在过去的二十年中，全世界经历了三起冠状病毒爆发，发病率上升。当前，全球社会正面临着Beta冠状病毒属的新兴病毒SARS-CoV-2病毒爆发，该病毒似乎比SARS-CoV更易传播，但致命性更低。当前的这项研究目的是在追踪SARS-CoV-2.进化祖先和不同的进化策略。我们的全基因组分析表明，SARS-CoV-2是蝙蝠SARS / SARS状CoV的后代，蝙蝠充当了天然宿主。 SARS-CoV-2使用突变和重组作为包膜，膜，核衣壳和刺突糖蛋白等不同基因组区域的关键策略，成为一种新型的传染原。我们证实，SARS-CoV-2不同基因组区域中的突变对病毒繁殖适应性具有特定影响，从而可以在快速变化的环境中进行基因型调整和适应。此外，我们首次在SARS-CoV-2中鉴定了九种推定的重组模式，其中包括尖峰糖蛋白，RdRp，解旋酶和ORF3a。在S基因中发现了六个重组区，这无疑对进化存活很重要，与此同时，这使得病毒可以修饰表面抗原性，从而找到一种从动物免疫侦察中适应人类宿主的方法。通过这些自然选择的策略，SARS-CoV-2成为人类社会中的一种新型病毒。
