《5月20日_复旦大学分析与COVID-19临床结局相关的病毒和宿主因素》

  • 来源专题:COVID-19科研动态监测
  • 编译者: xuwenwhlib
  • 发布时间:2020-05-21
  • 信息名称:复旦大学分析与COVID-19临床结局相关的病毒和宿主因素
    1.时间:2020年5月20日
    2.机构或团队:复旦大学、上海交通大学、中国科学院上海生命科学研究院
    3.事件概要:
    复旦大学联合多家机构在Nature发表论文“Viral and host factors related to the clinical outcome of COVID-19”。
    在COVID-19大流行中,我们需要深入了解其流行病学、传播性和发病机制以有效解决公共卫生问题和治疗措施。文章对上海市326例新冠肺炎确诊病例的临床、分子和免疫学资料进行了分析。112个高质量样本的SARS-CoV-2基因组序列与全球流感数据共享计划(GISAID)中的序列一致显示了其稳定的进化,并表明在武汉疫情早期阶段存在两种不同暴露史的谱系,然而,他们表现出相似的毒性和临床结果。淋巴细胞减少症,尤其是入院后CD4+和CD8+ T细胞计数减少,是疾病进展的预测因素。重症和危重症患者治疗期间IL-6和IL-8水平升高与淋巴细胞计数下降相关。COVID-19疾病严重程度主要决定于宿主因素,如年龄、淋巴细胞减少及其相关的细胞因子风暴,而病毒遗传变异并不显著影响病程。
    4.附件:
    原文链接:https://www.nature.com/articles/s41586-020-2355-0

  • 原文来源:https://www.nature.com/articles/s41586-020-2355-0
相关报告
  • 《复旦大学分析与COVID-19临床结局相关的病毒和宿主因素》

    • 来源专题:生物安全知识资源中心 | 领域情报网
    • 编译者:hujm
    • 发布时间:2020-05-28
    • 复旦大学联合多家机构在Nature发表论文“Viral and host factors related to the clinical outcome of COVID-19”。 在COVID-19大流行中,我们需要深入了解其流行病学、传播性和发病机制以有效解决公共卫生问题和治疗措施。文章对上海市326例新冠肺炎确诊病例的临床、分子和免疫学资料进行了分析。112个高质量样本的SARS-CoV-2基因组序列与全球流感数据共享计划(GISAID)中的序列一致显示了其稳定的进化,并表明在武汉疫情早期阶段存在两种不同暴露史的谱系,然而,他们表现出相似的毒性和临床结果。淋巴细胞减少症,尤其是入院后CD4+和CD8+ T细胞计数减少,是疾病进展的预测因素。重症和危重症患者治疗期间IL-6和IL-8水平升高与淋巴细胞计数下降相关。COVID-19疾病严重程度主要决定于宿主因素,如年龄、淋巴细胞减少及其相关的细胞因子风暴,而病毒遗传变异并不显著影响病程。
  • 《与COVID-19预后相关的病毒和宿主因素》

    • 来源专题:实验室生物安全
    • 编译者:张虎
    • 发布时间:2020-05-28
    • 1.研究者首先纳入了上海地区326例患者分为四组,分别为5例无症状患者,293例轻症患者,12例重症和16例需要ECMO治疗的危重症患者。最终315例出院,6例死亡。接下来对其中112例的痰或口咽拭子病毒基因组测序,在9个蛋白编码区发现66个同义和103个错义突变,f ORF1ab, S, ORF3a, E, M 和 ORF7a突变率相似,但ORF8和N突变率更高。通过上海94例样本基因组数据与GISAID数据库中221调序列进行系统发育分析,研究者发现上海病毒来源于两个主要分枝及其亚分枝。但在上海病例中未发现进一步的分枝及亚分枝。 2. 接下来研究者将有6例与华南海鲜市场有直接接触史的患者归类为分枝I,而在同一时期诊断无该市场接触史的患者分类为分枝II,将两组患者nt8,782和nt28,144位点与蝙蝠Bat-SARS-CoV-RaTG13进行比较分析,发现只有分枝II与Bat-SARS-CoV-RaTG13的这两个位点相同。两组不同病毒分枝临床表现无差异,意味着基因组发生变异的病毒仍然具有相同的致病过程。并且13个突变频率最高的位点与疾病严重程度没有相关性。 3. 随后研究者分析了与疾病严重程度相关的宿主因素。研究者集中分析了免疫相关和生化指标,发现COVID-19患者普遍存在低淋巴细胞血症尤其是在重症和危重症分组中显著降低。其中CD3+T细胞的影响最为显著,CD4+和CD8+T细胞有同样的改变趋势。但是CD19+B细胞仅在危重症患者中有明显降低,而在无症状、轻症以及危重症患者中无明显改变。研究者进一步对淋巴细胞的纵向变化进行分析,发现CD3+T细胞水平随疾病恶化和进展逐级下降,同样可见于CD4+和CD8+T细胞,但NK细胞无此相关性。 4.患者基本临床信息分析后得出入院时淋巴细胞计数、存在合并症、性别是重症主要相关因素。多因素分析发现年龄和低淋巴细胞血症是重症的主要独立危险因素,但合并症不是。细胞因子数据中IL-6和IL-8变化最为显著,并与淋巴细胞计数呈负相关。在重症患者中IL-6和IL-8水平随时间变化有显著增加,表明炎性细胞因子与SARS-CoV-2感染的发病机制之间存在很强的联系。