2023年10月19日，美国冷泉港实验室和佛罗里达大学的研究人员在Science杂志发表了一篇题为Idiosyncratic and dose-dependent epistasis drives variation in tomato fruit size的文章。
传统上研究基因间的上位性是通过消除蛋白质活性的突变，但大多数自然遗传变异是在顺式调控DNA中，并定量地影响基因的表达和功能。该研究使用植物干细胞回路中的天然和工程顺式调控等位基因来系统地评估控制番茄果实大小的上位性关系。
将一个启动子等位基因系列与另外两个基因座相结合，研究人员从46个基因型中收集了超过30,000个表型数据点，以量化等位基因强度如何转化上位性。该研究揭示了饱和剂量依赖关系以及等位基因特异性特异性相互作用，包括在驯化过程中驱动果实大小变化的等位基因之间的相互作用。该研究的方法和发现揭示了一个未被充分探索的上位性维度，其中基因调控网络中的顺式调控等位基因多样性引发了非线性的、不可预测的相互作用，这些相互作用形成了表型。
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