欢迎收看2020年12月4日的《研究综述》，这是一篇由Broad研究所的科学家及其合作者发表的最新研究的回顾。
新的工具有助于研究自闭症风险基因
通常，了解疾病基因的作用需要对每个基因进行深入研究。鑫金共同领导的研究小组,肖恩·西蒙斯,艾米郭,Ashwin Shetty,局域网Nguyen研究所成员伊莉斯·罗宾逊斯坦利精神病学研究中心的资深组长细胞天文台,约书亚·莱文的卡拉曼研究所成员Paola Arlotta斯坦利中心(也),冯张核心协会成员,和前核心研究所成员特拉维夫Regev Perturb-Seq使用基因泰克(现在),基因编辑和单cell-sequencing系统,在小鼠大脑发育的体内，同时研究35个与自闭症谱系障碍(ASDs)有关的基因在多种不同细胞类型中的功能。用这种方法，作者确定了神经细胞和神经胶质细胞的基因表达网络，提示了asd相关基因的新功能。请阅读《科学》和这个哈佛的故事。
BAF突变与发育障碍有关
染色质重塑swif - snf(或BAF)复合物的一些突变与罕见的神经发育和智力障碍有关。研究人员布列塔尼·米歇尔、表观基因组学项目的联合主任Cigall Kadoch和他的同事们发现，BICRA的罕见变异与类似的疾病有关，BICRA编码了ncBAF复合体亚基。研究小组确定了12个患有这些罕见变异的个体，他们有发育迟缓和其他与BAF复合体相关的智力障碍相关的特征。在斑马鱼中，BICRA同源生物的突变模仿了一些人类的表型。请阅读《美国人类遗传学杂志》。
糖尿病药物开发的新维度
在开发1型糖尿病(T1D)中触发胰腺细胞再生疗法的一个障碍是缺乏高保真度的细胞培养系统。写在科学进步,Kisuk杨Miseon李彼得•琼斯(BWH)准成员Amit乔杜里和杰弗里·卡普的化学生物学和疗法的科学程序和布莱根妇女医院(BWH),和他的同事们现在Disque平台(DP),一个系统,汇集了β细胞干细胞成薄3 d磁盘在2 d文化板块,从而结合2 d和3 d系统的优点。在Choudhary实验室的推文中了解更多关于DP如何帮助他们努力为T1D开发基于锌的前药。
防止Cas9四处游荡
如果Cas9在细胞中保持活跃时间过长，它会导致各种不受欢迎的结果，这就突出了控制细胞寿命的需要。Vedagopuram Sreekanth, Qingxuan Zhou, Praveen Kokkonda, Choudhary和他的同事已经设计了一种称为降解标签系统(dTAG)的化学发生方法，它使Cas9接近泛素连接酶，标记Cas酶，以便通过细胞的蛋白酶体降解。通过调节Cas9的停留时间，dTAG允许团队微调基因编辑结果，减少脱靶效应。更多信息请访问ACS中心科学。
新基因驱动在黑色素瘤中被发现
癌症项目副成员Eliezer Van Allen和他的同事们揭示了黑素瘤四种基因亚型中新的基因驱动和治疗弱点。他们对扩大的黑色素瘤全外显子组测序数据进行了协调统一的基因组分析，并发现了一个复杂的二级基因组结构，包括多种以前不知道与疾病有关的致癌驱动因素。研究小组发现，在四种癌症亚型(BRAF、(N)RAS、NF1和三重野生型)之间存在明显不同的整体基因组特性，以及次级驱动基因的亚型偏好。他们的荟萃分析显示了进一步生物学和治疗研究的各种机会。请阅读《自然遗传学》。
影响GWAS的多样性
以欧洲为中心的遗传学研究，以及对共同的因果变异的有限认识，使得将多基因风险评分应用到其他祖先上变得困难。现在，Tiffany Amariuta, Kazuyoshi Ishigaki，研究所成员Soumya Raychaudhuri和他的同事们已经创建了一个包含707个细胞类型特异性调控注释的概要来分析111个复杂的特征和疾病在欧洲和东亚的人口。他们的研究发表在《自然遗传学》上，证明了一种之前开发的名为“影响”的注释策略可以对等位基因进行优先排序。这些优先的等位基因，反过来，可以改善人群间遗传数据的比较和多基因风险评分模型的跨祖先可移植性使用的血统不匹配的数据。这项研究说明了需要从未被研究的群体中获得更多的基因数据。
映射监管网络
破译调控基因表达的网络是理解人类生物学和疾病的关键。一个由林林(BWH)领导的团队，在大卫·吉福德(David Gifford)及其同事的监督下，描述了一种被称为HIGAN(基因中心激活网络的高通量审问)的系统方法，用于发现和绘制这些网络。研究人员在两种细胞系中应用了这套多面基因组方法，以探索癌症相关基因APOBEC3B是如何被调控的。了解更多关于他们的发现在细胞报告。
免疫抑制变得具体
以抗原特异性方式重建免疫耐受的治疗方法将避免目前用于治疗自身免疫性疾病的非特异性免疫抑制剂的不良副作用。免疫学计划的准成员Francisco Quintana和BWH, Jessica Kenison(波士顿大学)等人使用纳米脂质体平台通过调节芳基烃受体信号诱导抗原特异性耐受。纳米脂质体治疗可抑制临床前多发性硬化模型的疾病病理和致病性自身免疫。《美国国家科学院院刊》(PNAS)报道，这项工作表明，纳米脂质体被设计用来递送致性小分子和疾病相关抗原，可能是一种管理自身免疫性疾病的新方法。
