国家重点研发计划由中央财政资金设立，面向世界科技前沿、面向经济主战场、面向国家重大需求，重点资助事关国计民生的农业、能源资源、生态环境、健康等领域中需要长期演进的重大社会公益性研究，事关产业核心竞争力、整体自主创新能力和国家安全的战略性、基础性、前瞻性重大科学问题、重大共性关键技术和产品研发，以及重大国际科技合作等，加强跨部门、跨行业、跨区域研发布局和协同创新，为国民经济和社会发展主要领域提供持续性的支撑和引领。
根据《国家重点研发计划管理暂行办法》，科技部牵头提出重大研发需求、总体任务布局及重点专项设置，编制发布年度项目申报指南，各机构进行项目申报经专家评审通过后，在科技部网站上进行立项公示。
据不完全统计，2016年以来，各平台上已公示的国家重点研发计划重点专项数68个，项目总数达4442个。
目前，各平台上已公示的科研院所牵头承担国家重点研发计划重点专项数67个，项目1330个。2016年以来，科研院所牵头承担的国家重点研发计划项目数量有所减少，2018年共计377个，相比2016年减少25个。2019年立项项目仍在持续发布中，科研院所现已发布的牵头承担项目有151个。
分析发现，共有198家科研院所牵头承担了国家重点研发计划项目，中国科学院牵头承担的项目数量最多，共有582个。其次为中国农业科学院、中国医学科学院。以下为牵头承担项目数超过10个的科研院所列表。
从重点专项角度看，科研院所牵头承担项目数量超过30个的重点专项有14个，“国家质量基础的共性技术研究与应用”专项立项的项目数量最多，有111个，其次是“重大自然灾害监测预警与防范”、“纳米科技专项”等。
因公示平台不一致，仅统计国家科技管理信息系统及部分专业机构已公开公示的数据。本文按照立项年份进行统计，项目数量相对启动年份（项目指南发布即为启动）稍有滞后。
