《博物馆标本中的猴痘病毒基因组与1965年动物园爆发之间的联系》

  • 编译者: 张玢
  • 发布时间:2024-08-20
  • 我们报告了与1965年来到德国波恩的亚历山大·科尼希动物学研究博物馆的4个猩猩(Pongo sp.)标本相关的发现,最初据报道它们是来自苏门答腊的野生动物。我们从猩猩的牙齿中提取了DNA,构建了基因组文库(附录图1),进行了shotgun测序,并使用了一个针对各种DNA病毒的杂交捕获诱饵集。


    其中两个标本显示出足够的内源性DNA含量,从基因组学上验证了它们的分类归属为苏门答腊猩猩(Pongo abelii)(附录图2)。我们的分析发现人类污染水平较低(0.7%–1.1%),插入片段大小短,与降解的DNA一致,但没有典型于古代DNA的脱氨酶模式(附录)。我们使用Kraken2(https://github.com/DerrickWood/kraken2External Link)对捕获的数据进行分类分析,发现了MPXV的存在。


    MPXV很可能与分布在整个非洲的储备宿主物种有关。由于这种病毒偶尔传播到非洲之外,我们进一步调查了MPXV阳性猩猩的起源和历史。我们要求博物馆提供了一封来自荷兰野生动物交易商的信函,该交易商在1965年将这些标本卖给了博物馆。这封信指出这些标本原本来自1964年的动物园囚禁动物,而不是来自苏门答腊的野生动物。这封信没有指明这些动物是从哪个动物园获得的。

    研究人员使用病原体基因组学来测试来自德国波恩博物馆的猩猩标本,以确定动物的起源和死亡情况。在样本中发现了猴痘病毒基因组,并确定它们代表了 1965 年荷兰鹿特丹动物园爆发的病例。


    H?mmerle M, Rymbekova A, Gelabert P, Sawyer S, Cheronet O, Bernardi P, et al. Link between monkeypox virus genomes from museum specimens and 1965 zoo outbreak. Emerg Infect Dis. 2024 Apr [date cited]. https://doi.org/10.3201/eid3004.231546

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