为了促进农艺学的可持续性，正在全球范围内进行广泛的研究，以研究生物肥料的开发。最近，已经认识到一些用作生物肥料的微生物表现为机会病原体，并且属于生物安全等级2（BSL-2）分类。这对环境和人类健康构成了严重的风险。在各种科学论坛上提出的证据越来越支持使用BSL-2微生物作为生物肥料的优点。在这篇综述中，我们强调基于传统微生物学方法和小的亚基rRNA基因序列/保守区的部分表征不足以表征生物肥料菌株。在此建议，开发用于商业化或环境释放的生物肥料的研究和工业实验室必须使用微生物系统学的多边多相方法表征目标微生物。在进行配方开发和环境应用之前，这将确定其风险类别和生物安全特征。还建议将属于危险组1和BSL-1类别的微生物用于制剂开发和现场应用。同时，应限制BSL-2微生物的研究使用符合严格法规的收容措施。
