1.时间:2020年6月21日
2.机构或团队:美国Inflammatix公司、斯坦福大学医学院、斯坦福大学、希腊色萨利大学拉里萨综合医院等
3.事件概要:
medRxiv预印本于6月21日发表了美国Inflammatix公司和斯坦福大学医学院等机构的研究文章“Transcriptomic Similarities and Differences in Host Response between SARS-CoV-2 and Other Viral Infection”。文章指出,COVID-19是与其他急性病毒感染具有某些相似临床特征的大流行病。该文章研究了针对SARS-CoV-2的全血转录组宿主反应,并将其与其他病毒感染进行了比较,以了解宿主反应的异同。研究人员利用RNAseq对来自24名健康对照者和入院后24小时内被SARS-CoV-2感染的社区获得性下呼吸道感染的62名患者的外周血进行了分析。研究人员还汇编并展示了对来自六种病毒(流感,RSV,HRV,埃博拉,登革热和SARS-CoV-1)之一感染的患者的1855份血液样本进行的分析的23项独立研究。
该研究结果显示,与健康对照组相比,COVID-19患者外周血的基因表达变化与对其他病毒感染的反应变化高度相关(r = 0.74,p <0.001)。但是, ACO1和ATL3这两个基因显示出明显相反的变化。COVID-19或其他病毒感染患者相对于健康对照患者的途径分析确定了相似的途径,包括嗜中性粒细胞激活、先天免疫应答、对病毒感染的免疫应答以及过表达基因的细胞因子产生。相反,对于表达不足的基因、途径表明,淋巴细胞分化和T细胞活化受到抑制。
当直接比较COVID-19患者的转录组谱与其他病毒感染患者的转录组谱时,研究人员发现在COVID-19感染期间,有114个过表达而302个基因表达不足。途径分析未发现这些基因中的任何重要途径,这表明需要进一步研究新型反应。使用免疫状态进行的统计反卷积发现,在包括COVID-19在内的所有病毒感染中,M1巨噬细胞、浆细胞样树突状细胞、CD14 +单核细胞,CD4+ T细胞和总B细胞在同一方向上显示出一致的变化。在COVID-19中增加但在非COVID-19病毒感染中减少的是CD56bright NK(自然杀伤)细胞、M2巨噬细胞和总NK细胞。文章表示,此处列出的一致和不一致反应为探索COVID-19与其他病毒感染的病理生理学提供了一个窗口,并显示出作为SARS-CoV-2宿主反应一部分的信号传导途径和细胞性质的明显差异。
*注,本文为预印本论文手稿,是未经同行评审的初步报告,其观点仅供科研同行交流,并不是结论性内容,请使用者谨慎使用。
4.附件:
原文链接:https://www.medrxiv.org/content/10.1101/2020.06.18.20131326v1