《《Current Biology》混合真菌与COVID-19肺部感染有关》

  • 来源专题:中国科学院病毒学领域知识资源中心
  • 编译者: malili
  • 发布时间:2020-08-04
  • 这是第一次在医院里发现一种曲霉,侧曲霉(Aspergillus latus,A. latus),这种真菌比它的双亲更具耐药性,这非常危险,研究人员现在正在调查真菌在COVID-19中的作用。

    一个国际研究小组首次在医院环境中发现了一种以前只在土壤或植物中发现的真菌。研究小组对其基因组进行了测序,发现它实际上是一个杂交种,其抗药性比其来源的两个物种高出三倍。

    这项研究的一篇文章发表在《Current Biology》上,由来自巴西、美国、葡萄牙和比利时的研究人员共同撰写。

    曲菌病是一种由本属真菌引起的肺部疾病,特别是烟曲霉(A. fumigatus),广泛存在于植物和土壤中。所有的人类都会定期吸入曲霉菌孢子,在健康人身上通常不会引起症状。然而,在免疫系统较弱的患者中,霉菌可引起肺炎,在肺部形成真菌球(曲霉菌瘤),并扩散至侵袭性肺曲菌病,这是最严重的疾病形式。A. fumigatus是最常见的曲菌病,但其他物种也会引起这种情况,包括黄曲霉(A. flavus)、黑曲霉(A. niger)、构巢曲霉(A. nidulans)和土曲霉(A. terreus)。

    “在大约90%的病例中,曲霉菌感染是由烟曲霉引起的,但在一些人类遗传病中,构巢曲霉是更常见的原因。因此,研究人员收集了来自世界各地的临床材料,以观察这种物种在医院环境中发生的频率。

    “令人惊讶的是,十分之六的样本中含有一种以前从未被发现能感染人类的真菌,”巴西圣保罗大学教授Gustavo Henrique Goldman和共同负责这项研究的研究员范德堡大学的Antonis Rokas说。

    基因测序还显示,A. latus是两个相对远亲的物种的杂交种,包含两个亲本物种的完整DNA拷贝。其他研究小组进行的试验已经表明,与其亲旋转状孢曲霉(A.spinuosporus)和一个未知的四线梭菌近亲相比,A. latus对抗真菌药物的抗药性可能高达3倍。它还能更有效地对抗人体免疫细胞。

    “这种真菌通过杂交获得了显著的优势,”Goldman说。

    然而,他补充说,巴西目前很少有医院有资源进行基因测序,以便以超过属级的精确度鉴定污染患者的真菌。鉴别通常是通过显微镜下的形态学分析来实现的,这给误诊留下了空间。例如,在本次的取样中有的A. latus以前就标记为了A. nidulans。

    真菌与COVID-19

    医院环境中真菌的存在是疾病恶化甚至死亡的一个众所周知的因素。在与德国方面的研究人员的合作下,Goldman和他的团队正在收集COVID-19患者肺部的真菌样本,目的是研究这些微生物如何加重病情,作为制定避免和抗击感染策略的基础。

    Goldman说:“有几名COVID-19患者死于曲霉菌感染。目前,我们从欧洲死于COVID-19的患者身上分离出四种菌株,并将对它们的基因组进行测序,以确定该物种是否受到该病的青睐。”

    他正在寻找合作伙伴,以帮助在巴西收集材料,但样本分离程序需要严格的临床协议,该协议尚未在巴西使用,以确保卫生工作者和研究人员不会感染这种新型冠状病毒。

    伴随COVID-19和曲霉菌属真菌感染的病例证明了了解这些微生物的重要性。例如,烟曲霉在世界各地都有发现,并且能够在极端条件下生存,例如高达70℃的温度和缺乏营养。它甚至可以从水中提取食物。

    Goldman说:“我们现在发现了该属植物的另一个特征,那就是杂种的形成。”

    在最近发表的研究中,研究人员收集了10个真菌样本,这些样本主要是从过敏性支气管肺曲菌病和其他疾病患者身上采集的材料中发现的,这些疾病包括由损害免疫系统的基因功能障碍引起的慢性肉芽肿性疾病和慢性阻塞性肺病,包括慢性支气管炎和肺气肿。

    进化论

    A. latus是已知的第一种能导致人类疾病的杂交丝状真菌,这是酵母的一种相对常见的特性,例如念珠菌属的真菌,它会导致念珠菌病。另一个奇怪的特征是它是二倍体,即它的细胞包含两套染色体,与除卵细胞和精子细胞外的所有人类细胞相似。大多数真菌是单倍体,只有一套染色体。

    杂交种还保留了双亲物种的DNA,这表明这种融合是最近才发生的。在远古的杂交种或物种中,基因是在远古时代从同一祖先中分化出来的,在进化过程中,有些基因会丢失或改变位置。

    骡子是一个著名的杂交动物的例子。它们有63条染色体,混合了母马的64条和驴的62条。然而,A. latus的双亲遗传物质都被完整地保存下来。

    Goldman说:“另一个有意思的点是,它的两个亲本物种之间的遗传距离与智人和狐猴之间的遗传距离大致相同。”

    原文检索:Pathogenic Allodiploid Hybrids of Aspergillus Fungi

    (生物通:伍松)

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KG微生物和诊断业务领域的营销与产品管理副总裁,与同事、客户及临床合作伙伴共同为复杂的诊断问题提供解决方案。 参考文献 DHMOSH - Public Health Unit, "COVID-19: Differential Diagnosis and Co-infections", 23 June 2020. [Online]. Available: https://www.un.org/sites/un2.un.org/files/coronavirus_guidancecoinfections.pdf. [Accessed 07 April 2021]. M. Z. Tay, C. M. Poh, L. Rénia et al., "The trinity of COVID-19: Immunity, inflammation and intervention", Nat Rev Immunol, vol. 20, pp. 363-374, 2020. T. M. Rawson, R. C. Wilson and A. Holmes, "Understanding the role of bacterial and fungal infection in COVID-19", Clinical Microbiology and Infection, vol. 27, pp. 9-11, 2021. M. Ripa, L. Galli, A. Poli et al., "Secondary infections in patients hospitalized with COVID-19: incidence and predictive factors", vol. 27, no. 3, 2021. T. Bardi, V. Pintado, M. Gomez-Rojo et al., "Nosocomial infections associated to COVID-19 in the intensive care unit: clinical characteristics and outcome", Eur J Clin Microbiol Infect Dis, vol. 40, pp. 495-502, 2021. H. Zhang, Y. 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