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《深圳湾实验室等研究称通过氢键和疏水作用的网络增强了SARS-CoV-2的受体结合》

  • 来源专题：生物安全知识资源中心 | 领域情报网
  • 编译者： hujm
  • 发布时间：2020-06-20

  • 深圳湾实验室、北京大学深圳研究生院和明尼苏达大学的科研人员在PNAS期刊在线发表题为“Enhanced receptor binding of SARS-CoV-2 through
    networks of hydrogen-bonding and hydrophobic interactions”的文章。
    文章指出，为了阐明常见受体蛋白血管紧张素转换酶-2（ACE2）和SARS-CoV-2以及SARS-CoV的受体结合域之间不同蛋白质-蛋白质相互作用的结构来源，研究人员进行了分子动力学和自由能模拟。动态轨迹分析表明，COVID-19的结合界面由一块主要疏水区域和精细的氢键网络组成。从SARS-CoV序列中的疏水残基到SARS-CoV-2的Lys417的关键突变在中心疏水接触区域形成了一个盐桥，这与极性残基突变一起导致了比SARS-CoV复合物更大的静电互补性。此外，与SARS-CoV复合物相比，静电效应和增强的疏水性包封（在一个短的12-残基环中去除5个脯氨酸残基中的4个）都导致SARS-CoV-2复合物构想构象向更倾斜的结合槽偏移。另一方面，在SARS-CoV-2同源复合物模型中，SARS-CoV中和抗体80R复合物中的疏水接触被破坏，这是由于80R无法识别SARS-CoV-2所致。

  • 原文来源：https://www.pnas.org/content/early/2020/06/04/2008209117#abstract-2
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    • 编译者：zhangmin
    • 发布时间：2020-06-07
    • 1.时间：2020年6月5日 2.机构或团队：深圳湾实验室、北京大学深圳研究生院、明尼苏达大学 3.事件概要： 深圳湾实验室、北京大学深圳研究生院和明尼苏达大学的科研人员在PNAS期刊在线发表题为“Enhanced receptor binding of SARS-CoV-2 through networks of hydrogen-bonding and hydrophobic interactions”的文章。 文章指出，为了阐明常见受体蛋白血管紧张素转换酶-2（ACE2）和SARS-CoV-2以及SARS-CoV的受体结合域之间不同蛋白质-蛋白质相互作用的结构来源，研究人员进行了分子动力学和自由能模拟。动态轨迹分析表明，COVID-19的结合界面由一块主要疏水区域和精细的氢键网络组成。从SARS-CoV序列中的疏水残基到SARS-CoV-2的Lys417的关键突变在中心疏水接触区域形成了一个盐桥，这与极性残基突变一起导致了比SARS-CoV复合物更大的静电互补性。此外，与SARS-CoV复合物相比，静电效应和增强的疏水性包封（在一个短的12-残基环中去除5个脯氨酸残基中的4个）都导致SARS-CoV-2复合物构想构象向更倾斜的结合槽偏移。另一方面，在SARS-CoV-2同源复合物模型中，SARS-CoV中和抗体80R复合物中的疏水接触被破坏，这是由于80R无法识别SARS-CoV-2所致。 4.附件： 原文链接： https://www.pnas.org/content/early/2020/06/04/2008209117#abstract-2
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  • 《11月16日_CpG佐剂可增强SARS-CoV-2受体结合域疫苗对老年小鼠的保护》
    • 来源专题：COVID-19科研动态监测
    • 编译者：YUTING
    • 发布时间：2021-11-27
    • Science Translational Medicine于11月16日发表了哈佛大学和波士顿儿童医院等机构的文章“An aluminum hydroxide:CpG adjuvant enhances protection elicited by a SARS-CoV-2 receptor-binding domain vaccine in aged mice”，描述了CpG佐剂可增强SARS-CoV-2受体结合域疫苗对老年小鼠的保护作用。 文章称，为结束低收入国家和中等收入国家的COVID-19大流行，仍迫切需要在全球为不同年龄群的人提供COVID-19疫苗。虽然已经开发出了基于mRNA和腺病毒载体技术的COVID-19疫苗，但仍需要更多实用的、可扩展的COVID-19疫苗来满足全球对疫苗的需求。用适当佐剂配制的蛋白质亚单位疫苗是解决这一迫切需要的一种方法。受体结合域（RBD）是SARS-CoV-2中和抗体的关键靶点，但其免疫原性较差。因此，研究人员将单独或与氢氧化铝（AH）配制的模式识别受体（PRR）激动剂进行了比较，并将其效果与AS01B和as03类乳化佐剂共同使用的PRR的效果进行对比，以评估配合不同佐剂使用的疫苗在年轻和老年小鼠中增强RBD免疫原性的潜力。结果发现，与单纯的AH相比，AH与CpG佐剂同时使用的配方（AH：CpG）使两个年龄组的小鼠产生的抗RBD中和抗体滴度增加了80倍，并保护老年小鼠免受SARS-CoV-2侵害。AH：CPG佐剂RBD疫苗能使小鼠产生针对野生型SARS-CoV-2和B.1.351（β）变体的中和抗体，其血清浓度与辉瑞生物技术公司的BNT162b2 mRNA疫苗诱导的抗体相当。AH：CpG佐剂RBD疫苗在年轻和老年小鼠的引流淋巴结中诱导了相似的细胞因子和趋化因子基因富集模式，并增强了青年和老年人类单核细胞中细胞因子和趋化因子的产生。这些数据支持AH：CPG佐剂RBD疫苗作为一种可在多个年龄段人群中有效使用的疫苗。
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