《益生菌作用方式比我们想象的更复杂!PNAS揭秘良好的肠道环境从哪里来》

  • 来源专题:中国科学院病毒学领域知识资源中心
  • 编译者: malili
  • 发布时间:2021-02-19
  • 北卡罗莱纳州立大学的一项新研究表明,益生菌乳杆菌(Lactobacillus)利用酶调控胆汁酸,促进其自身在肠道中的存活。这些发现进一步阐明了胆汁酸和肠道细菌之间的复杂关系,最终将有助于研究人员设计具有治疗特性的益生菌,帮助塑造更健康的人类肠道环境。

    这一研究发现公布在PNAS杂志上。

    胆汁酸是消化系统和肠道整体健康的关键因素,这些酸是在肝脏中产生并在我们进食后释放的,它们不仅可以分解胆固醇,帮助调节脂肪的吸收,而且还对肠道中定居的细菌类型产生巨大影响。

    当胆汁酸通过肠道时,最初它们会通过添加氨基酸(通常是甘氨酸或牛磺酸)进行化学修饰,形成复杂的“共轭”胆汁酸库。一些肠道细菌具有称为胆汁酸水解酶(BSH)的酶,可以从胆汁酸中裂解或“解偶联”这些氨基酸,从而使细菌在通过结肠时进一步转化胆汁酸。这些转化影响胆汁酸的毒性,进而影响不同细菌在肠道中生存的能力。

    “之前我们认为像是乳杆菌这样的益生菌通过BSHs只是解离胆汁酸,使其毒性降低,细菌得以生存,”北卡罗来纳州立大学传染病学副教授Casey Theriot说, “但是现实要复杂得多:这些酶比我们想象的要特异性强得多。根据存在的BSH以及它作用的胆汁酸的不同,可以用不同的方式塑造肠胃,使其对细菌或病原体友好或者敌对。”

    “胆汁和细菌之间的相互作用极大地影响了它们在竞争激烈的环境中的生存或死亡。因此我们进一步调查了这种关系。”

    研究人员进行了体外和体内实验,确定BSH是如何以及是否降低了胆汁酸毒性。首先,他们研究了两种乳杆菌在不同胆汁酸存在下的生长情况,结果惊讶地发现,结合的甘氨酸或牛磺酸在给定胆汁酸的毒性方面起着重要作用。然后他们分离出BSH,并对其进行生化研究,分析它们是否对特定的胆汁盐具有或多或少的活性,以及??在胆汁酸存在下生长时,是否会影响乳杆菌的存活。

    研究发现,胆汁酸的毒性不仅仅取决于胆汁酸是结合在BSH上还是被解离了,这种关系还取决于胆汁酸的类型,所作用的细菌以及存在的BSH。

    “当我们改变了这些乳杆菌菌株的BSH组成时,它们对胆汁酸的耐受性和竞争适应性也随之改变,这些BSH酶具有多种特性。细菌会定期吸收和释放酶,有时它们会吸收有助于生存的酶(使胆汁酸的毒性降低),或者会吸收有害于竞争的酶。

    “因此,细菌,BSH和胆汁酸之间的关系并非一对一。这一新见解可以帮助我们制定新策略,通过延长有益微生物的寿命或防止病原体定殖来改善人类健康。”

    “如果将来我们要尝试设计肠道菌群,确实必须了解所有参与者,包括细菌,酶和胆汁酸及其情况关系。这项工作是朝着这个方向迈出的重要的第一步。”

    (生物通)

    原文标题:

    Lactobacillus Bile Salt Hydrolase Substrate Specificity Governs Bacterial Fitness and Host Colonization

