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《10月8日_SARS-CoV-2破坏剪接，翻译和蛋白质运输以抑制宿主防御》

  • 来源专题：COVID-19科研动态监测
  • 编译者： zhangmin
  • 发布时间：2020-10-15

  • Cell期刊于10月8日出版了加州理工学院、南加州大学凯克医学院、佛蒙特大学拉纳医学院等7家机构联合发表的研究文章“SARS-CoV-2 disrupts splicing, translation, and protein trafficking to suppress host defenses”。文章称，现在仍不能完全了解SARS-CoV-2致病机理的分子基础。本文中，研究人员全面定义了SARS-CoV-2的蛋白与人类的RNA之间的相互作用。NSP16与U1和U2剪接RNA的mRNA识别域结合，并在SARS-CoV-2感染后起着抑制整体的mRNA剪接的作用。NSP1在核糖体的mRNA进入通道中与18S核糖体RNA结合，并在感染后导致mRNA翻译的整体抑制。最后，NSP8和NSP9与信号识别颗粒中的7SL RNA结合，并在感染后干扰蛋白质向细胞膜的运输。这些基本细胞功能的破坏都起着抑制干扰素对病毒感染的反应的作用。文章称这些结果揭示了SARS-CoV-2利用多管齐下的策略来拮抗必需的细胞过程以抑制宿主防御。

