1.时间:2020年1月28日
2.机构或团队:香港大学
3.事件概要:
香港大学微生物系袁国勇教授团队1月28日在Emerging Microbes & Infections 上发表论文“Genomic characterization of the 2019 novel human-pathogenic coronavirus isolated from a patient with atypical pneumonia after visiting Wuhan”。分析了一名从一名患者中分离的2019-nCoV完整基因组,并将其与相关βCoVs的基因组进行了比较。该患者是武汉旅行史的深圳家庭的2019-nCoV感染家族中的一位,该团队稍早于1月24日在《柳叶刀》上发表对该家族集的研究论文。
分析发现,2019-nCoV的基因组与蝙蝠SARS样病毒ZXC21具有89%的核苷酸一致性,与人类SARS-CoV的具有82%的核苷酸一致性。其orf1a / b编码蛋白、刺突蛋白 、包膜蛋白、膜蛋白和核蛋白的系统发育树与与蝙蝠、果子狸的和人类SARS冠状病毒紧密聚集。
但是,2019-nCoV刺突蛋白的受体结合域的外部亚结构域与其它SARS相关冠状病毒的氨基酸一致性仅为40%。值得注意的是,其orf3b编码一个全新的短蛋白。此外,2019-nCoV 新型orf8可能编码带有α螺旋和含有6条链的β折叠的分泌蛋白。2019-nCoV具有独特的基因组特征等,为进一步研究发病机理,优化针对这种新发感染的诊断,抗病毒和疫苗接种策略的设计提供了基础。