过去的全球变化可能迫使有巨型果实的动物传播型植物去适应一切或走向灭亡,但是这些过程在十分广阔的时空范围内都未被勘察过。这里我们对超过2500株棕榈树(棕榈科)物种结合动植物种类史,分配和果实大小数据,通过时间片段多样化分析去量化灭绝和适应在很长一段时间内是如何改变的。我们的结果表明,有巨型果实的棕榈树灭绝率从第四纪的开始(260万年前)在新世界有所增加。相反,旧世界的棕榈树展现了从巨型果实进化为小型果实的过度率在一个四纪的增长。我们提出新世界第四纪的气候动荡和并发栖息地破坏以及大型食果动物的驱除原虫已经缩小了种子传播距离和巨型果实棕榈树的地理分布范围,从而导致了它们的灭绝。在旧世界渐增的小果实适应力可以反映通过跨海食果动物的种子传播选择(例如中等大小的鸟和蝙蝠),来移入印度太平洋岛屿从而应对第四纪海平面波动的大背景。我们的宏观进化结果提出巨型果实正逐渐从热带生态系统中消失,或许是由于灭绝,又或许是为了适应变为小型果实。