《Angew. Chem.:上海药物所发现点击化学操控新策略》

  • 来源专题:生物安全知识资源中心 | 领域情报网
  • 编译者: hujm
  • 发布时间:2020-07-29
  • 2020年7月22日,中国科学院上海药物研究所黄蔚课题组和杨伟波课题组在Angew. Chem. Int. Ed.上发表了题为“Manipulating the click reactivity of dibenzoazacyclooctynes: from an azide cliker to a caged acylation reagent.”的文章,报道了点击化学试剂二苯并氮杂环辛炔(DBCO)的银催化重排和转酰胺反应,通过其“笼缚”酰化反应性,实现蛋白/糖蛋白修饰和抗体定点偶联。

      叠氮-炔环加成反应的点击化学,被广泛应用于有机化学、药物化学、化学生物学、分子生物学、细胞生物学等多学科领域。铜催化叠氮-炔点击化学反应是一类高效的生物正交反应,但铜催化体系在生物体系中具有较差的生物相容性。环张力炔基如DBCO、BCN等可以在无铜催化的温和条件下实现叠氮-炔基的环加成,极大地促进了点击化学在活生物体系中的应用。

      上海药物所黄蔚研究员和杨伟波研究员合作,发现环张力炔基DBCO结构可以在酸性条件下重排丧失其点击化学反应活性。通过研究进一步发现,银试剂AgNTf2或AgOAc可以在中性条件下促进DBCO快速重排生成四环产物,并且当反应体系有胺类化合物时,会发生转酰胺反应,形成新的酰胺产物。在此过程中,银试剂催化转酰胺反应具有“笼缚”酰化试剂属性:无催化剂条件下其酰化活性“束缚”在DBCO“笼状”结构中,而在银催化下从“笼”中释放其酰化能力。在与叠氮基团的竞争反应中,银试剂催化转酰胺反应效率远高于叠氮点击化学反应,酰化产物产率高达95%。

      研究团队选择了不同的含有氨基的小分子化合物、多肽、糖肽、蛋白、糖蛋白等,对该反应进行了底物反应活性和选择性的探索(图2)。研究发现,银催化条件下,DBCO可以快速的酰化氨基官能团;针对三种包含20种天然氨基酸的多肽底物的研究发现,DBCO酰化反应高选择性地发生在Lys的氨基上,而不影响其他氨基酸。同时,银催化DBCO酰化反应可以高效地修饰糖肽、BSA蛋白、糖蛋白RNase B 和IgG抗体等,表现出较好的底物适用性。此外,银催化酰化反应可以实现Ph.D.12商业噬菌体库的修饰且不影响噬菌体侵染活力,说明该方法具有应用于活生物体系中的潜力。

      该研究团队还设计了一种DBCO标记的抗体Fc靶向肽,实现了抗体上特定Lys的定点酰化修饰(图3)。利用靶向肽与抗体Fc的亲和力,将其DBCO标记基团运输到K249附近,在此过程中,DBCO的酰化活性处于“笼缚”状态而不会与抗体发生随机偶联。而在银催化下,DBCO重排,相应酰基选择性地修饰Fc区域的K249,高效实现了抗体的定点偶联,为定点抗体药物偶联物的设计提供了新的方法与思路。

      综上所述,银催化下DBCO重排酰化反应,改变了DBCO的点击化学反应性,从一个叠氮点击反应试剂,转变为高效、温和、可控的“笼缚”酰化试剂,且具有很好的生物兼容性,可以应用于多肽、糖肽、蛋白、糖蛋白、噬菌体等多种生物活性底物。此外,DBCO标记的Fc结合肽可以选择性地酰化抗体上的特定Lys,实现抗体的定点偶联。该方法在化学生物学领域具有广泛的应用前景,可以用于配体导向的靶蛋白定点修饰、配体-受体共价捕获、相互作用蛋白-蛋白交联等。

