《Science | 维生素A决定细胞谱系可塑性以协调干细胞谱系的选择》

  • 来源专题:战略生物资源
  • 编译者: 李康音
  • 发布时间:2024-03-13
  • 2024年3月8日,洛克菲勒大学Elaine Fuchs教授和Matthew T. Tierney博士后等人,在国际顶尖学术期刊Science上发表了题为Vitamin A resolves lineage plasticity to orchestrate stem cell lineage choices的研究论文。

    细胞谱系可塑性是指新的和先前谱系的细胞标识转录因子的双重表达,并且是赋予干细胞命运灵活性的伤口诱导应激途径的典型特征。在健康组织中,干细胞最终要么返回其先前由环境定义的轨迹,要么在进入不同微环境时经历命运变化。了解细胞谱系可塑性是如何解决的很重要,因为使其持续的条件可能导致慢性伤口状态或肿瘤发生。

    该研究发现,全反式维A酸(atRA)作为一种维生素A代谢物,对于恢复它们在培养中的生理身份至关重要。他们还发现atRA使培养的毛囊干细胞能够与WNT和BMP信号合作,有效地协调形成毛囊所需的不同谱系。此外,遗传、饮食和局部干预均证实了atRA在平衡干细胞对表皮修复和毛发再生中的贡献方面的功效。最重要的是,他们证明了atRA水平必须下降,毛囊干细胞才能参与伤口修复。这些研究结果提供了关于维持干细胞谱系特异性的机制的新见解,并为利用atRA平衡干细胞在表皮修复和毛发再生中的作用提供了潜在途径。

    擦伤时,皮肤干细胞会紧急出击,生长新的表皮来覆盖伤口。但是,最终修复伤口的干细胞中只有一部分通常专门用于补充保护身体的表皮。其他的是前毛囊干细胞,通常促进毛发生长,但会响应更紧急的需求,将自己变成表皮干细胞,加强本地的修复工作。为了做到这一点,这些毛囊干细胞首先进入一种柔韧的状态,即谱系可塑性状态。在这种状态下,它们暂时表达了两种类型干细胞的转录因子,即毛发和表皮。为了更好地理解人体如何调节这一过程,Elaine Fuchs教授和她的团队在模拟创伤状态下,筛选小分子化合物,以确定它们解决培养小鼠毛囊干细胞谱系可塑性的能力。他们惊讶地发现,维生素A的生物活性形式——全反式维A酸(atRA)——对这些干细胞退出谱系可塑性,然后被引导分化为毛发细胞或表皮细胞在体外起到了至关重要的作用。atRA是维生素A代谢产物,对恢复小鼠毛囊干细胞在培养中的生理特性至关重要。这些相同的效应在小鼠皮肤内也得以重现,在那里atRA作为干细胞微环境的一个组成部分被局部产生,并且需要维持谱系特异性。通过将转录组和染色质组学数据与维A酸活化的核维A酸受体-DNA相互作用相结合,他们确定了影响这一结果的靶标。

    有趣的是,维A酸并不是独自发挥作用的:atRA使培养的毛囊干细胞能够与WNT(Wingless相关整合位点)和BMP(骨形成蛋白)信号共同有效地编排形成毛囊所需的不同谱系。这种培养平台准确地模拟了干细胞特有的一系列行为,包括从静止到活跃的自我更新的转变,以及它们沿着有序路线定向到分化命运。最后,他们利用实验室小鼠作为模型系统研究atRA在伤口愈合过程中的影响,他们发现遗传、饮食和局部干预都证实了atRA在平衡干细胞对表皮修复和毛发再生的贡献中的作用。然而,事情并不止于此。他们还证明了atRA的可用性与谱系可塑性呈负相关,在修复早期短暂减少以允许干细胞在伤口床中进行“身份转换”,然后在屏障重新形成后恢复以促进毛发再生。

