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《从横断面病毒载量分布估计流行病学动态》

  • 来源专题：新发突发疾病（新型冠状病毒肺炎）
  • 编译者： 蒋君
  • 发布时间：2021-06-10

  • 估计流行病的轨迹对于制定针对传染病的公共卫生防控对策至关重要。2021年6月3日，美国哈佛大学的研究表明，在随机或基于症状的监测下观察到的病毒载量的群体分布，以逆转录定量聚合酶链反应检测获得的周期阈值（Ct）的形式在流行期间是发生变化的[]。因此，即使是有限数量的随机样本的Ct值也可以提供对流行病轨迹的改进估计。对来自多个此类样本的数据进行组合可提高此类估计的精度和稳健性。研究人员将此方法应用于SARS-CoV-2大流行期间在各种环境下进行Ct值监测，并为疫情管理和应对提供了实时估计疫情轨迹的替代方法。

  • 原文来源：;https://science.sciencemag.org/content/early/2021/06/02/science.abh0635.long
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  • 《基于网络监测的 COVID-19流行前期全球流行病学横断面分析》
    • 来源专题：新发突发疾病（新型冠状病毒肺炎）
    • 编译者：蒋君
    • 发布时间：2020-08-19
    • 背景：关于严重急性呼吸系统综合征冠状病毒2型（SARS-CoV-2）的全球传播模式和中国大陆以外地区COVID-19早期确诊病例的全球流行病学资料很少。我们描述了SARS-CoV-2在全球范围内的传播，以及COVID-19病例和集群的特征。方法：从国家卫生部或其他政府机构的官方网站、新闻稿、记者招待会记录和社交媒体上每天确认2019年12月31日至2020年3月10日（即准备阶段）报告的COVID-19病例。病例特征，旅行史，和暴露于其他病例的摘要。至少有一个病例的国家被列为受影响国家。早期病例是指每个国家报告的前100例病例中的病例。后发病例定义为前100例后的病例。我们分析了中国大陆以外每个国家报告的第一例受感染国家的旅行报告、具有年龄或性别信息的病例的人口统计学和接触特征，以及按传播环境划分的集群频率和规模。调查结果：在中国大陆以外99个受影响国家报告的第一例病例中，75例（76%）近期曾前往受影响国家；60例（61%）曾前往中国、意大利或伊朗。在1200例有年龄或性别信息的病例中，874例（73%）为早期病例。在762例有年龄信息的早期病例中，中位年龄为51岁（iqr35-63）；762例早期病例中25例（3%）发生在18岁以下。总的来说，1200例中有21例（2%）是卫生保健工作者，没有一例是孕妇。共发现101个群体，其中最常见的传播环境是家庭（76例[75%）；每个群体平均2.6例[范围2-7]），其次是非卫生保健职业环境（14[14%]；每个集群平均4.3例[2-14]），以及社区聚集（11[11%]；平均每个集群14.2例[4-36]）。解读：与中国、意大利或伊朗有旅行联系的病例几乎占受影响国家首次报告的COVID-19病例的三分之二。在有年龄资料的病例中，大多数是18岁及以上的成年人。虽然早期病例中有许多家庭传播集群，但职业或社区环境中的集群往往更大，这支持了物理距离对减缓SARS-CoV-2传播进程的可能作用。-Lancet Infect Dis
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  • 《科学认识人群新冠病毒抗体流行率——全国新冠肺炎血清流行病学调查结果问答》
    • 来源专题：中国科学院病毒学领域知识资源中心
