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《Cell | 光合作用机制调控和生物发生的基因的系统识别和角色塑造》

  • 来源专题：战略生物资源
  • 编译者： 李康音
  • 发布时间：2023-12-10

  • 2023年12月7日，普林斯顿大学等机构的研究人员在Cell上发表了题为Systematic identification and characterization of genes in the regulation and biogenesis of photosynthetic machinery的文章。

    光合作用是粮食生产和地球生物地球化学的核心，然而对其调控的分子基础知之甚少。

    该研究使用真核藻类莱茵衣藻模型中的高通量遗传学技术，以高信心(错误发现率[ FDR ] < 0.11)鉴定了光合作用所需的70个缺乏特征的基因。然后，研究人员通过提供突变菌株的蛋白质组资源来实现这些基因的功能角色塑造，每个突变菌株都缺少一个这样的基因。这些数据允许将34个基因分配到一个或多个特定的光合作用复合物的生物发生或调控中。进一步的分析揭示了至少七种蛋白质的生物发生/调节作用，包括五种光系统 I mRNA 成熟因子，叶绿体翻译因子 MTF1和通过核表达因子调节叶绿体基因的主调节因子 PMR1。

    该研究提供了丰富的资源，确定调控和功能基因，并把它们放入途径，从而打开了系统级的理解光合作用的大门。

  • 原文来源：https://www.sciencedirect.com/science/article/pii/S0092867423012242
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  • 《Cell | DNA引导的转录因子协同作用塑造面部》
    • 来源专题：战略生物资源
    • 编译者：李康音
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    • 2024年1月22日，斯坦福大学Joanna Wysocka团队在Cell发表题为DNA-guided transcription factor cooperativity shapes face and limb mesenchyme的文章。 研究人员在前期意外发现了一个17个碱基对的DNA序列模式，具有内源性细胞功能，命名为Coordinator ，通过比较人类和黑猩猩面部祖细胞（CNCCs）的增强子景观，并分析潜在的DNA序列变化，发现了Coordinator的增加和减少与增强子活性变化相关，进一步分析发现Coordinator motif比任何已知motif都能更好地预测增强子活性。该基序未被注释为调控因子，但研究者注意到Coordinator包含由许多HD因子结合的TAATT[a /G]基序和由大多数bHLH因子结合的CANNTG E-box基序。 因此，研究试图系统地识别结合Coordinator 的TFs如何独特地定义胚胎面部和肢体间充质的调控区域，确定它们在内源性细胞环境中的分子功能，并分析它们的协同性和选择性的机制。研究发现Coordinator指导bHLH家族间质调节因子TWIST1和一组与面部和肢体区域特性相关的HD因子之间的合作和选择性结合。TWIST1招募了HD因子的结合，打开Coordinator位点染色质开发程度，同时HD因子稳定了TWIST1在Coordinator的占位，并使TWIST1远离那些没有HD因子的位点。这种合作导致参与细胞类型和位置身份的基因共享调节，并最终形成面部形态和进化。
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