相关报告
  • 《Science | 凋亡细胞类型决定胞葬后巨噬细胞功能分化》

    • 来源专题:战略生物资源
    • 编译者:李康音
    • 发布时间:2024-04-10
    • 2024年4月5日,德国汉堡大学- Eppendorf医学中心Lidia Bosurgi、Nicola Gagliani共同通讯在Science发表题为Apoptotic cell identity induces distinct functional responses to IL-4 in efferocytic macrophages的文章,发现凋亡的细胞类型在决定胞葬巨噬细胞后续转录和功能反应方面发挥着关键作用,突出了炎症、组织修复和免疫耐受调节的新维度。 巨噬细胞是一种高度常见的细胞,在组织稳态和免疫调节中发挥着至关重要的作用。这些吞噬细胞不断清除其微环境中的各种垂死凋亡细胞,被称为胞葬作用。虽然清除凋亡细胞长期以来一直被认为是一种简单的“内务管理”功能,但新出现的证据表明,被吞噬的凋亡细胞的身份可以深刻影响巨噬细胞的激活和功能。研究人员证明,凋亡细胞来源的特定细胞谱系可以塑造巨噬细胞对2型细胞因子IL-4的反应。当骨髓来源的巨噬细胞在IL-4存在的情况下暴露于凋亡的中性粒细胞、T细胞或肝细胞时,会表现出不同的转录特征。吞噬凋亡中性粒细胞的巨噬细胞表现出组织重塑特征,其特征是与伤口愈合相关的基因如Arg1、Fn1和Chil3的上调。相反,对凋亡肝细胞的感知促进了免疫抑制或耐受表型,增加了Cebpa、Socs1和Cd274的表达。有趣的是,凋亡T细胞的摄取对巨噬细胞对IL-4的反应只有很微弱的影响。 为了了解潜在的机制,研究人员深入研究了不同凋亡细胞类型的特征。虽然所有凋亡细胞都表现出程序性细胞死亡的特征,如caspase激活和磷脂酰丝氨酸暴露,但它们的脂质组成不同。凋亡的中性粒细胞和胸腺细胞富含游离脂肪酸,而凋亡的肝细胞具有不同的脂质特征。重要的是,作者发现特异性吞噬受体(即AXL和MERTK)的参与对凋亡中性粒细胞的摄取至关重要,而对凋亡T细胞的摄取影响一般,但对凋亡肝细胞的吞噬却不重要。然后,研究人员使用曼氏血吸虫(S. mansoni)感染的小鼠模型在体内研究了这些发现的相关性,曼氏血吸虫是一种蠕虫寄生虫,可以诱导强大的2型免疫反应。来自受感染小鼠的肝髓系细胞的单细胞RNA测序揭示了不同的群体,这些群体富含与体外特定凋亡细胞类型的传感相关的基因特征。此外,以凋亡中性粒细胞和IL-4为条件的巨噬细胞的过继转移提高了感染小鼠结肠中寄生卵的清除率,突出了这一现象的潜在治疗意义。 重要的是,研究人员发现,在血吸虫感染期间,AXL和MERTK的参与对凋亡中性粒细胞的摄取至关重要,在较小程度上对T细胞的摄取也至关重要。骨髓细胞中缺乏这些吞噬受体的小鼠表现出寄生虫卵清除受损,肝损伤增加,血清中2型细胞因子如IL-5、IL-13和IL-10水平升高。这些发现表明,凋亡细胞和参与其摄取的特异性吞噬受体的身份可以显著影响巨噬细胞反应,从而影响宿主-病原体相互作用的结果。 总之,这项研究挑战了凋亡细胞是一个同质群体的概念,并强调了死亡细胞的细胞身份在形成巨噬细胞功能多样性中的重要性。研究人员证明,对不同凋亡细胞类型的感知可以在巨噬细胞中诱导特定的转录程序,且这是由选择性吞噬受体的参与驱动的。这些发现对我们理解巨噬细胞生物学和基于巨噬细胞的细胞疗法的潜在应用具有重要意义。
  • 《Nature | 气道丘疹是独特的可塑性干细胞的抗损伤库》

    • 编译者:李康音
    • 发布时间:2024-05-06
    • 2024年5月1日,麻省总医院等机构的研究人员在期刊Nature上发表了题为Airway hillocks are injury-resistant reservoirs of unique plastic stem cells的文章。 气道丘疹是一种功能不明的分层上皮结构。丘疹可持续数月之久,其基底干细胞群体独特,可表达与屏障功能和细胞粘附相关的基因。丘疹基底干细胞不断补充上覆的鳞状屏障细胞。它们的更替率显著高于大量的、基本处于静止状态的经典假上皮。由于丘疹鳞状细胞能保护下层丘疹基底干细胞免受损伤,因此丘疹能抵御各种损伤,包括毒素、感染、酸和物理损伤。丘疹基底干细胞能够进行大规模克隆扩增,足以重新覆盖被破坏的气道,并最终再生出正常的气道上皮细胞,包括其六种组成细胞类型中的每一种。希洛克基底干细胞在视黄酸信号抑制的情况下优先分层和角质化,视黄酸信号抑制是鳞状化生的已知原因。 该研究发现小鼠丘疹扩展是维生素 A 缺乏诱发鳞状化生的原因。最后,研究人员确定了人类丘疹,其基底干细胞可在培养中生成功能性鳞状上皮屏障结构。丘疹的存在重塑了我们对气道上皮再生的认识。此外,研究人员还发现丘疹是 "鳞状化生 "的起源之一,而 "鳞状化生 "一直被认为是肺癌的前兆。