Virus Evolution 期刊于5月14日出版了香港大学李嘉诚医学院的文章“Multivariate analyses of codon usage of SARS-CoV-2 and other betacoronaviruses”。
文章指出，病毒基因的密码子使用被认为在不同宿主环境中会经受不同的选择压力。先前有关甲型流感病毒密码子使用的研究有助于确定病毒宿主的起源和进化趋势，但是，缺乏关于冠状病毒的类似研究。在这项研究中，研究人员使用全局对应分析、组内对应分析和组间对应分析比较了密码子使用偏倚。研究人员发现蝙蝠RaTG13病毒与SARS-CoV-2在orf1ab、刺突和核衣壳基因中的总体密码子使用模式最匹配，而穿山甲P1E病毒在膜基因中具有更相似的密码子使用方式。通常发现SARS-CoV-2的氨基酸使用模式类似于蝙蝠和人的SARS-CoV相关病毒。然而，研究人员发现在SARS-CoV-2及其系统亲缘关系上，在刺突和膜基因上存在更大的同义密码子用法差异，这表明SARS-CoV-2的这两个基因受到不同的进化压力。