    • 编译者：malili
    • 发布时间：2020-12-30
    • 近期，中国疾控中心组织完成全国新冠肺炎血清流行病学调查和分析。此次调查旨在了解新冠肺炎不同流行水平地区普通人群新冠病毒感染情况，加深对新冠肺炎感染特征的科学认识，评估我国疫情防控效果。 调查涵盖三类地区，包括武汉市、湖北武汉之外市州、以及湖北之外六个省份（北京、辽宁、上海、江苏、广东和四川），采用抽样调查设计选取社区人群3.4万余人，通过检测调查对象的血清新冠病毒抗体，估计人群中新冠病毒的感染水平。调查采用横断面调查方法，调查时点选取我国遏制第一波新冠肺炎疫情的一个月后开展。调查发现武汉地区的社区人群新冠抗体阳性率4.43%，湖北武汉外市州抗体阳性率0.44%，而湖北之外六省份的1.2万余人中仅检测到2例抗体阳性，阳性率极低。曾接触过新冠肺炎确诊病例的人群抗体阳性率明显高于其他人群，中老年人群抗体阳性率高于其他年龄段人群。 调查结果显示，我国人群总体处于低感染水平，表明以武汉为主战场的疫情控制取得成功，有效防止了疫情大规模扩散。 为便于公众科学认知本次血清流行病学调查，我中心组织相关专家撰写了以下问答。 1什么是血清流行病学调查？ 血清流行病学调查是采用血清学方法和技术开展的流行病学调查，通过对人群血清中特异性抗原或抗体的分布规律及其影响因素的分析研究，阐明传染性疾病的发生与流行的规律，评价预防接种的效果等。 本次新冠肺炎血清流行病学调查是在我国遏制第一波新冠肺炎疫情的一个月后，在代表性地区开展的横断面调查，通过在人群中进行有代表性的抽样，采集血清标本进行抗体检测，了解新冠病毒在人群中的感染水平。 2什么是抗体？ 一般情况下，新冠病毒感染人体后，体内病毒的复制可刺激机体产生特异性抗体，抗体往往可持续较长时间。感染者体内的新冠病毒中和抗体可抑制病毒复制，从而对人体起到保护作用。体内检测到新冠特异性抗体，表明既往可能感染过新冠病毒。 3什么是新冠病毒人群感染率？ 通过一定的抽样规则在目标人群中选取调查对象进行新冠病毒抗体检测，可计算该人群的抗体阳性率，在未曾接种过疫苗时，反映过去一段时间内该人群中累积的新冠病毒感染率。 4这次血清学调查有什么特点？ 本次血清学调查是以社区人群为对象，采用了良好的抽样设计，人群代表性较好。抗体检测采用了多种试剂并联初筛，随后再采用细胞微量中和试验复核的检测策略，最大程度保证了检测策略的灵敏度和特异度。 5这次血清学调查结果 与国外其他调查结果比较如何？ 本次调查是国内首次对不同流行水平地区基于人群的大规模新冠血清抗体阳性率调查。在其他国家开展的全国代表性调查发现，经过第一波流行后，人群感染率总体较低。西班牙于4月27日至5月11日开展的两阶段随机抽样调查发现，全国平均血清抗体阳性率在3.7%-6.2%范围内。瑞士于4月6日至5月9日开展的全国代表性人群队列的追踪研究发现，第5周时抗体阳性率约11%。 6本次调查与前期武汉开展的 人群大规模核酸筛查有何区别？ 1调查目的不同 血清流行病学调查的目的是了解人群新冠病毒既往感染状况，而人群大规模核酸筛查的目的是搜索发现现有病毒感染者。 2检测方法不同 血清流行病学调查是检测血清中新冠病毒的抗体水平，而人群大规模核酸筛查是使用PCR方法检测新冠病毒核酸片段。 3结果意义不同 人体血清中检测到特异性抗体（即抗体阳性）表明其为既往感染者，若进一步检测核酸结果为阴性，则表明该既往感染者体内病毒已被清除，不具有传染性。若核酸检测阳性，无论抗体检测结果如何，均表明该个体可能处于带毒状态，属于潜在传染源，尤其在病毒载量较高的潜伏期末和急性期传染性较高，提示需要对其进行隔离或救治，防止病毒传播。(生物谷Bioon.com）
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