β-内酰胺环代表有价值的部分,可以诱导抑制剂与其靶标共价结合。在这项研究中,我们探索了具有β-内酰胺亲电战斗部的二肽和三肽,作为登革热和西尼罗河病毒NS2B-NS3蛋白酶的抑制剂。具有(3S)-β-内酰胺部分的三肽显示出最高的活性,在生化和细胞分析中IC50和EC50值在较低的微摩尔范围内。对登革热蛋白酶的活性通常高于对西尼罗河病毒蛋白酶的活性。该化合物对脱靶凝血酶和胰蛋白酶无活性。 LC-MS实验表明三肽-β-内酰胺抑制剂以两种不同的结合方式与蛋白酶结合。仅一种结合模式导致β-内酰胺环与催化丝氨酸共价但可逆的相互作用,随后释放具有开放的β-内酰胺环的抑制剂。其他结合方式导致肽主链的裂解。该观察结果提供了第一个实验证据,表明黄病毒蛋白酶抑制剂中的苄氧基苯基甘氨酸位于酶的主要位点。