《美洲印第安人中分析:SLC16A11基因与2型糖尿病的关联》

  • 来源专题:重大新药创制—内分泌代谢
  • 编译者: 李永洁2
  • 发布时间:2016-01-27
  • 最近报道,SLC16A11基因变异与墨西哥和其他拉美人口患2型糖尿病有关。糖尿病风险单倍型基因在墨西哥土著中有50%的概率,但是少见于欧洲人和非洲人。在目前的研究中,我们分析了北美印第安人SLC16A11基因,发现患糖尿病的风险单倍型,rs75493593 A等位基因,统计学上与2型糖尿病患者(P = 0.001,比值比为1.11)有关。 rs75493593与2型糖尿病的BMI显著相关(P = 3.4×10-15),但不是在无糖尿病个体中BMI无相关(P = 0.77)。纵向分析表明,这是由于,糖尿病发病与A等位基因的关联。从脂肪组织,骨骼肌,和全血的基因表达数据的分析提供的证据表明rs75493593与附近RNASEK基因的表达相关,这表明RNASEK表达可能介导基因型对糖尿病的影响。

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    • 宗旨/假设 2型糖尿病的全基因组关联研究(GWAS)已发现> 400个风险位点,主要是在欧洲和亚洲血统的人群中。在这里,我们旨在通过在非洲人群中进行遗传分析来发现其他2型糖尿病风险基因座(包括非洲特异性变异体)和精细图谱关联信号。 方法 我们对来自南非,尼日利亚,加纳和肯尼亚的4347名非洲人进行了两项2型糖尿病全基因组关联研究,并对这两项研究进行了荟萃分析。使用精细映射方法识别可能的因果变体。 结果 最显着相关的变体定位于TCF7L2附近广泛复制的2型糖尿病风险基因座(p = 5.3×10-13)。 TCF7L2基因座的精细定位表明欧洲人和非洲人之间共享一种2型糖尿病协会信号(由rs7903146索引)和非洲特异性信号(由rs17746147索引)。我们还在AGMO附近检测到一个新信号rs73284431(p = 5.2×10-9,次要等位基因频率[MAF] = 0.095;在大多数非非洲人群中是单态的),不同于该地区先前报道的信号。在针对100个已发表的2型糖尿病风险基因座的分析中,我们确定21个在非洲和非非洲人群中具有共同的因果变异。 结论/解释 这些结果证明了在非洲人中进行GWAS的价值,为更大的财团提供了进一步发现和精细定位的资源,并表明非洲的其他大规模努力有必要进一步了解2型糖尿病的遗传结构。
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