《研究发现新的蓝细菌胁迫耐受关键因子》

  • 来源专题:生物安全知识资源中心 | 领域情报网
  • 编译者: hujm
  • 发布时间:2018-08-21
  • 蓝细菌是一类古老的光合微生物,为了应对光照、温度等环境条件的变化,逐渐进化出了一套高效的环境胁迫耐受机制。聚球藻UTEX 2973是一株新近发现对高温和强光照条件具有良好耐受能力的藻株,能够在高达42度、1500 μE m-2 s-1 光照条件下快速生长,生长代时仅为1.5小时。而相同条件下,包括其近缘物种聚球藻PCC7942在内的大多数蓝细菌都不能生长。有趣的是,聚球藻UTEX2973和聚球藻PCC7942的基因组序列一致性高达99.8%,它们只有24个差异蛋白编码基因,但是却具有显着不同的环境耐受能力。因此,这些差异基因很可能就是引起两株聚球藻胁迫耐受表型差异的直接原因。

    为了鉴定决定聚球藻胁迫耐受能力的关键基因,由中国科学院青岛生物能源与过程研究所研究员吕雪峰带领的微生物代谢工程研究组采用了“基因互补”策略:将聚球藻PCC7942视作基因缺陷型突变株,以聚球藻UTEX2973的基因片段转化聚球藻PCC7942,筛选具有高温和高光耐受能力的突变株。结果发现,所有高温高光耐受的聚球藻PCC7942突变株在其FoF1 ATP 合成酶ɑ亚基(AtpA)的252位氨基酸均有一个C252Y(色氨酸到络氨酸)的点突变。而针对该位点的饱和突变发现,将半胱氨酸(Cysteine, C)突变为任何一种共轭氨基酸(苯丙氨酸、络氨酸、组氨酸、色氨酸)都能够使得聚球藻PCC7942获得高温高光的耐受能力。通过系统的生化、生理和代谢水平研究发现,C252Y点突变造成了FoF1 ATP 合成酶ɑ亚基蛋白水平和FoF1 ATP 合成酶活性的显着提高,增加了胞内ATP水平;显着提高了胁迫条件下的光系统II核心D1蛋白的转录水平、光合放氧、线性电子传递速率,乃至糖原积累速率。该研究鉴定了决定速生聚球藻环境胁迫耐受能力的关键基因,为代谢工程改造光合生物环境抗逆性提供了重要靶标(appl Environ Microbiol, 2018)。

    而针对聚球藻UTEX2973胁迫条件下转录调控机制不清的问题,研究组与德国弗莱堡大学教授Wolfgang Hess研究组合作开展了基于dRNA-seq的差异转录组学研究,分析了不同胁迫条件对于聚球藻UTEX2973基因转录和生理代谢的影响,发现响应强光信号的小RNA分子PsrR1以及黑暗条件大量转录的Sye_sRNA1和Sye_sRNA3,并推测它们可能的作用机制。此外,该研究还精确鉴定了聚球藻UTEX2973全基因组范围的4808个转录起始位点,为后续转录调控以及代谢工程改造研究奠定了基础(Biotechnol Biofuels, 2018)。

