1.时间：2020年1月25日
2.机构或团队：复旦大学、同济医学院武汉市中心医院、武汉市疾病预防控制中心、中国疾病预防控制中心传染病预防控制所、悉尼大学玛丽•巴希尔传染病与生物安全研究所
3.事件概要：
同济医学院武汉市中心医院与复旦大学等研究人员从武汉市中心医院收治的一名严重呼吸系统疾病患者的支气管肺泡灌洗液进行宏基因组RNA测序，其组装和表征结果与1月25日发表在bioRxiv预印版平台，题为“Complete genome characterization of a novel coronavirus associated with severe human respiratory disease in Wuhan, China”。通过组装分析，一个最长的重叠群具有很高的丰度，并且与蝙蝠SARS样冠状病毒分离株bat-SL-CoVZC45（GenBank登录号MG772933）密切相关，一致性为89.1％。将该新病毒命名为WH-1型冠状病毒（WH-Human 1 coronavirus, WHCV）（也称为“ 2019-nCoV”），其整个基因组序列（29,903 nt）GenBank登录号MN908947。
为了确定WHCV与先前鉴定的冠状病毒之间的进化关系，研究人员基于整个基因组序列的核苷酸序列，非结构蛋白基因ORF1a和1b以及主要结构估算了系统发育树。在所有系统发育中，WHCV都与Sarbecovirus亚属成员聚集在一起。但是，基于不同基因的系统发育树，WHCV在Sarbecovirus亚型内的拓扑位置改变，这暗示了该病毒具有重组历史。
为了更好地了解WHCV感染人类的潜力，研究人员将其刺突蛋白的受体结合结构域（RBD）与SARS-CoV和蝙蝠SARS样冠状病毒中的受体结合结构域进行了比较。WHCV的RBD序列与SARS-CoV的RBD序列（73.8％-74.9％氨基酸一致性和SARS样冠状病毒的RB4874、Rs7327和Rs4231毒株（75.9％-76.9％氨基酸一致性）密切相关，这些冠状病毒均可以利用ACE2受体进入细胞。并且，与序列比对一致，WHCV的三位预测结构也与SARS-CoV的蛋白质结构密切相关，这些数据表明WHCV可以有效地利用ACE2受体进入细胞，可能促进人对人的传播。
WHCV与蝙蝠冠状病毒最密切相关，甚至nsp7和E蛋白中与Bat-SL-CoVZC45表现出100％的氨基酸相似性。这些数据表明蝙蝠可能是WHCV的宿主。但是，由于首次报告该病时市场上有多种动物在出售，因此需要更多的工作来确定WHCV的天然宿主和任何中间宿主。
4.附件：
链接：https://www.biorxiv.org/content/10.1101/2020.01.24.919183v1
原文：https://www.biorxiv.org/content/10.1101/2020.01.24.919183v1.full.pdf
