3月6日,bioRxiv预印平台预印发表了阿卜杜拉国王科技大学等预发表的文章“Functional pangenome analysis suggests inhibition of the protein E as a readily available therapy for COVID-2019”。
文章显示,新型冠状病毒(SARS-CoV-2)的传播已经引发了一场全球紧急事件,这需要紧急的检测和治疗方法,以防止不断升级的健康、社会和经济影响。新型冠状病毒的突刺蛋白(S蛋白)能够与人类受体ACE2结合,因此S蛋白成为疫苗预防病毒进入宿主细胞的首要目标。虽然来自SARS-CoV-1和SARS-CoV-2的S蛋白相似,但受体结合域(RBD)的结构差异阻止了SARS-CoV-1特异性中和抗体对SARS-CoV-2的抑制。文中使用比较泛基因组方法分析了所有已测序的β冠状病毒序列,结果显示,在这些病毒的所有核心基因簇中,包膜蛋白E显示了SARS和SARS-Cov-2两个共有的一种变异,具有两个完全保守的关键功能特征:离子通道和PDZ-结合基序(PBM)。这些特征触发细胞激素风暴同时激活炎症小体,导致肺水肿增加,导致急性呼吸窘迫综合征(ARDS),这是导致SARS-CoV-1和SARS-CoV-2感染死亡的主要原因。然而,三种已批准用于人类的药物可能抑制SARS-CoV-1和SARS-CoV-2蛋白E,它们可能作用于离子通道(金刚烷胺和六亚甲基胺洛赖德)或PBM (SB203580),从而潜在地增加宿主的生存,正如已经在动物模型中针对SARS-CoV-1所证明的那样。因此,阻断SARS蛋白E可在体内抑制ARDS的发生发展。文章结果指出,SARS进化枝的蛋白E子集群是SARS-CoV-1 SARS-CoV-2的类同的重点功能区域,使用批准药物显示作为SARS E蛋白抑制剂可以防止COVID-2019进一步的伤亡,针对于此的疫苗和其他预防措施正在研发中。
*注,本文为预印本论文手稿,是未经同行评审的初步报告,其观点仅供科研同行交流,并不是结论性内容,请使用者谨慎使用。