相关报告
  • 《人体肠道研究质疑益生菌健康益处》

    • 来源专题:生物安全知识资源中心 | 领域情报网
    • 编译者:hujm
    • 发布时间:2018-09-14
    • 从巧克力和泡菜到洗手液和婴儿配方奶粉中都含有益生菌,数百万人购买益生菌补充剂以促进消化系统健康。但是新的研究表明它们可能没有我们想象的那么有效。研究人员通过对人体肠道内部进行的一系列实验表明,许多人的消化道阻止了标准益生菌成功定植它们。此外,服用益生菌来抵抗抗生素可以延缓正常肠道细菌和肠道基因表达恢复到幼稚状态。该研究于9月6日在Cell杂志上发表了两篇背靠背的论文。 “人们已经给益生菌提供了很多支持,尽管我们对它们的理解背后的文献是非常有争议的;我们想确定你在超市购买的益生菌是否会像他们应该的那样在胃肠道内定居。 ,以及这些益生菌是否对人类宿主产生任何影响,“资深作者,以色列魏茨曼科学研究所的免疫学家Eran Elinav说。“令人惊讶的是,我们看到很多健康的志愿者实际上都有抗药性,因为益生菌不能在他们的胃肠道中定植。这表明益生菌不应该普遍作为'一刀切'的补充剂。相反,他们可以根据每个人的需求量身定做。“ 虽然过去的研究调查了类似的问题,但他们都将患者的排泄物用作胃肠道微生物活动的代表。相反,Elinav,他的同事Eran Segal(Weizmann研究所的计算生物学家)和他们的团队由Niv Zmora,Jotham Suez,Gili Zilberman Schapira和Elinav实验室的Uria Mor带头,与胃肠病学主任Zamir Halpern合作。特拉维夫医疗中心直接测量肠道定植。 在第一项研究中,25名人类志愿者接受了上消化道内镜检查和结肠镜检查,以便在肠道区域对基线微生物组进行采样。然后将这些志愿者中的15人分成两组。第一组消费通用益生菌菌株,而第二组服用安慰剂。然后两组均接受第二轮上镜检查和结肠镜检查,以评估其内部反应,然后再进行2个月的随访。 科学家发现,益生菌成功地定殖了一些人的胃肠道,称为“持久性”,而“抵抗者”的肠道微生物群将他们驱逐出去。此外,持久性和抗性模式将决定给定人中的益生菌是否会影响其本地微生物组和人类基因表达。研究人员可以通过检查他们的基线微生物组和肠道基因表达谱来预测一个人是否会成为持有者或者抗体者。 他们还发现,粪便仅部分与体内微生物组功能相关,因此依赖粪便与以往研究多年来所做的一样,可能会产生误导。 “虽然我们所有消耗益生菌的志愿者都在他们的粪便中显示益生菌,但只有一些人在他们的肠道中显示它们,这是他们需要的地方,”西格尔说。“如果有些人抗拒并且只有一些人允许,我们所采取的标准益生菌的益处不能像我们曾经想象的那样普遍。这些结果突出了肠道微生物组在推动人们之间非常具体的临床差异方面的作用。 “ 在第二项研究中,研究人员质疑患者是否应该服用益生菌来对抗抗生素的作用,因为他们经常被告知这样做是为了在抗生素治疗清除后重新填充肠道微生物群。为了研究这一点,21名志愿者接受了抗生素疗程,然后被随机分配到三组中的一组。第一个是“观察和等待”组织,让他们的微生物组自行恢复。第二组给予与第一项研究中使用的相同的通用益生菌。第三组用自体粪便微生物组移植物(aFMT)治疗,该移植由他们自己的细菌组成,这些细菌在给予抗生素之前已被收集。 在抗生素清除后,标准益生菌很容易在第二组中的每个人的肠道中定殖,但令团队意外的是,这种益生菌定植阻止了宿主的正常微生物组和肠道基因表达谱恢复到正常状态数月之后。相比之下,aFMT导致第三组的天然肠道微生物组和基因程序在几天内恢复正常。 “与目前的益生菌无害并使每个人受益的教条相反,这些结果揭示了益生菌使用抗生素的新潜在不良副作用,甚至可能带来长期后果,”Elinav说。“相比之下,用自己的微生物补充肠道是一种个性化的母亲自然设计的治疗方法,可以完全逆转抗生素的作用。” 西格尔补充道,“这为诊断打开了大门,这将使我们从益生菌的经验普遍消费中获益,这种益生菌在许多情况下似乎无用,可以根据个人的基线特征为个人量身定制。 “
  • 《肠道细菌骇人听闻的密码:它们放电》

