《3月7日_SARS-CoV-2刺突糖蛋白与ACE2相互作用的模拟研究以及与SARS-CoV的相似性、热点分析及受体多态性的影响》

  • 来源专题:COVID-19科研动态监测
  • 编译者: zhangmin
  • 发布时间:2020-03-09
  • 1.时间:2020年3月7日

    2.机构或团队:南非兰德大学分子生物科学学院悉尼布伦纳分院生物科学研究所、突尼斯埃尔马纳尔大学

    3.事件概要:

    南非和突尼斯的研究人员在bioRxiv预印版平台发表论文“In silico study of the spike protein from SARS-CoV-2 interaction with ACE2: similarity with SARS-CoV, hot-spot analysis and effect of the receptor polymorphism”,文章深入探讨了不同冠状病毒分离株的刺突糖蛋白受体结合区域(RBD)与宿主ACE2蛋白的相互作用。

    文章中使用基于同源性的蛋白质-蛋白质对接、结合能估计和分解,旨在预测相互作用的定性和定量方面。通过计算机模拟结构建模提供了其他证据,证明刺突糖蛋白RBD的界面片段可能是由SARS-CoV-2通过复杂的进化过程而不是积累获得的。作者还强调了SARS-CoV-2 RBD的Q493和P499氨基酸残基与hACE2结合和维持界面稳定性的相关性。最后,文章中研究了位于ACE2相互作用表面的8个不同变体对SARS-CoV-2 RBD复合物形成的影响。发现它们都不可能破坏SARS-CoV-2病毒RBD的相互作用。

    *注,本文为预印本论文手稿,是未经同行评审的初步报告,其观点仅供科研同行交流,并不是结论性内容,请使用者谨慎使用。

    4.附件:

    原文链接:https://www.biorxiv.org/content/10.1101/2020.03.04.976027v1

  • 原文来源:https://www.biorxiv.org/content/10.1101/2020.03.04.976027v1
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    • 编译者:xuwenwhlib
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    • 信息名称:意大利和法国科学家团队基于in silico分析研究ACE2基因多态性和SARS-CoV-2感染的个体易感性 1.时间:2020年4月24日 2.机构或团队:意大利萨伦托大学、法国国家与健康医学研究院(INSERM)、法国尼斯大学、巴黎大学 3.事件概要: 4月24日,bioRxiv发表了题为“ACE2 polymorphisms and individual susceptibility to SARS-CoV-2 infection: insights from an in silico study”的文章。 目前COVID-19的流行似乎受到种族、地理和性别相关因素的影响,这些因素可能涉及对疾病的遗传易感性。与SARS-CoV相似,SARS-CoV-2利用血管紧张素转换酶2(ACE2)作为受体入侵细胞,尤其是肺泡上皮细胞II型。重要的是,ACE2基因具有高度多态性。在这个文章里,作者利用in silico方法分析了ACE2单核苷酸多态性(SNPs)对SARS-CoV-2棘突糖蛋白相互作用的可能影响。结果发现,世界上分布最广的两种SNP—S19P(在非洲人群中常见)和K26R(在欧洲人群中常见)是能够潜在影响ACE2与SARS-CoV-2相互作用的仅有的两种SNP。FireDock模拟表明,S19P可能降低、K26R可能增加ACE2对SARS-CoV-2的亲和力。这一发现表明,S19P可能具有遗传保护作用,K26R可能易患更严重的SARS-CoV-2疾病。 *注,本文为预印本论文手稿,是未经同行评审的初步报告,其观点仅供科研同行交流,并不是结论性内容,请使用者谨慎使用。 4.附件: 原文链接 https://www.biorxiv.org/content/10.1101/2020.04.23.057042v1