      黄蔚课题组一直从事蛋白糖基化调控与修饰(Nat. Protoco. 2017, 1702; Org. Biomol. Chem. 2016, 9501; J. Am. Chem. Soc. 2012, 12308)、细胞表面糖链编辑(Nat. Chem. Biol. 2020, doi.org/10.1038/s41589-020-0551-8)、糖结构药物(Angew. Chem. Int. Ed. 2019, 6678; J. Med. Chem. 2018, 286)等方向研究;杨伟波课题组聚焦天然产物启发的大环库构建新方法学研究,包括过渡金属催化碳氢活化、卡宾偶联以及重排等。黄蔚课题组博士生施伟和博士后唐峰为文章共同第一作者,黄蔚研究员和杨伟波研究员为共同通讯作者。药物所黄河课题组团队在抗体定点偶联的位点鉴定中给予了技术支持,黄蔚课题组毕业研究生敖继炜和郁群在项目早期酸催化DBCO重排工作中作出了重要贡献,为文章合作作者。该项目获得了国家自然科学基金、国家“重大新药创制”专项等项目资助。

  • 原文来源:https://onlinelibrary.wiley.com/doi/abs/10.1002/anie.202009408;http://www.simm.ac.cn/xwzx/kydt/202007/t20200724_5645344.html
相关报告
  • 《Angew. Chem.:上海药物所糖肽合成取得新突破》

    • 来源专题:生物安全知识资源中心 | 领域情报网
    • 编译者:hujm
    • 发布时间:2020-09-16
    • 糖肽是一类寡糖与多肽相结合的大分子化合物。糖肽在糖类药物研发如糖肽类抗生素和抗肿瘤疫苗的研发中有着十分重要的应用。经过几十年的发展,多肽的合成技术目前已经十分成熟,寡糖的合成在最近几年也取得了很重要的进展。然而关于糖肽的合成,却仍然是一个极具挑战的难题。   2020年8月31日,Angew.Chem.Int.Ed.杂志在线发表了中国科学院上海药物研究所文留青课题组与南方科技大学王鹏教授合作完成的题为“Machine Driven Chemoenzymatic Synthesis of Glycopeptide”的通讯论文。该研究首次报道了利用商业化的多肽合成仪和化学酶法合成策略合成带有复杂寡糖结构的糖肽(Proof of Concept)。   在本项研究中,作者通过筛选大量可用于固相合成的固相载体,最终发现了一种表面被氨基化的硅球,它可以同时被用作有机相的肽链合成与水相寡糖合成(酶反应)。这种硅球仅表面具有氨基基团,因此作者设计了可断裂的linker将硅球树脂与起始氨基酸相连接。虽然这种硅球树脂装载效率比常用的多肽合成的固相树脂低,但可以同时支持有机相中进行的多肽合成反应与水相中进行的酶催化反应。基于此,研究人员结合商业化的多肽合成仪开发出了包含两相反应的体系,用于糖肽合成的技术平台。将装载有初始氨基酸的树脂预先加入到反应釜中,然后合成仪自动将下一个氨基酸与缩合试剂(脱保护试剂)加入反应釜中,反应完成后加压过滤其余试剂,即完成一个循环。通过设置反应程序,可以使对应的氨基酸依次进行循环反应,在多个循环后就可得到目标肽链。之后系统切换为水相,将不同的糖基转移酶与对应的糖核苷依次进行同样的循环反应(反应温度为37 ℃),经过多个循环后就可以得到目标糖肽,然后将糖肽从树脂上洗脱。该糖肽合成平台简单易操作,基于商业化的多肽合成仪实现了13种复杂糖肽(10种肿瘤标志物MUC1糖肽与三种HIV糖肽)的半自动合成。   上海药物所文留青研究员与南方科技大学王鹏教授为论文共同通讯作者;张家斌博士和刘鼎博士为论文共同第一作者。该项目由美国NIH Common Fund Glycoscience program和上海药物所人才启动经费支持完成。   文留青课题组长期从事寡糖以及糖缀合物的合成(Angew.Chem.Int.Ed. 2015, 54, 12654.;ACS.Catal.2016, 6, 1649.;Chem.Rev.2018,118, 17,8151;Angew.Chem.Int.Ed.2018,57,16638.),以及利用化学生物学手段对细胞表面寡糖的进行标记,研究寡糖与疾病的关系(J.Am.Chem.Soc.2016, 138, 11473.;ACS Centra. Sci, 2018, 4, 451.;ACS Catal. 2018, 8 (8), 7659)。并在此基础上从事寡糖新药研究和药物靶点发现。
  • 《Cell Metab︱上海药物所发现降胆固醇和甘油三酯候选药物并开展作用机制和新靶点发现研究》

