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《2月4日_T2SARS-CoV-2?可检测SARS-CoV-2的P.1变种》

  • 来源专题：COVID-19科研动态监测
  • 编译者： zhangmin
  • 发布时间：2021-02-25

  • Biospace网站2月4日消息称，T2 Biosystems公司宣布其分子诊断测试T2SARS-CoV-2™可检测在巴西发现的SARS-CoV-2病毒P.1变体，最近在美国也检测到了该变体。
    像在英国（B.1.1.7）和南非（B.1.351）中发现的SARS-CoV-2变体一样，在巴西发现的SARS-CoV-2变体包含多个突变，大多数在刺突蛋白基因中。对P.1变体的序列分析表示，T2SARS-CoV-2™可以有效检测该变体。T2SARS-CoV-2™的临床敏感性为95%，特异性为100%，可使用上呼吸道拭子样本进行，只需2小时就可以获得结果。该测试在该公司经美国食品药品管理局（FDA）批准的全自动T2Dx®仪器上运行，该仪器能够同时进行7项测试，每天可检测多达60个样品。
    T2Dx®仪器还能够运行经FDA批准T2Bacteria®测试和T2Candida®测试。这些测试是经FDA批准的可在三到五个小时内从全血中直接检测出引起败血症的细菌和真菌病原体的测定方法，无需等待数天的血液培养结果。由于数据表明COVID-19病毒可导致败血症和死亡，因此在大流行期间，这些测试在临床上也特别重要。
    原文链接：https://www.biospace.com/article/releases/t2-biosystems-t2sars-cov-2-panel-proves-capable-of-detecting-the-brazil-p-1-variant-of-the-sars-cov-2-virus/?keywords=COVID-19

  • 原文来源：https://www.biospace.com/article/releases/t2-biosystems-t2sars-cov-2-panel-proves-capable-of-detecting-the-brazil-p-1-variant-of-the-sars-cov-2-virus/?keywords=COVID-19
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    • 编译者：zhangmin
    • 发布时间：2021-02-05
    • 据BioSpace网站1月11日消息，快速检测引起败血症的病原体的领导者T2 Biosystems 公司（TTOO）宣布，其T2SARS-CoV-2™试剂盒（一种分子诊断测试）可检测出SARS-CoV-2感染，且能够检测最近在英国、南非和美国发现的SARS-CoV-2病毒的多种变体。该公司的T2SARS-CoV-2™试剂盒据证实具有95％的临床敏感性和100％的特异性。 在英国（B.1.1.7）和南非（B.1.351）中鉴定出的两个变体均包含多个突变，主要体现在编码刺突蛋白的S基因上。为了确认T2SARS-CoV-2™试剂盒能否检测到SARS-CoV-2病毒的这些变异和其他潜在突变，使用美国国家生物技术信息中心（NCBI）核苷酸数据库和全球共享流感数据倡议组织（GISAID）数据库中提供的基因组序列进行了计算机分析。评估了SARS-CoV-2的超过42,000个基因组序列与来自T2SARS-CoV-2™试剂盒的引物和探针序列的比对。该分析表明，T2SARS-CoV-2™试剂盒中的基因序列比对可以检测到99.99%的SARS-CoV-2病毒。对B.1.1.7和B.1.351变异的特异性序列分析表明，T2SARS-CoV-2™试剂盒能够检测到这些变异。 原文链接：https://www.biospace.com/article/releases/t2-biosystems-t2sars-cov-2-panel-proves-effective-amid-global-rise-in-variants-of-the-sars-cov-2-virus/?keywords=COVID-19
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  • 《Cell，3月30日，Antibody evasion by the P.1 strain of SARS-CoV-2》
    • 来源专题：COVID-19科研动态监测
    • 编译者：zhangmin
    • 发布时间：2021-04-02
    • Antibody evasion by the P.1 strain of SARS-CoV-2 Wanwisa Dejnirattisai # Daming Zhou # Piyada Supasa # Jingshan Ren David I. Stuart Gavin R. Screaton Show all authors Show footnotes Open AccessPublished:March 30, 2021DOI:https://doi.org/10.1016/j.cell.2021.03.055 Summary Terminating the SARS-CoV-2 pandemic relies upon pan-global vaccination. Current vaccines elicit neutralizing antibody responses to the virus spike derived from early isolates. However, new strains have emerged with multiple mutations: P.1 from Brazil, B.1.351 from South Africa and B.1.1.7 from the UK (12, 10 and 9 changes in the spike respectively). All have mutations in the ACE2 binding site with P.1 and B.1.351 having a virtually identical triplet: E484K, K417N/T and N501Y, which we show confer similar increased affinity for ACE2. We show that, surprisingly, P.1 is significantly less resistant to naturally acquired or vaccine induced antibody responses than B.1.351 suggesting that changes outside the RBD impact neutralisation. Monoclonal antibody 222 neutralises all three variants despite interacting with two of the ACE2 binding site mutations, we explain this through structural analysis and use the 222 light chain to largely restore neutralization potency to a major class of public antibodies.
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