    相关研究得到了国家自然科学基金相关人才计划、中国科学院重点部署项目、山东省重大基础研究等的支持。

  • 原文来源:http://news.bioon.com/article/6726145.html
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    • 编译者:guokm
    • 发布时间:2018-08-17
    • 蓝细菌是一类古老的光合微生物,为了应对光照、温度等环境条件的变化,逐渐进化出了一套高效的环境胁迫耐受机制。聚球藻 UTEX 2973 是一株新近发现对高温和强光照条件具有良好耐受能力的藻株,能够在高达 42 度、 1500 μE m -2 s -1 光照条件下快速生长,生长代时仅为 1.5 小时。而相同条件下,包括其近缘物种聚球藻 PCC7942 在内的大多数蓝细菌都不能生长。有趣的是,聚球藻 UTEX2973 和聚球藻 PCC7942 的基因组序列一致性高达 99.8% ,它们只有 24 个差异蛋白编码基因,但是却具有显著不同的环境耐受能力。因此,这些差异基因很可能就是引起两株聚球藻胁迫耐受表型差异的直接原因。 为了鉴定决定聚球藻胁迫耐受能力的关键基因,由青岛能源所吕雪峰研究员带领的微生物代谢工程研究组 ( http://mme.qibebt.ac.cn/ ) 采用了 “ 基因互补 ” 策略:即将聚球藻 PCC7942 视做基因缺陷型突变株,以聚球藻 UTEX2973 的基因片段转化聚球藻 PCC7942 ,筛选具有高温和高光耐受能力的突变株。结果发现,所有高温高光耐受的聚球藻 PCC7942 突变株在其 FoF1 ATP 合成酶 ɑ 亚基( AtpA )的 252 位氨基酸均有一个 C252Y (色氨酸到络氨酸)的点突变。而针对该位点的饱和突变发现,将半胱氨酸( Cysteine, C )突变为任何一种共轭氨基酸(苯丙氨酸、络氨酸、组氨酸、色氨酸)都能够使得聚球藻 PCC7942 获得高温高光的耐受能力。通过系统的生化、生理和代谢水平研究发现, C252Y 点突变造成了 FoF1 ATP 合成酶 ɑ 亚基蛋白水平和 FoF1 ATP 合成酶活性的显著提高,增加了胞内 ATP 水平;显著提高了胁迫条件下的光系统 II 核心 D1 蛋白的转录水平、光合放氧,线性电子传递速率,乃至糖原积累速率。本研究鉴定了决定速生聚球藻环境胁迫耐受能力的关键基因,为代谢工程改造光合生物环境抗逆性提供了重要靶标( Appl Environ Microbiol, 2018 )。 而针对聚球藻 UTEX2973 胁迫条件下转录调控机制不清的问题,研究组与德国弗莱堡大学 Wolfgang Hess 教授研究组合作开展了基于 dRNA-seq 的差异转录组学研究,分析了不同胁迫条件对于聚球藻 UTEX2973 基因转录和生理代谢的影响,发现了响应强光信号的小 RNA 分子 PsrR1 以及黑暗条件大量转录的 Sye_sRNA1 和 Sye_sRNA3 ,并推测了它们可能的作用机制。此外,该研究还精确鉴定了聚球藻 UTEX2973 全基因组范围的 4808 个转录起始位点,为后续转录调控以及代谢工程改造研究奠定了基础( Biotechnol Biofuels, 2018 )。 相关研究得到了国家自然科学基金相关人才计划、中国科学院重点部署项目、山东省重大基础研究等项目的支持。 ( 文 / 图 谈晓明 ) 相关成果发表: (1) Lou W#, Tan X#, Song K, Zhang S, Luan G, Li C, Lu X. (2018). Single SNP in ATP synthase gene significantly improves environmental stress tolerance of Synechococcus elongatus PCC 7942. Appl Environ Microbiol doi:10.1128/aem.01222-18. (2) Tan X#, Hou S#, Song K, Georg J, Kl?hn S, Lu X, Hess WR. (2018). The primary transcriptome of the fast-growing cyanobacterium Synechococcus elongatus UTEX 2973. Biotechnol Biofuels 11:218
  • 《青岛能源所在光驱固碳蓝细菌合成蔗糖研究中取得进展》

    • 来源专题:中国科学院文献情报系统—海洋科技情报网
    • 编译者:mall
    • 发布时间:2017-12-08
    • 蓝细菌,又称蓝藻或蓝绿藻,是地球上最古老的微生物之一。它们通过植物型光合作用,将二氧化碳固定并转化为各类碳水化合物。研究发现,很多蓝细菌在高盐环境下在细胞内合成并积累蔗糖来抵抗逆境。利用这一生理特点,发展蓝细菌细胞工厂进行糖类分子的合成和分泌,将二氧化碳和太阳能直接转化为蔗糖产品,是具有潜力的新型糖原料供给路线。   中国科学院青岛生物能源与过程研究所微生物代谢工程团队致力于蓝细菌糖类物质合成研究,该团队近期研究揭示了蓝细菌蔗糖合成在调控和代谢方面的若干机理问题。针对前人在集胞藻PCC 6803研究中蔗糖合成转录调控蛋白Slr1588全基因缺失和插入失活两个突变株在盐胁迫条件下表型不一的问题,该团队系统分析了slr1588及下游ggpP基因的结构及转录情况,证明ggpP基因转录起始于slr1588基因编码框内,slr1588全基因缺失所导致的对下游ggpP基因的转录抑制,是突变株盐敏感表型的真正原因。基于新构建的slr1588突变株,Slr1588被证明能调控蔗糖合成关键酶spsA基因的转录和蔗糖分解酶活性。该研究为进一步解析蓝细菌蔗糖合成调控机制和针对性强化蔗糖合成途径提高蔗糖产量奠定了理论基础,相关研究结果发表在Frontiers in Microbiology上。   此外,该团队在蓝细菌蔗糖合成代谢机理研究中取得进展。在蓝细菌中,由于蔗糖合成与糖原合成使用相同的前体物——葡萄糖-1-磷酸,因此一般认为二者之间存在合成竞争关系,抑制糖原合成将促进蔗糖合成。然而,该研究团队的研究结果与此不同。研究人员利用核糖体开关策略,实现对聚球藻PCC 7942工程菌株中糖原合成的梯度抑制,发现糖原水平的下降并没有带来蔗糖合成水平的提升,反而降低蔗糖产量;而在蓝细菌中增强糖原合成,则有效提高了蔗糖合成水平。研究表明,糖原合成并非是蓝细菌蔗糖合成的竞争性途径,其更可能作为“碳库”为蔗糖合成提供碳素支持(如图)。该研究结果改变了业界对蓝细菌中糖原合成与蔗糖合成关系的传统认识,也为进一步提高基因工程蓝细菌蔗糖产量提供了新的改造策略。   研究工作获得了国家相关人才计划、中德科学中心项目、国家自然科学基金青年基金等的支持。