《新型蝙蝠冠状病毒的鉴定揭示了 SARS-CoV-2 和相关病毒的进化起源》

  • 来源专题:新发突发疾病(新型冠状病毒肺炎)
  • 编译者: 蒋君
  • 发布时间:2021-06-21
  • 山东第一医科大学/山东省医学科学院和中国科学院西双版纳热带植物园在Cell 在线发表题为“Identification of novel bat coronaviruses sheds light on the evolutionary origins of SARS-CoV-2 and related viruses”的研究论文。研究人员描述了 2019 年 5 月至 2020 年 11 月期间在中国云南省一个小地理区域收集的 411 个蝙蝠样本的转录组学研究。鉴定了 24 个全长冠状病毒基因组,包括四个新型 SARS-CoV-2 相关病毒和三个 SARS-CoV 相关病毒。Rhinolophus pusillus病毒 RpYN06 在大部分基因组中是 SARS-CoV-2 的近亲,尽管它具有更多样化的刺突基因。其他三种与 SARS-CoV-2 相关的冠状病毒携带一个基因上独特的刺突基因,可以在体外与 hACE2 受体弱结合。生态模型预测了多达 23 种Rhinolophus蝙蝠物种的共存,最大的连续热点从老挝南部和越南延伸到中国南部。该研究强调了蝙蝠冠状病毒在当地范围内的显著多样性,包括 SARS-CoV-2 和 SARS-CoV 的近亲。

  • 原文来源:;https://www.sciencedirect.com/science/article/pii/S0092867421007091?via%3Dihub
相关报告
  • 《新型冠状病毒SARS-CoV-2的进化轨迹》

    • 来源专题:实验室生物安全
    • 编译者:张虎
    • 发布时间:2020-04-07
    • 在过去的二十年中,全世界经历了三起冠状病毒爆发,发病率上升。当前,全球社会正面临着Beta冠状病毒属的新兴病毒SARS-CoV-2病毒爆发,该病毒似乎比SARS-CoV更易传播,但致命性更低。当前的这项研究目的是在追踪SARS-CoV-2.进化祖先和不同的进化策略。我们的全基因组分析表明,SARS-CoV-2是蝙蝠SARS / SARS状CoV的后代,蝙蝠充当了天然宿主。 SARS-CoV-2使用突变和重组作为包膜,膜,核衣壳和刺突糖蛋白等不同基因组区域的关键策略,成为一种新型的传染原。我们证实,SARS-CoV-2不同基因组区域中的突变对病毒繁殖适应性具有特定影响,从而可以在快速变化的环境中进行基因型调整和适应。此外,我们首次在SARS-CoV-2中鉴定了九种推定的重组模式,其中包括尖峰糖蛋白,RdRp,解旋酶和ORF3a。在S基因中发现了六个重组区,这无疑对进化存活很重要,与此同时,这使得病毒可以修饰表面抗原性,从而找到一种从动物免疫侦察中适应人类宿主的方法。通过这些自然选择的策略,SARS-CoV-2成为人类社会中的一种新型病毒。
  • 《蝙蝠SARS相关冠状病毒的地理结构。》

    • 来源专题:实验室生物安全
    • 编译者:张虎
    • 发布时间:2019-05-16
    • 蝙蝠是严重急性呼吸系统综合症冠状病毒(SARS-CoV)的天然宿主,导致2002  -  2003年人类SARS爆发。 我们介绍了在蝙蝠中发现的SARS相关冠状病毒(SARSr-CoVs)的遗传多样性,并提供了人类SARS蝙蝠起源的见解。 我们还分析了病毒的地理结构,可以提高我们对蝙蝠SARSr-CoV进化的理解。