液样本中检测了核衣壳蛋白,采用鼻咽拭子核酸测试作为参考标准。研究结果:科研人员开发了一种荧光免疫色谱法,可在10分钟内检测鼻咽拭子样品和尿液中SARS-CoV-2的核衣壳蛋白,100%的核衣壳蛋白阳性和阴性指标符合相同样品的核酸测试。此外,可以通过该方法确定发烧三天后的早期感染者;在另一项初步研究中,在73.6%的已诊断COVID-19患者中检测了尿液中的核衣壳蛋白。研究结论:这些发现表明核衣壳蛋白测定是一种诊断COVID-19的准确、快速、早期和简单的方法。尿液中核衣壳蛋白的出现与科研人员发现的SARS-CoV-2侵袭肾脏的现象相符,可能具有诊断价值。