《Lancet:北京近期未出现新的新冠病毒变异株》

  • 编译者: 蒋君
  • 发布时间:2024-08-23
  • 2023年2月8日,北京疾病预防控制中心的研究人员在Lancet上发表了题为“Characterisation of SARS-CoV-2 variants in Beijing during 2022: an epidemiological and phylogenetic analysis”的研究论文,利用流行病学和系统发育分析阐明了北京新冠病毒变异特征。

    研究人员收集了过去3年北京输入和本地病例的呼吸道样本,共获得2994个完整的新冠病毒基因组序列。2022年11月14日至12月20日期间采集到413个样本,包括350个本地病例和63个输入病例,在此期间BA.5.2和BF.7感染人数增加,占本地病例的90%。所有基因组都属于现有的123个PANGO遗传谱系(PANGO lineage),表明没有持久的显性变异或新的谱系。综上所述,自2022年11月14日以来,BF.7和BA.5.2在北京爆发,没有证据表明出现了新的变异株。由于频繁的人口流动和高传播性流行毒株的存在,这些结果可被认为是中国的一个缩影。

相关报告
  • 《CDC对新冠病毒JN.1 变异株的发展进行权衡》

    • 编译者:张玢
    • 发布时间:2023-11-27
    • 美国疾病控制和预防中心(CDC)在最近的一次呼吸道病毒更新中说,它正在监测 BA.2.86 和 JN.1 的传播情况,JN.1 是一种 SARS-CoV-2 变种,属于同一血统,含有一个额外的尖峰突变。科学家们一直在追踪 BA.2.86,因为它有许多突变,最近几周,他们发现 JN.1 是一种相关的变种,它有 L455S 突变,具有令人担忧的免疫逃避特性。在一些欧洲国家,一些人已经看到了这种病毒具有生长优势的迹象。美国疾病预防控制中心说,JN.1 于 9 月在美国被检测到,并在其他 11 个国家被发现。它补充说,目前在美国流行的几乎所有病毒都属于 XBB 家族,JN.1 只占 SARS-CoV-2 病毒的不到 0.1%。初步数据表明,更新的 COVID 疫苗将有助于预防 BA.2.86,预计对 JN.1 也有类似的效果。它还说,联邦政府 SARS-CoV-2 机构间小组的分析表明,治疗和检测仍将有效。
  • 《大流行冠状病毒的进化勾勒出从动物到人类的路径:病毒改变的能力使新的人类冠状病毒有可能出现——《每日科学》》

    • 来源专题:生物安全网络监测与评估
    • 编译者:yanyf@mail.las.ac.cn
    • 发布时间:2020-06-03
    • 一个研究SARS-CoV-2病毒起源的科学家小组发现,当SARS-CoV-2病毒获得感染人类细胞的能力时,它特别适合通过变形从动物转移到人类。SARS-CoV-2病毒是导致2019冠状病毒大流行的病毒。 杜克大学(Duke University)、洛斯阿拉莫斯国家实验室(Los Alamos National Laboratory)、德克萨斯大学埃尔帕索分校(University of Texas at El Paso)和纽约大学(New York University)的研究人员在进行基因分析时证实,这种病毒最接近的亲属是一种感染蝙蝠的冠状病毒。但这种病毒感染人类的能力是通过交换一种冠状病毒的关键基因片段而获得的,这种病毒感染一种名为穿山甲的有鳞哺乳动物,从而使这种病毒有可能感染人类。 研究人员报告说,这种从物种到物种的跳跃是病毒通过改变其遗传物质与宿主细胞结合的能力的结果。打个比方,这就像是病毒重组了钥匙,使其能够打开宿主细胞的门——在这个例子中是人类细胞。在SARS-CoV-2病例中,“关键”是在病毒表面发现的一种突起蛋白。冠状病毒利用这种蛋白质附着在细胞上并感染细胞。 “很像原来的非典,从蝙蝠果子狸,或即从蝙蝠到单峰骆驼骆驼,然后给人类,这个流行的祖冠状病毒进行了进化的遗传物质,使其最终感染人类,”冯说高,医学博士,教授,医学分部的杜克大学医学院传染病和该研究的通讯作者出版在线5月29日《科学》杂志上的进步。 高和他的同事说,追踪病毒的进化路径将有助于阻止未来由病毒引起的大流行,并可能指导疫苗研究。 研究人员发现,典型的穿山甲冠状病毒与SARS-CoV-2差异太大,无法直接导致人类大流行。 然而,它们确实含有受体结合位点——与细胞膜结合所必需的突起蛋白的一部分——这对人类感染很重要。这种结合位点使得附着在细胞表面的蛋白质成为可能,这种蛋白质在人类呼吸道和肠道上皮细胞、内皮细胞和肾细胞等细胞中大量存在。 尽管蝙蝠的病毒祖先是与SARS-CoV-2关系最密切的冠状病毒,但其结合位点非常不同,仅靠自身无法有效感染人类细胞。 SARS-CoV-2似乎是蝙蝠病毒和穿山甲病毒的混合,以获得人类感染所需的“关键”受体结合位点。 “有地区的病毒具有高度的相似性之间的氨基酸序列不同的冠状病毒感染人类,蝙蝠和穿山甲,表明这些病毒正在类似的主机选择和可能的祖先SARS-CoV-2能够很容易从这些动物给人类,”主要作者)说李从杜克大学。 “人们已经研究了我们在论文中讨论的从穿山甲中提取的冠状病毒序列,但是科学界对于它们是否在SARS-CoV-2的进化中发挥了作用仍然存在分歧,”该研究的联合首席作者、洛斯阿拉莫斯国家实验室的科学家Elena Giorgi说。 Giorgi说:“在我们的研究中,我们证明了SARS-CoV-2确实具有丰富的进化史,包括在蝙蝠和穿山甲冠状病毒获得转移到人类之前对遗传物质进行重组。”