《通过免疫信息学表征SARS-CoV-2刺突蛋白,用于基于抗原表位的多价肽疫苗的优化》

  • 来源专题:生物安全知识资源中心 | 领域情报网
  • 编译者: hujm
  • 发布时间:2020-05-05
  • 巴基斯坦真纳大学国家生物信息学中心的科研人员在bioRxiv预印本平台发表题为“Immuno-informatics Characterization SARS-CoV-2 Spike Glycoprotein for Prioritization of Epitope based Multivalent Peptide Vaccine”的文章。

    文章指出,SARS-CoV-2刺突糖蛋白是疫苗、抗体和抑制剂开发的候选靶标,因为它在附着、融合和进入宿主细胞中发挥了许多作用。该研究中,研究人员通过免疫信息学技术表征了SARS-CoV-2刺突糖蛋白,提出了潜在的B和T细胞表位,然后利用表位构建多表位肽疫苗结构体(multi-epitope peptide vaccine construct , MEPVC)。MEPVC显示了强大的宿主免疫系统模拟与高产量的免疫球蛋白、细胞因子和白介素。观察到具有代表性的天然免疫TLR3受体的MEPVC稳定构象,涉及强疏水和亲水化学相互作用,以及盐桥对分子间稳定性的增强。溶液中的分子动力学模拟进一步解释了MEPVC对TLR3的强亲和力。如径向分布函数和新型分析工具轴向频率分布所示,这种稳定性是TLR3和MEPVC都含有一些重要残留物的属性。最后提供了综合的结合自由能估计值,得出静电的主要作用和范德华力的次要作用的结论。总而言之,设计的MEPVC具有针对COVID-19提供免疫保护的巨大潜力,因此在实验研究中需要得到更多关注。

    *注,本文为预印本论文手稿,是未经同行评审的初步报告,其观点仅供科研同行交流,并不是结论性内容,请使用者谨慎使用。

  • 原文来源:https://www.biorxiv.org/content/10.1101/2020.04.05.026005v1
相关报告
  • 《4月12日_通过免疫信息学表征SARS-CoV-2刺突蛋白,用于基于抗原表位的多价肽疫苗的优化》

    • 来源专题:COVID-19科研动态监测
    • 编译者:zhangmin
    • 发布时间:2020-04-14
    • 1.时间:2020年4月12日 2.机构或团队:巴基斯坦真纳大学 3.事件概要: 巴基斯坦真纳大学国家生物信息学中心的科研人员在bioRxiv预印本平台发表题为“Immuno-informatics Characterization SARS-CoV-2 Spike Glycoprotein for Prioritization of Epitope based Multivalent Peptide Vaccine”的文章。 文章指出,SARS-CoV-2刺突糖蛋白是疫苗、抗体和抑制剂开发的候选靶标,因为它在附着、融合和进入宿主细胞中发挥了许多作用。该研究中,研究人员通过免疫信息学技术表征了SARS-CoV-2刺突糖蛋白,提出了潜在的B和T细胞表位,然后利用表位构建多表位肽疫苗结构体(multi-epitope peptide vaccine construct , MEPVC)。MEPVC显示了强大的宿主免疫系统模拟与高产量的免疫球蛋白、细胞因子和白介素。观察到具有代表性的天然免疫TLR3受体的MEPVC稳定构象,涉及强疏水和亲水化学相互作用,以及盐桥对分子间稳定性的增强。溶液中的分子动力学模拟进一步解释了MEPVC对TLR3的强亲和力。如径向分布函数和新型分析工具轴向频率分布所示,这种稳定性是TLR3和MEPVC都含有一些重要残留物的属性。最后提供了综合的结合自由能估计值,得出静电的主要作用和范德华力的次要作用的结论。总而言之,设计的MEPVC具有针对COVID-19提供免疫保护的巨大潜力,因此在实验研究中需要得到更多关注。 *注,本文为预印本论文手稿,是未经同行评审的初步报告,其观点仅供科研同行交流,并不是结论性内容,请使用者谨慎使用。 4.附件: 原文链接:https://www.biorxiv.org/content/10.1101/2020.04.05.026005v1
  • 《使用免疫信息学方法进行新型冠状病毒2019(SARS-COV-2)抗原表位肽疫苗的研制 》

    • 来源专题:生物安全知识资源中心 | 领域情报网
    • 编译者:hujm
    • 发布时间:2020-03-05
    • 韩国和印度的研究人员在Journal of Medical Virology在线发表论文“Development of epitope‐based peptide vaccine against novel Coronavirus 2019 (SARS‐COV‐2): Immunoinformatics approach”,使用免疫信息学方法进行新型冠状病毒2019(SARS-COV-2)抗原表位肽疫苗的研制。研究人员对刺突糖蛋白进行了表征以获得免疫原性表位。选择了13种具有抗原特性的MHC-I和3种MHC-II表位。这些表位通常与特定的接头连接以构建疫苗成分,并在TLR-5上进行分子对接以获得结合亲和力。为了提供这些表位的快速免疫原性谱,研究中采用免疫信息学进行分析,以便疫苗的快速开发。