    • 来源专题:生物安全知识资源中心—领域情报网
    • 编译者:hujm
    • 发布时间:2022-04-19
    • 心血管疾病是目前全球第一大疾病死亡原因,而高胆固醇引起的血脂异常是导致心血管疾病死亡的重大风险之一。他汀类药物是高血脂的一线治疗药物,但是15%的患者存在他汀不耐受或者他汀降脂效果不佳等临床缺陷。因此,开发高效安全的高血脂治疗药物具有重要的研究意义。 2022年4月14日,中国科学院上海药物研究所柳红课题组和黄河课题组合作在Cell Metabolism上发表了文章“Identification and evaluation of a lipid-lowering small compound in preclinical models and in a Phase I trial”,在发现降血脂候选药物并开展作用机制和新靶点发现研究方面取得重要进展。 柳红课题组、王逸平课题组和蒋华良课题组合作,前期通过多轮结构改造和成药性优化,开发获得具有我国自主知识产权的降脂候选药物DC371739(一类新药)。候选药物DC371739可剂量依赖地降低金黄地鼠血清中TC、LDL-C和TG水平,起效剂量仅为10 mg/kg;在自发性高血脂恒河猴动物模型中,DC371739可剂量依赖地降低血清中TC和LDL-C水平,起效剂量仅为3 mg/kg。基于DC371739良好的体内外降脂作用和优良的药代动力学特性和安全性,该项目于2020年7月获得临床批件。2020年9月入组首例病人,开展I期临床研究。I期临床研究结果表明,DC371739在健康受试者和高血脂患者体内均具有良好的安全性、耐受性和药代动力学特性。高血脂患者临床研究结果表明,DC371739口服给予40毫克剂量组可降低高血脂患者体内的TC和LDL-C水平。   柳红课题组和黄河课题组合作开展了候选药物DC371739的降脂作用机制研究。相关研究结果表明,候选药物DC371739与天然产物小檗碱、单克隆抗体类PCSK9抑制剂的作用机制截然不同,并不直接作用于PCSK9,对LDLR的mRNA也无影响,而是通过抑制转录因子HNF-1α,剂量依赖地降低PCSK9和ANGPTL3的mRNA水平。研究人员通过设计化学探针和定点突变实验,明确了DC371739与HNF-1α的结合位点和作用模式。DC371739通过与HNF-1α结合抑制其转录功能,降低PCSK9和ANGPTL3的转录水平,下调了PCSK9蛋白和ANGPTL3蛋白表达,进而增加了LDLR蛋白表达和LPL活性,促进循环中LDL-C和TG的清除,从而发挥降脂作用。   他汀类药物在临床使用过程中会增加PCSK9蛋白表达影响其降脂活性。基于DC371739独特的降脂作用机制,研究人员设计了DC371739与阿托伐他汀钙进行联合用药的治疗方案。研究结果表明,候选药物DC371739可下调由阿托伐他汀钙诱导增加的HepG2细胞中PCSK9蛋白表达,进一步增加LDLR蛋白表达水平。DC371739与阿托伐他汀钙联合用药,可进一步降低高血脂大鼠的TC、TG和LDL-C水平。 研究人员首次发现高血脂治疗潜在新靶标HNF-1α,并揭示了降脂候选药物DC371739独特的作用新机制,发现了其临床疗效监控生物标志物PCSK9和ANGPTL3,为高血脂症个性化临床研究奠定基础。另外,研究人员根据其独特的降脂作用机制提出DC371739与阿托伐他汀钙联合用药方案,为他汀不耐受或者他汀治疗效果不佳的患者提供了治疗的潜在新策略。   上海药物所的王江、严聪和席聪以及南京中医药大学的赵晶为该研究论文共同第一作者。上海药物所柳红研究员和黄河研究员为该研究论文的共同通讯作者。该研究获得了国家自然科学基金、临港实验室重点项目、上海市科委基金以及广州嘉越医药科技有限公司的资助。 原文链接:https://www.cell.com/cell-metabolism/fulltext/S1550-4131(22)00094-8