携带残留HIV病毒的组织（包括肠道）未能充分地暴露于抗逆转录病毒药物（ART）中可能导致HIV的持久存在。这可能导致组织中的HIV病毒复制增加。测量组织中药物浓度的传统方法无法表征药物的不均匀分布。
在一项新的研究中，来自美国北卡罗来纳大学教堂山分校、俄勒冈健康与科学大学、科罗拉多州立大学、加州大学戴维斯分校、北卡罗莱纳州立大学和弗雷德里克国家癌症研究实验室的研究人员利用质谱成像（mass spectrometry imaging, MSI）技术可视化观察6种ART药物在来自三种物种（两种人源化小鼠品系、恒河猴和人类）的肠道组织切片中的分布。相关研究结果发表在2019年7月3日的Science Translational Medicine期刊上，论文标题为“Heterogeneous antiretroviral drug distribution and HIV/SHIV detection in the gut of three species”。
这些研究人员测量了HIV靶向的CD3+ T细胞附近的药物浓度，以及在来自HIV感染的人源化小鼠、SHIV感染的恒河猴和HIV感染的人类患者在接受ART药物联合治疗后的肠道组织中的HIV或SHIV RNA表达和MDR1药物外排转运蛋白的表达。
这些研究人员利用质谱成像技术可视化观察速冻的回肠和直肠组织的连续10μm切片，并且通过免疫荧光和免疫组织化学分别分析这些组织切片中的CD3+ T细胞和MDR1药物外排转运蛋白表达。他们利用原位杂交分析方法分析了这些组织切片中的HIV/SHIV RNA表达，并且利用液相色谱-质谱联用技术测量了ART药物浓度。
基于这些测量结果，这些研究人员发现这六种ART药物在胃肠道组织中的分布是不均匀的。50％～60％的CD3+ T细胞未能与肠道组织中可检测到的药物浓度共存。
这些研究人员发现在这三种物种中，在ART药物治疗期间，仍然能够检测到HIV/SHIV RNA，特别是在ART药物浓度较低的组织区域，这可能导致低水平的HIV/SHIV病毒复制。特别地，他们发现高达90％的HIV/SHIV RNA在没有接触ART药物的肠道组织中表达。
这些数据表明，可能存在很少或没有接触ART药物的肠道区域，这可能导致低水平的HIV病毒复制，从而导致HIV病毒的持续存在。
