《国际遗传工程和生物技术中心综合分析不同地理位置SARS-CoV-2的基因组》

  • 来源专题:生物安全知识资源中心 | 领域情报网
  • 编译者: hujm
  • 发布时间:2020-04-03
  • 国际遗传工程和生物技术中心于3月21日在bioRxiv上发表题为“Comparative analyses of SAR-CoV2 genomes from different geographical locations and other coronavirus family genomes reveals unique features potentially consequential to host-virus interaction and pathogenesis”的文章,对不同地理位置的SARS-CoV-2基因组进行了基于序列的综合分析,从而发现其独特的感染、传播力、毒力和免疫原性特征。
    文章指出,对基因组进行系统的基因水平突变分析发现了SARS-CoV-2基因组的几个独特特征,包括印度SARS-CoV-2病毒株中刺突表面糖蛋白(A930V(24351C>T))的独特突变。研究人员还使用计算方法预测了突变对刺突糖蛋白功能和稳定性的影响。为了进一步了解宿主对病毒感染的反应,研究人员预测抗病毒的宿主miRNA可能正在控制病毒致病性。研究揭示了9种可以潜在地靶向SARS-CoV-2基因的宿主miRNA,这9种miRNA在SARS和MERS基因组中没有靶标。hsa-miR-27b是唯一在印度SARS-CoV2基因组中具有靶标基因的独特miRNA。此外,研究人员还预测了基因组中的免疫表位。

  • 原文来源:https://www.biorxiv.org/content/10.1101/2020.03.21.001586v1
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    • 1.时间:2020年3月21日 2.机构或团队:国际遗传工程和生物技术中心(ICGEB) 3.事件概要: 国际遗传工程和生物技术中心于3月21日在bioRxiv上发表题为“Comparative analyses of SAR-CoV2 genomes from different geographical locations and other coronavirus family genomes reveals unique features potentially consequential to host-virus interaction and pathogenesis”的文章,对不同地理位置的SARS-CoV-2基因组进行了基于序列的综合分析,从而发现其独特的感染、传播力、毒力和免疫原性特征。 文章指出,对基因组进行系统的基因水平突变分析发现了SARS-CoV-2基因组的几个独特特征,包括印度SARS-CoV-2病毒株中刺突表面糖蛋白(A930V(24351C>T))的独特突变。研究人员还使用计算方法预测了突变对刺突糖蛋白功能和稳定性的影响。为了进一步了解宿主对病毒感染的反应,研究人员预测抗病毒的宿主miRNA可能正在控制病毒致病性。研究揭示了9种可以潜在地靶向SARS-CoV-2基因的宿主miRNA,这9种miRNA在SARS和MERS基因组中没有靶标。hsa-miR-27b是唯一在印度SARS-CoV2基因组中具有靶标基因的独特miRNA。此外,研究人员还预测了基因组中的免疫表位。 4.附件: 原文链接:https://www.biorxiv.org/content/10.1101/2020.03.21.001586v1
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