《4月3日_利用流感样疾病监测数据来重新估计美国各州的检出率并预测SARS-CoV-2在美国的传播情况》

  • 来源专题:COVID-19科研动态监测
  • 编译者: zhangmin
  • 发布时间:2020-04-07
  • 1.时间:2020年4月3日

    2.机构或团队:宾夕法尼亚州立大学、蒙大拿州立大学

    3.事件概要:

    4月3日,medRxiv预印本平台发表了来自宾夕法尼亚州立大学、蒙大拿州立大学研究团队题为“Using ILI surveillance to estimate state-specific case detection rates and forecast SARS-CoV-2 spread in the United States”的文章。

    该文章认为SARS-CoV-2的检测以RT-PCR测试为主,囿于方法的局限性可能导致计算的感染率较低,该文章旨在利用可公开获得的CDC流感样疾病(ILI)门诊监测数据重新用于估计有症状SARS-CoV-2感染的检出率。该文章指出,非流感ILI的激增高于季节性平均值,并表明该激增与各州的COVID-19病例数相关。通过量化3月相对于往年3月的过量ILI患者数量,并将过量ILI与确诊的COVID-19病例数进行比较,该文章估计在美国,SARS-CoV-2的症状病例检出率为1/100至1/1000。这相当于从2020年3月15日开始的一周,全美大约1000万有症状的SARS-CoV-2症状患者。该文章指出,结合过量的ILI计数与美国社区传播的开始日期,美国的早期流行病不可能比每三天翻一倍慢,这些结果共同表明了一个美国COVID-19流行的概念模型。该文章强调使用血清阳性率数据测试这些发现的重要性,并讨论将门诊时间序列重新用于早期发现和了解新发传染病的广泛潜力。

    *注,本文为预印本论文手稿,是未经同行评审的初步报告,其观点仅供科研同行交流,并不是结论性内容,请使用者谨慎使用。

    4.附件:

    原文链接https://www.medrxiv.org/content/10.1101/2020.04.01.20050542v1

  • 原文来源:https://www.medrxiv.org/content/10.1101/2020.04.01.20050542v1
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    • 信息名称:2020年4月10-11日,美国加州洛杉矶县进行该县成人SARS-CoV-2特异性抗体的血清检测 1.时间:2020年5月18日 2.机构或团队:加州大学洛杉矶分校、洛杉矶县公共卫生部、犹他州盐湖城运动医学研究与测试实验室、洛杉矶LRW集团公司、犹他州盐湖城运动医学研究与测试实验室、斯坦福大学医学院 3.事件概要: 5月18日,JAMA发表了题为“Seroprevalence of SARS-CoV-2–Specific Antibodies Among Adults in Los Angeles County, California, on April 10-11, 2020”的文章。 对COVID-19流行程度的了解不足对公共卫生应对和规划构成了挑战。当前大多数报告的确诊病例依赖于基于PCR的检测。这种对确诊病例的估计漏掉了从感染中恢复的个体、有轻微或无症状的个体以及由于检测能力有限而没有检测到症状的个体。本文中对一个社区人群样本进行了血清学检测,以估计SARS-CoV-2感染的累积发病率,因为血清学检测可以同时确定当前和过去感染的情况。 这项研究得到了洛杉矶县公共卫生机构审查委员会的批准,并获得了书面知情同意。文中使用侧流免疫层析测定(Premier Biotech)检测血清中的SARS-CoV-2特异性抗体。在试验场地半径15英里(24公里)范围内的加州洛杉矶县的居民有资格参加测试。参与者于2020年4月10日和11日在6个地点接受测试;无法到达测试地点的参与者于2020年4月13日和14日接受家庭测试。 本次测试使用了一个由研究公司LRW集团维护的代表该县的专有数据库来选择参与者。邀请了这些居民进行随机抽样,根据洛杉矶县居民的年龄、性别、种族和种族分布,为亚组分配参与者名额。每个家庭只能有一个成年人参加。每个测试至少由两名研究人员审查。 测试利用这些数据来估计SARS-CoV-2抗体的人群阳性率。为使计算的权重与2018年人口普查中的性别、种族/民族和收入相匹配,调整了阳性结果的加权和未加权比例,以确保测试的准确性。未加权数据的95%置信区间用精确二项模型估计,加权和调整结果估计用bootstrap方法估计,使用Stata 16进行结果分析。 结果表明,1952名受邀参加抗体检测的人中,1702人(87.2%)表示同意并有865人(50.9%)接受检测。由于试剂盒故障,两个测试结果不确定,并从分析样品中移除。在863名成年人中,60%为女性,55%为35至54岁,58%为白人,43%的家庭年收入超过100000美元。13%的人发烧伴咳嗽,9%的人发烧伴呼吸急促,6%的人失去嗅觉或味觉。35人(4.06%[精确二项CI,2.84%-5.60%])呈阳性。阳性率因种族、性别和收入水平而异。阳性者的加权比例为4.31%(bootstrap-CI, 2.59%-6.24%)。经检测灵敏度和特异性校正后,SARS-CoV-2抗体的未加权和加权阳性率分别为4.34%(bootstrap-CI,2.76%-6.07%)和4.65%(bootstrap-CI,2.52%-7.07%)。 文章讨论:在本次洛杉矶县社区血清流行病学调查中,SARS-CoV-2抗体的检出率为4.65%。这一估计意味着大约367?000名成年人携带了SARS-CoV-2抗体,大大超过了4月10日该县8430例累计确诊感染人数。因此,基于确诊病例的死亡率可能高于基于感染人数的死亡率。此外,限制感染传播的接触追踪方法也将面临相当大的挑战。同时,文章提出这项研究有局限性,可能存在选择偏差。估计的检出率可能因无反应或有症状的人更可能愿意参与而有偏差。随着准确度更高的试剂盒出现,这一概率估计会发生变化。此外,研究仅限于1个县。在其他地方进行血清学检测将有助于追踪疫情的进展。 4.附件: 原文链接 https://jamanetwork.com/journals/jama/fullarticle/2766367?resultClick=1