chemRxiv预印平台于3月17日发布了日本立教大学等机构的文章“Fragment Molecular Orbital Based Interaction Analyses on COVID-19 Main Protease - Inhibitor N3 Complex (PDB ID:6LU7)”。文章报告了SARS-CoV-2主蛋白酶(Mpro)和其肽样抑制剂N3(PDB ID:6LU7)之间复合物的基于片段分子轨道(FMO)的相互作用分析。研究人员将目标抑制剂分子分为五个片段,以捕获与蛋白酶氨基酸残基位点特异性相互作用。将相互作用能分解为几个贡献部分,然后弄清了氢键和分散稳定的特征。此外,通过泊松-玻耳兹曼(PB)方程引入了水合作用的效果。研究人员称其从目前的FMO研究中,发现His41,His163,His164和Glu166是Mpro与抑制剂相互作用的最重要氨基酸残基,主要是由于氢键结合。研究人员根据FMO分析,还提出了优化抑制剂分子的指南。
*注,本文为预印本论文手稿,是未经同行评审的初步报告,其观点仅供科研同行交流,并不是结论性内容,请使用者谨慎使用。