    原文链接：https://www.cell.com/cell/fulltext/S0092-8674(20)31310-6

  • 原文来源：https://www.cell.com/cell/fulltext/S0092-8674(20)31310-6
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  • 《Cell：揭示新冠病毒破坏人体细胞的剪接、翻译和蛋白运输，从而抑制人体抗病毒防御》
    • 来源专题：生物安全知识资源中心 | 领域情报网
    • 编译者：hujm
    • 发布时间：2020-10-14
    • 在世界进入COVID-19大流行半年多的时候，医生和科研人员对这种疾病的主要症状---咳嗽、发烧、呼吸急促和疲劳等---有了相当好的了解。但是，对治疗症状同样重要的是，要了解导致COVID-19的冠状病毒SARS-CoV-2在人体细胞中做了什么而让人如此生病。 像所有病毒一样，SARS-CoV-2闯入宿主细胞，劫持它的资源和分子机器来制造更多的病毒。从进化的角度来说，成功存活下来的病毒能够有效地躲避宿主细胞的防御，但又不直接杀死它们（毕竟，病毒需要细胞保持活力才能增殖）。 人体细胞（更广泛地说，哺乳动物细胞）有内置的防御机制来应对病毒感染。细胞中病毒遗传物质的存在会触发一连串的事件，导致一组称为干扰素的蛋白的产生和分泌，所产生的干扰素试图抑制感染，并通知邻近的细胞有威胁存在。人们已发现，具有重症COVID-19症状的患者也表现出低水平的干扰素反应，这表明干扰素反应对对抗病毒至关重要。SARS-CoV-2如何抑制这些正常的防御机制？ 如今，在一项新的研究中，来自美国加州理工学院和佛蒙特大学等研究机构的研究人员确定了SARS-CoV-2病毒让人体细胞丧失能力的机制：这基本上使得人体细胞的报警系统失效，从而无法呼救附近细胞的帮助，也无法提醒附近细胞存在感染。了解这种病毒如何导致细胞水平上的功能障碍，为如何对抗它提供了新的见解。相关研究结果于2020年10月8日在线发表在Cell期刊上，论文标题为“SARS-CoV-2 disrupts splicing, translation, and protein trafficking to suppress host defenses”。论文通讯作者为加州理工学院生物学教授Mitchell Guttman博士和佛蒙特大学医学院研究员Devdoot Majumdar博士。 SARS-CoV-2病毒会产生大约30种病毒蛋白。在这项新的研究中，Guttman实验室检查了其中的每一种，并绘制了它们如何与实验室培养皿中培养的人体细胞内的分子成分相互作用。他们发现SARS-CoV-2蛋白会攻击三个关键的细胞过程，以破坏人类蛋白的产生。 论文共同第一作者、佛蒙特大学的Emily Bruce说，“病毒太了不起了。病毒和宿主细胞不断进行进化军备竞赛，以战胜对方。SARS-CoV-2已进化出复杂而特殊的方法来使宿主细胞丧失功能，而不会直接杀死它们，这样这种病毒仍然可以利用宿主细胞达到它自己的目的。” 先介绍一些基本的细胞生物学背景：细胞核容纳着细胞的遗传物质（基因组DNA）。细胞基因组可以被看作是一本综合性的指导手册，比如它的“章节”可能被命名为“如何发送信号”或者“在病毒感染的情况下该怎么做”。细胞的其余部分包含合成执行这些指令的蛋白（如干扰素）的分子机器。 将DNA指令转化为有用的蛋白的过程被称为生物学的“中心法则”。第一步是转录，即细胞核中的一段DNA被读取并产生一种称为mRNA的分子，mRNA可以离开细胞核并迁移到细胞的其余部分。在从细胞核中迁出之前，mRNA通常会在一种称为“剪接（splicing）”的过程中重新组装和“成熟”。 当mRNA从细胞核中输出后，细胞中的一种称为核糖体的分子机器会附着在成熟的mRNA上，读取它，并通过一种称为翻译的过程制造相应的蛋白。 其中的一些蛋白可以从初始的细胞中迁移出去而向其他细胞传递信息，比如警告病毒感染的存在。在这种情况下，另一种称为信号识别颗粒（signal recognition particle, SPR）的分子机器就会发挥作用：它作为一种运输系统，协助蛋白从细胞内移动到细胞外。这就是所谓的蛋白运输。 Guttman实验室发现SARS-CoV-2蛋白在多个阶段干扰了这整个过程。这种病毒的一些蛋白阻止人体细胞mRNA完全剪接和正确组装。另一些蛋白则堵塞了核糖体，使得它无法形成新的蛋白。还有一些SARS-CoV-2蛋白干扰信号识别颗粒，从而阻止蛋白运输。 堵塞核糖体的病毒蛋白叫做NSP1。值得注意的是，这些研究人员发现，NSP1阻止人类mRNA进入核糖体，但允许病毒mRNA顺利通过。每一种病毒mRNA在它的开始处都包含遗传签名（genetic signature），该遗传签名像存取密码那样起作用，使得每种病毒mRNA有效地劫持核糖体来制病毒蛋白，而不是人体蛋白。鉴于病毒生产依赖于这种遗传签名，它可能代表了一种强效的用于开发抗病毒疗法的靶标。 Guttman说，“SARS-CoV-2破坏的每一种过程---剪接、翻译和蛋白运输---对于将人类的遗传物质转化为蛋白质非常重要，它们对于人类生物学来说是必不可少的。事实上，这些过程中每一种的发现都分别导致了诺贝尔奖的颁发。这些过程对生命至关重要。没有它们，我们就无法生存。SARS-CoV-2以非常特殊的方式进化，使得这些过程失去功能，破坏它们的功能。” 论文共同第一作者、Guttman实验室研究生Abhik Banerjee说，“我们的研究说明了基础科学研究的重要性，并建立了一条管道来解决未来新出现的RNA病毒。此外，它还说明了加州理工学院和科学界其他地方的科学合作氛围是非常好的。” 论文共同第一作者、Guttman实验室研究员Mario Blanco对此表示同意，“我们研究SARS-CoV-2蛋白识别人类RNA靶标的能力使得我们能够在没有事先证据的情况下确定这些机制。我们在这项研究中开发的方法措施将使得我们能够将这些相同的过程应用于新出现的疾病，甚至是目前存在的我们对作用机制缺乏深刻理解的病毒。”
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  • 《8月6日_抑制PIKfyve激酶可防止Zaire埃博拉病毒和SARS-CoV-2感染》
    • 来源专题：COVID-19科研动态监测
    • 编译者：zhangmin
    • 发布时间：2020-08-18
    • PNAS于8月6日发表了哈佛医学院、波士顿儿童医院等机构的文章“Inhibition of PIKfyve kinase prevents infection by Zaire ebolavirus and SARS-CoV-2”。 文章指数，病毒侵入细胞是一个多步骤过程。从病毒附着到宿主细胞开始，并在病毒内容物到达胞质溶胶时终止。与遗传无关的病毒可以破坏类似的亚细胞机制，并使用类似的运输途径成功进入细胞。因此，针对感染早期步骤的抗病毒策略很有吸引力，尤其是通过一个常见步骤成功进行干预的可能性最高时。研究人员描述了Apilimod和Vacuolin-1对含有Zaire埃博拉病毒或SARS-CoV-2 包膜蛋白的嵌合水泡性口腔炎病毒（VSV）（分别称为VSV-ZEBOV或VSV-SARS-CoV-2）内容物释放和感染的有效抑制作用，Apilimod和Vacuolin-1是核内体磷脂酰肌醇-3-磷酸/磷脂酰肌醇5-激酶PIKfyve的小分子抑制剂。研究人员还描述了Apilimod对SARS-CoV-2毒株2019-nCoV / USA-WA1 / 2020的有效抑制作用。这些结果表明通过抑制PIKfyve激酶可以抑制病原体在细胞内运输，并提示在开发针对SARS-CoV-2的小分子抗病毒药物时靶向该激酶具有潜力。 原文链接：https://www.pnas.org/content/early/2020/08/05/2007837117#abstract-2
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