    • 来源专题:生物安全知识资源中心 | 领域情报网
    • 编译者:hujm
    • 发布时间:2018-09-14
    • 加州大学伯克利分校的科学家发现,单核细胞增多性李斯特菌(Listeria monocytogenes)可以利用与已知的发电细菌完全不同的技术制造电能,甚至许多人类肠道细菌也属于“放电细菌”,例如致病性的李斯特菌、产气荚膜梭菌(Clostridium perfringens)、粪肠球菌(Enterococcus faecalis)和致病性链球菌,以及广泛应用于酸奶发酵的乳酸杆菌(Lactobacilli)。 “许多与人类相互作用的细菌,无论是病原体还是益生菌,无论是与我们共生的微生物群还是参与人类产品发酵的工程菌,它们都产电,奇怪的是,过去我们竟然没有注意到,”分子和细胞生物学、植物和微生物学教授Dan Portnoy说。 这一发现对试图利用微生物制造活电池的科学家来说是个极好的消息,意味着,这种“绿色”生物能源技术可以将废物处理厂的细菌变废为宝。 9月12日《Nature》杂志在线发表了这篇文章。 会呼吸的金属 细菌生产电能跟我们呼吸氧气是一个道理:去除新陈代谢和能量供应过程中生产的电子。动物和植物将电子传递给线粒体内的氧气,在缺氧条件下,包括我们肠道内、酒精和奶酪发酵罐里的细菌必须找到其他电子受体,在地质环境中,电子受体通常是位于细胞外的铁或锰之类的矿物,从某种意义上,这些细菌“呼吸”铁或锰。 延伸阅读: 将电子从细胞内传递给矿物需要特殊的化学级联反应,所谓的细胞外电子转移链(extracellular electron transfer chain),这条链携带微弱的电流。一些科学家利用它制备生物电池,将电极放在含有细菌的烧杯里,你就可以发电。 新发现的细胞外电子转移系统实际上比已知的转移链更简单!但是,只有在必要时(也许是氧气水平较低时),细菌才会启动。 科学家们在具有单层细胞壁的细菌被归类为革兰氏阳性菌中发现了这种简单链,革兰氏阳性菌喜欢生活在含有大量微生物素B2衍生物(flavin)的环境中。 “看来,这些细菌的细胞结构和微生物富集生态位对高效能地向细胞外传递电子具有显著意义,”本文一作、博后学者Sam Light说。“因此,我们过去认为矿物呼吸细菌利用细胞外电子转移是为了生存,新研究表明,细菌都喜欢用它,因为它更‘省事儿’。” 为了测试该系统的稳健性,Light团队与劳伦斯-伯克利国家实验室的Caroline Ajo-Franklin合作,探索了活微生物与无机材料之间的相互作用——碳捕获和储存以及生物太阳能发电。 经测量,从细菌中流出的电流高达500微安,科学家们确认它确实是电性的。事实上,它们产生的电能大约为每秒100000个电子。 乳酸菌也具备该系统引起了人们的兴趣,乳酸菌被广泛用于生产奶酪、酸奶喝泡菜。他认为,也许电子传递对奶酪和泡菜的味道起了一定作用。“这是细菌生理学的一部分,一大片未知被揭晓了,而且这些细菌还可以被操纵,”Light说。 Light和Portnoy对这些细菌如何以及为什么产生了这样一个独特的系统感到好奇。首先它很简单——通过一层细胞壁传递电子比通过两层细胞壁传递电子更容易;其次是环境条件有利——直接利用环境中的flavin分子去除电子,如此一来,细菌似乎在富氧和贫氧环境下都能很好的生存。 原文检索:A flavin-based extracellular electron transfer mechanism in diverse Gram-positive bacteria